• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

マウス胚性幹細胞分化に伴うゲノムの核内高次折り畳み構造変化の分子基盤

Research Project

Project/Area Number 22870033
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

平谷 伊智朗  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 助教 (40583753)

Keywords生物・生体工学 / ゲノム / 遺伝子 / 発生・分化
Research Abstract

哺乳類の発生過程において、未分化な胚細胞は発生・分化に伴って未分化状態から分化状態へとそのグローバルな染色体構造を変える。この構造変化は、細胞のエピジェネティックな変化を表象したものと考えられるがその意義は未だに謎に包まれている。代表者はこれまでに、この「構造変化」が顕著に認められる染色体領域及び発生時期をゲノムワイドDNA複製タイミング解析と蛍光顕微鏡解析及び電子顕微鏡解析を併せて解析した結果、マウスES細胞がpost-implantation epiblast様細胞(EpiSC細胞)に分化した時点で大きな染色体構造変化が起こることを見出した。
本研究では、この変化が未分化細胞から体細胞への分化における重要な分岐点であるという仮説に立脚し、その分子基盤を明らかにすることを試みた。具体的には、マウスES細胞のEpiSC細胞への分化系を確立し、siRNAスクリーニングの実験系を確立し、ES細胞のEpiSC細胞への分化を阻害する因子をsiRNAスクリーニングにより同定することを目標とした。今年度は、このうちsiRNAスクリーニングの実験系を確立した。一方、マウスES細胞株BRC6のEpiSC細胞への分化の系は培養中にX染色体が抜け落ちるという問題が生じ、分化の重要な指標の1つであるX染色体不活性化の検出に困難が伴ったため中断している。代替案として、雌の培養細胞株を用いて不活性X染色体が解除されることを指標にsiRNAスクリーニングを行うことを考え、そのような実験系の確立を急いでいる。現在、X染色体上のHprt遺伝子発現を利用した薬剤耐性とX染色体の複製タイミング変化を指標にこれが実施可能であるという感触を得ている。

  • Research Products

    (3 results)

All 2011 2010

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Evolutionarily conserved replication timing profiles predict long-range chromatin interactions and distinguish closely related cell types2010

    • Author(s)
      Ryba T., et al.
    • Journal Title

      Genome Research

      Volume: 20 Pages: 761-770

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Space and time in the nucleus : developmental control of replication timing and chromosome architecture2010

    • Author(s)
      Gilbert D.M., et al.
    • Journal Title

      Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology

      Volume: (in press)

  • [Presentation] Genome-Wide Dynamics of DNA Replication Timing Revealed by In Vitro Models of Mouse Embryogenesis-Implications for Higher-Order Genome Organization And Its Developmental Regulation2011

    • Author(s)
      平谷伊智朗
    • Organizer
      理研CDBシンポジウム"Epigenetic Landscape in Development and Disease"
    • Place of Presentation
      理研CDB、神戸
    • Year and Date
      2011-03-14

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi