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2011 Fiscal Year Annual Research Report

核内脂質付加修飾による遺伝子発現制御機構の解析

Research Project

Project/Area Number 22780086
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

横山 敦  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 特任助教 (20572332)

Keywords遺伝子発現 / 翻訳後修
Research Abstract

本年度は、前年度に確立した内在性のHNF4の精製・同定系を用いて細胞内のHNF4が実際脂質付加修飾を受けていることを検証・確認することを目的として研究を行った。
まず内在性のHNF4タンパク質を抗体精製により精製・濃縮し、LC-MS/MSにて測定を行い、得られたスペクトルをコンピューター解析にかけ翻訳後修飾を検討したところ、リン酸化、アセチル化、メチル化、ユビキチン化を含む14か所の翻訳後修飾サイトの同定に成功した。この結果は、今年度に原著論文として発表を行った。(Yokoyama et al.,Biochem Biopnys Res Commun,2011,410(4):749-5)しかしながら、この中に脂質修飾は含まれていなかった。この原因として、内在性HNF4のうち脂質付加修飾を受けているものの割合が検出限界以下である可能性も挙げられる。そこで、現在はより感度の高いRI化合物によるラベルによる検出を試みている。
また、内在性HNF4の脂質付加修飾をさらに検討するために、脂質付加修飾を受けたタンパク質を
click-it反応を用いた新たな手法により標識する方法を採用した。標識されたタンパク質をアビジンビーズにより濃縮し、LC-MS/MSを用いたプロテオミクにより網羅的に同定する手法を用いて検討を行った。その結果、核抽出液画分よりHNF4をはじめ、ヒストンタンパク質といった興味深い因子群が脂質付加タンパク質として同定された。この結果は、本研究課題の当初の想定よりも核内脂質付加修飾がグローバルな修飾であることを示唆している可能性があり、現在これらの結果を発表すべく準備を行っている。

  • Research Products

    (9 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] O-GlcNAcylation of histone H2B facilitates its monoubiquitination2011

    • Author(s)
      Fujiki R, Hashiba W, Sekine H, Yokoyama A, Chikanishi T, Ito S, Imai Y, Ohtake F, Kitagawa H, Kim J, Roeder RG, He HH, Brown M, Kato S
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 480 Pages: 557-560

    • DOI

      10.1038/nature10656

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple post-translational modifications in Hepatocyte nuclear factor 4α2011

    • Author(s)
      Yokoyama A. Katsura S, Ito R, Hashiba W, Sekine H, Fujiki R, Kato S
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 410 Pages: 749-753

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.06.033

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] JMJD5, a JmjC-domain-containing protein, negatively regulates osteoclastogenesis through facilitating NFATc1 protein degradation

    • Author(s)
      Youn MY, Yokoyama A, Fujiyama-Nakamura S, Ohtake F, Minehata KI, Yasuda H, Suzuki T, Kato S, Imai Y
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: (印刷中)

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.323105

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulated histone methyltransferase and demethylase complexes in gene regulation by nuclear receptor

    • Author(s)
      Yokoyama A, Fujiki R, Ohtake F, Kato S
    • Journal Title

      Cold Spring Harb Symp Quant Biol

      Volume: (印刷中)

    • DOI

      10.1101/sqb.2011.76.010736

  • [Presentation] 核内受容体HNF4aの翻訳後修飾の網羅的同定2012

    • Author(s)
      横山敦、桂彰吾、伊藤亮、橋場和華、関根弘樹、藤木亮次、加藤茂明
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2012-03-24
  • [Presentation] Multiple post-translational modifications in Hepatocyte nuclear factor 4 alpha2011

    • Author(s)
      Yokoyama A, Katsura S, Ito R, Hashiba W, Sekine H, Fujiki R and Kato S
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Multiple post-translational modifications in Hepatocyte nuclear factor 4 alpha2011

    • Author(s)
      Yokoyama A, Katsura S, Ito R, Hashiba W, Sekine H, Fujiki R and Kato S
    • Organizer
      EMBO conference nuclear receptors From molecular mechanism to health & disease
    • Place of Presentation
      シッチェス、バルセロナ,スペイン
    • Year and Date
      2011-09-19
  • [Presentation] Comprehensive analysis of post-translational modifications in hepatocyte nuclear factor 4 alpha2011

    • Author(s)
      Yokoyama A, Katsura S, Ito R, Hashiba W, Sekine H, Fujiki R and Kato S
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology
    • Place of Presentation
      コールドスプリングハーバー研究所、米国
    • Year and Date
      2011-06-05
  • [Presentation] オーファン核内受容体HNF4の翻訳後修飾の網羅的解析2011

    • Author(s)
      横山敦、橋場和華、関根弘樹、藤木亮次、加藤茂明
    • Organizer
      第5回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      KKRホテル熊本
    • Year and Date
      2011-05-20

URL: 

Published: 2013-06-26  

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