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2010 Fiscal Year Annual Research Report

赤外差スペクトル法によるイオン輸送蛋白質の分子機構解明

Research Project

Project/Area Number 22770159
Research InstitutionInstitute for Molecular Science

Principal Investigator

古谷 祐詞  分子科学研究所, 生命・錯体分子科学領域, 准教授 (80432285)

Keywords赤外分光法 / 時間分解計測 / 生体分子 / 蛋白質 / 生物物理
Research Abstract

界面を隔てた物質輸送・情報伝達を行う膜タンパク質は、方向性を持った構造変化を行うことで機能を発現している。しかしながら、計測手法の未整備から、それら膜タンパク質の構造変化の実態や、機能の発現との関連については不明な点が多い。本研究では、光受容タンパク質で活発に利用されている赤外差スペクトル法を、一般的なチャネルやポンプ等の膜タンパク質に適用する手法を開発し、タンパク質の構造変化と機能発現の分子機構の解明を目指す。具体的には以下の研究課題を提案する。(1)古細菌型ロドプシンの内部結合水の水素結合変化と機能との連関、(2)KcsAチャネルのpH依存的なチャネル開閉の分子機構、(3)V型ATPaseのNa^+イオン輸送とATP加水分解反応との連関。
平成22年度は以下のような成果を得た。1)光駆動プロトンポンプである古細菌型ロドプシンGloeobacter Rhodopsin(GR)に対して低温赤外分光計測を行った。光誘起構造変化および内部結合水を含む蛋白質内部の水素結合ネットワークの変化を明らかにし、古細菌型ロドプシンのプロトンポンプ活性と正の相関のある2400cm^<-1>以下の強い水素結合を形成した水分子がGRにも存在することがわかった(Hashimoto, et al. Biochemistry)。(2)Na^+ポンプであるV-ATPaseのKリングにおけるイオン脱着に伴う構造変化を全反射赤外分光法によって明らかにした(Furutani, et al. J. Am. Chem. Soc.)。3)全反射赤外分光法とストップトフロー法を組み合わせた実験装置を作製し、イオン輸送蛋白質とのイオン脱着に伴う構造変化計測の予備的な実験に成功した。

  • Research Products

    (24 results)

All 2011 2010

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (19 results)

  • [Journal Article] Sodium or Lithium Ion-Binding-Induced Structural Changes in the K-ring of V-ATPase from Enterococcus hirae Revealed by ATR-FTIR Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Yuji Furutani, et al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: 133 Pages: 2860-2863

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low-Temperature FTIR Study of Gloeobacter Rhodopsin : Presence of Strongly Hydrogen-Bonded Water and Long-Range Structural Protein Perturbation upon Retinal Photoisomerization2010

    • Author(s)
      Kyohei Hashimoto, et al.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 49 Pages: 3343-3350

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein Fluctuations as the Possible Origin of the Thermal Activation of Rod Photoreceptors in the Dark2010

    • Author(s)
      Victor Lorenz Fonfria, et al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: 132 Pages: 5693-5703

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An FTIR Study of the Photoreaction of Bovine Rhodopsin in the Presence of Hydroxylamine2010

    • Author(s)
      Kouta Katayama, et al.
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.B

      Volume: 114 Pages: 9039-9046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular insight into intrinsic heme distortion in ligand binding in hemoprotein2010

    • Author(s)
      Saburo Neya, et al.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 49 Pages: 5642-5650

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 赤外分光法でみるV型ATPaseのイオン結合・解離に伴う構造変化2011

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      平成22年度日本生物物理学会中部支部討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依学術交流センター(愛知)
    • Year and Date
      2011-03-31
  • [Presentation] Ion-binding-induced Structural Changes in Membrane Proteins Studied by ATR-FTIR Spectroscopy2011

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      Third Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences : -Experiments and Simulations
    • Place of Presentation
      Lotte Hotel, Jeju,(韓国)
    • Year and Date
      2011-02-27
  • [Presentation] FTIR Studies of Membrane Proteins2011

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      The Winter School of Sokendai/Asian CORE Program "Frontiers of Molecular Science-Life, Material, Energy, and Space"
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知)
    • Year and Date
      2011-02-21
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明と光応答性カリウムチャネルの開発2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「細胞感覚」平成22年度冬の班会議
    • Place of Presentation
      東京国際交流館(東京)
    • Year and Date
      2010-12-25
  • [Presentation] Modification of Gold Thin Film Suitable for Surface-enhanced Vibrational Spectroscopy on Membrane Proteins2010

    • Author(s)
      Hao Guo
    • Organizer
      4^<th> International Symposium on Nanomedicinc (ISNM2010)
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知)
    • Year and Date
      2010-11-30
  • [Presentation] 孤立ナノ空間を有する有機金属錯体での特異な光化学反応の分光解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「高次系分子科学」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学片平さくらホール(宮城)
    • Year and Date
      2010-11-25
  • [Presentation] 時間分解FTIR差スペクトル計測によるファラオニスハロロドプシンの陰イオン輸送過程での構造変化解析2010

    • Author(s)
      木村哲就
    • Organizer
      第36回日本生体エネルギー研究会&特定領域研究「革新的ナノバイオ」合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学銀杏会館(吹田)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] X-D伸縮振動領域を含めた時間分解赤外分光法によるバクテリオロドプシンの光誘起構造変化解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      第36回日本生体エネルギー研究会&特定領域研究「革新的ナノバイオ」合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学銀杏会館(大阪)
    • Year and Date
      2010-11-18
  • [Presentation] Modification of Gold Thin Film Suitable for Surface-enhanced Vibrational Spectroscopy on Membrane Proteins2010

    • Author(s)
      Hao Guo
    • Organizer
      The Overseas Sokendai Lecture in Bangkok 2010
    • Place of Presentation
      Chulalongkorn University, Bangkok,(タイ)
    • Year and Date
      2010-10-20
  • [Presentation] Stimulus-Induced Difference Infrared Spectroscopy for Membrane Proteins ; Visual and Archaeal-type Rhodopsins, and Flagella Motor Protein2010

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      Indo-Japan Joint Workshop on "New Frontiers of Molecular Spectroscopy ; from Gas Phase to Proteins"
    • Place of Presentation
      Hotel Kitano Plaza Rokkoso(兵庫)
    • Year and Date
      2010-09-28
  • [Presentation] Time-resolved FT-IR measurement of X-D stretching vibrations of Bacteriorhodopsin in micro-to mill-second time range2010

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] Conformational Changes upon Chloride-ion Pumping During the pharaonis Halorhodopsin Photocycle Studied by Time-resolved FTIR Spectroscopy2010

    • Author(s)
      Testunari Kimura
    • Organizer
      The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] 時間分解赤外分光法によるバクテリオロドプシンのX-D伸縮振動の解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      第4回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪)
    • Year and Date
      2010-09-15
  • [Presentation] ロドプシン-KcsA融合蛋白質の発現とFTIRによる構造変化解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「高次系分子科学」第9回ミニ公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      サギセミナーセンター(広島)
    • Year and Date
      2010-08-30
  • [Presentation] 赤外分光法によるイオン輸送蛋白質の構造変化解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      アドバンス生命理学特論:世話人;須藤雄気准教授(名大・院理)
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知)
    • Year and Date
      2010-07-13
  • [Presentation] 古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明と光応答性カリウムチャネルの開発2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「細胞感覚」平成22年度夏の班会議
    • Place of Presentation
      札幌市教育文化会館(北海道)
    • Year and Date
      2010-07-05
  • [Presentation] 光駆動イオン輸送蛋白質の動作機構の解明2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「革新的ナノバイオ」第5回班会議
    • Place of Presentation
      学習院大学(東京)
    • Year and Date
      2010-06-24
  • [Presentation] 孤立ナノ空間を有する有機金属錯体での特異な光化学反応の分光解析2010

    • Author(s)
      古谷祐詞
    • Organizer
      特定領域研究「高次系分子科学」第5回合同班会議
    • Place of Presentation
      南淡路ロイヤルホテル(兵庫)
    • Year and Date
      2010-05-25
  • [Presentation] Interaction between Membrane Proteins and Ions Studied by ATR-FTIR Spectroscopy : A Potential Tool for Drug Screening2010

    • Author(s)
      Yuji Furutani
    • Organizer
      BIT's 1^<st> Annual International Conference of Medichem-2010
    • Place of Presentation
      Beijing International Convention Center, Beijing,(中国)
    • Year and Date
      2010-05-19

URL: 

Published: 2012-07-19  

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