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2010 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌小分子RNAによるmRNA抑制機構の解析

Research Project

Project/Area Number 22770175
Research InstitutionSuzuka University of Medical Science

Principal Investigator

森田 鉄兵  鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 助手 (10444366)

Keywords低分子RNA / 遺伝子発現制御 / 大腸菌 / 塩基対形成 / RNAシャペロン
Research Abstract

本研究は、大腸菌小分子RNA(sRNA)によるmRNA抑制機構の全容の解明を最終的な目的として、sRNA/mRNA間の塩基対形成の詳細、およびRNA結合タンパク質であるHfqによるsRNA/mRNA間の塩基対形成の促進モデルの解明を目的とする。平成22年度においては、sRNAの一つであるSgrS sRNA/ptsG mRNA(標的mRNA)をモデル系として、SgrS sRNAの一部に対応する合成RNAを用いたin vitro解析を行い、SgrS 168-181 nt領域とptsG mRNAとで形成される塩基対が機能的に十分な最小の塩基対であることを明らかにした(論文(1))。またこれらの解析の中から、SgrS sRNA/Hfqの結合がSgrSの168-181nt領域では不十分であることを示した(論文(1))。後者の結果は、SgrS sRNA/Hfqの結合、およびHfqによるSgrS sRNA/ptsG mRNA間の塩基対形成の促進メカニズムを解明する上で、重要なポイントになると考えられる。さらに、Hfqと結合しsRNAに標的化されたmRNAを速やかに分解させるRNase EとHfqとの結合領域の詳細を解析し、RNase Eの710-750アミノ酸領域がHfqとの機能的な結合に必要であることを示した(論文(2))。これらの結果は、sRNA作動原理の詳細な解明に大きく貢献する。

  • Research Products

    (15 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] Hfq binding at RhlB-recognition region of RNase E is crucial for the rapid degradation of target mRNAs mediated by sRNAs in E.coli.2011

    • Author(s)
      Ikeda, Y., Yagi, M., Morita, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol.

      Volume: 79(2) Pages: 419-432

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNase E action at a distance : degradation of target mRNAs mediated by an Hfq-binding small RNA in bacteria.2011

    • Author(s)
      Morita, T., Aiba, H.
    • Journal Title

      Genes Dev.

      Volume: 25(4) Pages: 294-298

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A minimal base-pairing region of a bacterial small RNA SgrS required for translational repression of ptsG mRNA2010

    • Author(s)
      Maki, K., Morita, T., Otaka, H., Aiba H.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol.

      Volume: 76(3) Pages: 782-792

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of Hfq binding sites on RNase E in E.coli2010

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAであるSgrSの機能解析2010

    • Author(s)
      森田鉄兵、牧貴美香、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
    • Organizer
      第4回日本ゲノム微生物学会若手の会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市
    • Year and Date
      20101001-02
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAであるSgrSの機能解析2010

    • Author(s)
      森田鉄兵、牧貴美香、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
    • Organizer
      第4回細菌学・若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      修善寺(静岡県伊豆市)
    • Year and Date
      20100826-20100828
  • [Presentation] Heterogeneity of RNA degradosome of Escherichia coli : RNase E forms several distinct complexes with partner proteins2010

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      International symposium on Biodiversity Sciences2010
    • Place of Presentation
      愛知県名古屋市
    • Year and Date
      20100731-20100803
  • [Presentation] Implication of spacer length between base-pairing and Hfq-binding region in bacterial small RNA function2010

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      International symposium on Biodiversity Sciences 2010
    • Place of Presentation
      愛知県名古屋市
    • Year and Date
      20100731-0803
  • [Presentation] The 3' terminator poly-U tract of SgrS plays a crucial role in Hfq-dependent gene silencing2010

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      International symposium on Biodiversity Sciences 2010
    • Place of Presentation
      愛知県名古屋市
    • Year and Date
      20100731-0803
  • [Presentation] SgrS3'末端のポリU配列はRNA抑制機能に重要な役割を果たす2010

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東京都千代田区
    • Year and Date
      20100727-29
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAの作用機構の解析:塩基対形成領域とHfq結合領域間の距離の重要性2010

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東京都千代田区
    • Year and Date
      20100727-29
  • [Presentation] Identification of Hfq binding sites onRNase E in E.coli2010

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription
    • Place of Presentation
      沖縄県国頭郡
    • Year and Date
      20100701-20100705
  • [Presentation] Implication of spacer length between base-pairing and Hfq-binding region in bacterial small RNA function2010

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      The 11^<th> Asian and Oceanian Conference on Transcription
    • Place of Presentation
      沖縄県国頭郡
    • Year and Date
      20100701-05
  • [Presentation] 大腸菌RNase E/Hfqの結合領域の同定2010

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第7回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熊本県阿蘇郡
    • Year and Date
      20100603-04
  • [Presentation] 大腸菌sRNAであるSgrSの機能領域の解析2010

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第7回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熊本県阿蘇郡
    • Year and Date
      20100603-04

URL: 

Published: 2012-07-19  

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