2010 Fiscal Year Annual Research Report
新規HIV-2組換え流行株CRF01_ABのウイルス学的特性を解明する研究
Project/Area Number |
22790962
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Research Institution | National Hospital Organization Nagoya Medical Center |
Principal Investigator |
伊部 史朗 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), 感染・免疫研究部, 研究員 (10399595)
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Keywords | ウイルス / 感染症 |
Research Abstract |
申請者らは、世界で最初のHIV-2組換え流行株であるCRF01_ABを同定した(J Acquir Immune Defic Syndr, 2010)。これまでHIV-2は病原性が低いと考えられてきたが、申請者らが同定した3例のCRF01_AB感染例は全例が若年齢にもかかわらず、診断時に既にエイズを発症していた。このことは、CRF01_AB株がゲノム組換えを介して、従来のHIV-2株よりも高い病原性を獲得した可能性を示唆している。本研究は、HIV-2 CRF01_AB株のウイルス学的特性を明らかにすることを目的とする。 本年度は2症例において、HIV-2CRF01_AB株の完全長分子クローンの作製に必要な遺伝子断片を得ることができた。具体的には、まず、患者抹消血単核球から精製したDNAを鋳型に用い、高正確性PCRによってHIV-2CRF01_ABのプロウイルスDNA断片を増幅した。この際、プロウイルスDNAを前半部、後半部の2断片に分けて増幅することにより、プロウイルスDNA両末端に存在するLTR領域が長鎖PCRを阻む問題を回避することできた。増幅産物を計86個クローニングし、その塩基配列を解析した結果、そのほとんど(80%,69/86)の増幅産物がフレームシフトや異常な終止コドンを含ない本来のウイルス遺伝子を保持していることが明らかになった。次年度、これらのプロウイルスDNA前半部、後半部を組み合わせて完全長分子クローンを作製し、発現ウイルスの増殖性や細胞指向性を解明する予定である。
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[Journal Article] Outbreak of hepatitis B virus genotype A and transmission of genetic drug resistance incases coinfected with HIV-1 in Japan2011
Author(s)
Fujisaki S, Yokomaku Y, Shiino T, Koibuchi T, Hattori J, Ibe S, Iwatani Y, Iwamoto A, Shirasaka T, Hamaguchi M, Sugiura W
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Journal Title
J Clin Microbiol
Volume: 49
Pages: 1017-1024
Peer Reviewed
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[Journal Article] Trends in transmitted drug-resistant HIV-1 and demographic characteristics of newly diagnosed patients : nationwide surveillance from 2003 to 2008 in Japan2010
Author(s)
Hattori J, Shiino T, Gatanaga H, Yoshida S, Watanabe D, Minami R, Sadamasu K, Kondo M, Mori H, Ueda M, Tateyama M, Ueda A, Kato S, Ito T, Oie M, Takata N, Hayashida T, Nagashima M, Matsuda M, Ibe S, Ota Y, Sasaki S, Ishigatsubo Y, Tanabe Y, Koga I, Kojima Y, Yamamoto M, Fujita J, Yokomaku Y, Koike T, Shirasaka T, Oka S, Sugiura W.
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Journal Title
Antiviral Res
Volume: 88
Pages: 72-79
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] HIV-2 CRF01_AB : first circulating recombinant form of HIV-22010
Author(s)
Ibe S, Yokomaku Y, Shiino T, Tanaka R, Hattori J, Fujisaki S, Iwatani Y, Mamiya N, Utsumi M, Kato S, Hamaguchi M, Sugiura W.
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Journal Title
J Acquir Immune Defic Syndr
Volume: 54
Pages: 241-247
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Molecular epidemiology of HIV-2 in Japan : identification of the first circulating recombinant form of HIV-2, CRF01_AB2010
Author(s)
Ibe S, Yokomaku Y, Shiino T, Tanaka R, Hattori J, Fujisaki S, Iwatani Y, Mamiya N, Utsumi M, Kato S, Hamaguchi M, Sugiura W.
Organizer
5th International Workshop on HIV Transmission
Place of Presentation
Vienna, Austria
Year and Date
20100700
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