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2011 Fiscal Year Annual Research Report

蛋白質の高効率的精製・ラベル化を可能とするRecapturableリンカーの開発

Research Project

Project/Area Number 22790012
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

重永 章  徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 助教 (10423394)

Keywordsアビジン / 蛋白質精製 / 蛋白質ラベル化 / ビオチン / プルダウン / ペプチド / ペプチド結合切断 / 有機合成化学
Research Abstract

プロテオミクス分野における最も重要な基盤技術の一つとして、プロテオーム中標的蛋白質の精製および選択的ラベル化技術が挙げられる。蛋白質精製において、ビオチン修飾蛋白質のアビジンカラムによる精製が汎用される。しかし本方法では多くの場合、精製後の標的蛋白質に非特異的吸着由来の蛋白質が混入する。このため、カラム溶出液中の標的蛋白質のみを選択的にラベル化することは困難を極める。さらにビオチン-アビジン間の結合は強固なため、アビジンカラムからのビオチン修飾蛋白質の回収効率は低い。
本研究ではこれら問題を解決するため、プロテオーム中にある標的蛋白質の高効率的精製およびラベル化を可能どするRecapturableリンカーの開発を目的とした。Recapturableリンカーとは任意の条件下で切断され、その結果生じる官能基を足掛かりとして再び機能性ユニットの導入が可能なリンカーと定義する。本研究では、ビオチンと標的蛋白質結合部位の間にクリックケミストリーを用いて当該リンカーを導入し、標的蛋白質をアビジンカラムにより精製したのち、フッ素アニオンによるリンカー切断を経て標的蛋白質の高効率的回収を達成すると同時に、切断の結果生じる官能基を利用して標的蛋白質選択的にアルデヒド含有ラベル化試薬を導入する方法論の開発を目指す。
申請者は昨年度、当該リンカーの合成に成功した。そこで今年度は、小分子を用いたモデル実験および精製蛋白質を用いたモデル実験を行った。この結果、当該リンカーのモデル小分子とのクリックケミストリー、フッ素アニオン処理によるリンカーの切断、および切断成績体のアルデヒド含有試薬による修飾に成功した。さらにアルキニル化モデル蛋白質の調製に成功するとともに、これへの当該リンカーの導入およびアビジンカラムへの吸着に成功した。

  • Research Products

    (40 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (27 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Development of reduction-responsive amnio acid that induces peptide bond cleavage in hypoxic cells2012

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 13(in press)

    • DOI

      10.1002/cbic.201200141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Caged ceramide which releases parent ceramide after UV-induced amide bond cleavage followed by intramolecular O-N acyl transfer2012

    • Author(s)
      Shigenaga, A
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 385-386

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Doubly-kinetically controlled proline ligation2012

    • Author(s)
      Ding, H.
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 133-134

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent wnicn can directly participate in native chemical ligation2012

    • Author(s)
      Sato, K.
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 13-14

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-Sulfanylethylanilide peptide as a crypto-thioester peptide2011

    • Author(s)
      Sato, K.; Shigenaga, A.; Tsuji, K.; Tsuda, S.; Sumikawa, Y.; Sakamoto, K.; Otaka, A.
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 12 Pages: 1840-1844

    • DOI

      DOI:10.1002/cbic.201100241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of caged ceramide : UV-responsive ceramide releasing system based on UV-induced amide bond cleavage followed by O-N acy12011

    • Author(s)
      Shigenaga, A
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 3984-3990

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.04.048

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Application of N-C- or C-N-directed sequential native chemical ligation to the preparation of CXCL14 analogs and their biological evaluation2011

    • Author(s)
      Tsuji, K
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem.

      Volume: 19 Pages: 4014-4020

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2011.05.018

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dual kinetically-controlled native chemical ligation using a combination of sulfanylproline and sulfanylethylanilide peptide2011

    • Author(s)
      Ding, H
    • Journal Title

      Org.Lett.

      Volume: 13 Pages: 5588-5591

    • DOI

      10.1021/o1202316v

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of UV-responsive catch-and-release system of a cysteine protease model peptide2011

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 8879-8886

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.09.062

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent which can directly participate in native chemical ligation2011

    • Author(s)
      Sato, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the Twenty-Second American Peptide Symposium

      Pages: 72-73

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of CXCL14 and its derivatives utilizing C to N or N to C directive sequential NCL protocol2011

    • Author(s)
      Tsuji, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the Twenty-Second American Peptide Symposium

      Pages: 74-75

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] フッ化物イオン応答型アミノ酸の開発と標的タンパク質精製ツールへの応用2012

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] 4-チオプロリンを用いたNative Chemical Ligation法の開発2012

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] リン酸化タンパク質の機能解明に向けたケージド非水解性リン酸化アミノ酸含有ペプチドの合成研究2012

    • Author(s)
      傳田将也
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] CXCL14・CXCL12デュアルアンタゴニストペプチドの創製2012

    • Author(s)
      粟飯原圭佑
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] 新規チオール応答型アミノ酸の合成とDNA放出システムへの展開2012

    • Author(s)
      戎野紘司
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] タンパク質化学合成を指向したN-アミノアシルN-置換アニリンリンリンカーの効率的合成法の開発2012

    • Author(s)
      坂本一健
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] Native chemical ligation (NCL) without using peptide thioester2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      14th Peptide Forum
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Application of Stimulus-responsive Amino Acid to Traceable Linker for Efficient Enrichment and Specific Labeling of Target Proteins2011

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      8th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] The First Accomplishment of Development of CXCL14 Antagonistic Peptide by Dimerization of CXCL14 Fragment2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      8th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] 刺激応答型アミノ酸の開発とケミカルバイオロジー分野への展開2011

    • Author(s)
      重永章
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] AMP化タンパク質の機能解明を指向したペプチド性分子ツールの開発2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] CXCL14およびその誘導体の効率的合成法の開発と活性評価2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] リン酸化タンパク質の機能解明に同けた紫外線応答型リン酸化アミノ酸誘導体の合成研究2011

    • Author(s)
      傳田将也
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] ペプチドチオエステル合成用アニリン型補助基への効率的アミノ酸導入法の開発2011

    • Author(s)
      坂本健
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] タンパク質AMP化の生理学的意義解明を指向した新規分子ツールの開発2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] 4-メルカプトプロリンを用いたペプチドフラグメント縮合法の開発2011

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] タンパク質化学合成を指向したワンポット4成分連続縮合法の開発2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] N-Sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent which can directly participate in native chemical ligation2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Caged ceramide which releases parent ceramide after UV-induced amide bond cleavage followed by intramolecular O-N acy1 transfer2011

    • Author(s)
      重永章
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Double-kinetically controlled proline ligation2011

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Development of nucleocytoplasmic shuttle peptide using stimulus-responsive processing device2011

    • Author(s)
      大高章
    • Organizer
      日本生物物理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(姫路市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] タンパク質AMP化の生理学的意義解明に向けたAMP化アミノ酸誘導体の創製2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      創薬懇話会2011
    • Place of Presentation
      ダイヤモンド瀬戸内マリンホテル(岡山市)
    • Year and Date
      2011-07-06
  • [Presentation] 簡便かつ効率的タンパク質化学合成法の開発2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      創薬懇話会2011
    • Place of Presentation
      ダイヤモンド瀬戸内マリンホテル(岡山市)
    • Year and Date
      2011-07-06
  • [Presentation] Design and synthesis of traceable linker for efficient enrichment and specific labeling of target proteins2011

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] N-sulfanylethylanilide derivative as a peptide thioester equivalent2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] Synthesis of CXCL14 and Its derivatives utilizing C to N or N to C directive sequential NCL protocol2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] AMP化タンパク質の機能解明に向けたAMP化アミノ酸誘導体の創製2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(東京都)
    • Year and Date
      2011-05-23
  • [Book] 遺伝子医学MOOK 21号最新ペプチド合成技術とその創楽研究への応用「刺激応答型アミノ酸の開発と生命科学分野への応用」2012

    • Author(s)
      重永章
    • Publisher
      メディカルドゥ(印刷中)
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tokushima-u.ac.jp/ph/facuty/course_laboratory/bioorganic synthetic chemistry/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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