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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Platform for Advanced Genome Science

Research Project

Project/Area Number 22H04925
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

黒川 顕  国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (20343246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 川嶋 実苗  国立研究開発法人科学技術振興機構, NBDC事業推進部, 研究員 (00396706)
豊田 敦  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 特任教授 (10267495)
鈴木 穣  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
林 哲也  九州大学, 医学研究院, 教授 (10173014)
中村 保一  国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (60370920)
森 宙史  国立遺伝学研究所, 情報研究系, 准教授 (40610837)
野口 英樹  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任教授 (50333349)
浅井 潔  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
岩崎 渉  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (50545019)
森下 真一  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (90292854)
笠原 雅弘  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (60376605)
伊藤 武彦  東京工業大学, 生命理工学院, 教授 (90501106)
瀬々 潤  株式会社ヒューマノーム研究所, 本社, 代表取締役社長 (40361539)
中谷 明弘  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任教授 (60301149)
島村 徹平  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (00623943)
波江野 洋  東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 准教授 (70706754)
熊谷 雄太郎  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (00528408)
高橋 弘喜  千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60548460)
平川 英樹  公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, 主任研究員 (80372746)
浜田 道昭  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (00596538)
山田 拓司  東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (10437262)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2028-03-31
Keywords次世代シーケンサー / ゲノム・メタゲノム / RNA解析 / エピゲノム / シングルセル解析 / 空間的オミックス解析 / バイオインフォマティクス / スーパーコンピュータ
Outline of Annual Research Achievements

①総括支援活動では支援課題の公募を実施し生命系のほぼ全分科から合計323の応募がありそのうち171課題を採択した。今年度の応募数は、同じく年1回公募だった第1期先進ゲノム支援の2019年度と概ね同様であったが、支援内容の精査や上限額の設定により、採択率が53%となり先進ゲノム支援として初めて50%超を実現した。拡大班会議を開催し235名の被支援者および支援班員が一同に会してゲノムをキーワードに異分野研究交流を進めた。情報解析講習会として初級者編(参加者148名)、中級者編(参加者240名)を開催した。
②大規模配列解析拠点ネットワーク支援活動においては、1)長鎖シーケンシングのためにSequel IIe、2)空間的オミックス解析のためにXenium を導入し、それらの試行や条件検討、技術支援者の訓練も進め、支援で提供できるようにした。染色体レベルの高精度ゲノム配列決定(遺伝研)、空間的遺伝子発現解析(東大新領域)、近縁菌株が集積した試料からの高精度MAGの構築(九大)等を進めた。
③情報解析支援活動においては、スパコン(遺伝研、東大医科研ヒトゲノム解析センター、東大情報基盤センター、東工大TSUBAME、産総研、京大化研、かずさDNA研等)を活用するとともに、利用量や占有の必要性に応じ、各機関や研究室の計算機を使用して支援を進めた。今年度は東工大に大規模メモリサーバを導入し、ロングリードアセンブル技術の高度化を進めドラフトゲノム解析支援を加速した。超高速相同性検索ソフトウェアPZLAST、微生物ゲノムアノテーションパイプライン DFAST(遺伝研)、ロングリードシミュレータPBSIM3(東大)、細胞運命分岐点を探索するための深層生成モデル VICDYF等の高度技術開発(名大)を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

・研究支援代表の下、研究支援分担者21名、研究支援協力者10名、総勢32名の班員が全国13の大学・研究機関(部局数は16)から参加して支援体制を構築した。また、国立遺伝学研究所を中核機関とし、参加する班員が所属する主な機関を連携機関とする連携ネットワークを形成して、機関の支援を受けられるように連携機関間で連携協定を締結した。
・支援課題公募については、透明性を確保するために審査委員会は領域外有識者のみで構成し、領域からの技術的・経費的な情報提供を参考に支援課題を決定した。支援希望内容は各課題で拡大する傾向にあるが、経費上限を設定するなどしてできるだけ多く支援するように努め、本年度は採択率が53%となり第1期先進ゲノム支援を含め、初めて50%超を実現した。採択件数は合計171件、主たる支援技術分類は、新規ゲノム決定 : 13件、変異解析 : 26件、修飾解析 : 34件、RNA解析 :53件、メタゲノム解析等 : 2件、超高感度解析:54件、情報解析のみ : 12件、合計194(採択1件あたり複数の技術支援がある)であり、多様な技術の提供ができた。
・拡大班会議を開催し、支援依頼者の若手共同研究者の旅費援助をするなどして、支援側と依頼者の交流を深めることができた。

Strategy for Future Research Activity

・国際レベルの最先端技術を提供するために、支援拠点における機器の導入、支援技術の高度化を引き続き進める。今年度、東大拠点に最先端の空間解析機器を世界に先駆けて導入した。最先端機器を使いこなすことができる世界トップレベルの支援班員が、優れた研究支援課題に応用するため支援機器・技術の整備を進め、さらに解析技術を向上させ次の支援に活かす、という好循環を維持する。
・支援応募数は今後も増える可能性があり、情報解析支援のキャパシティを超える恐れがある。すそ野拡大という観点からも、依頼者自らが一般的な解析をできるよう人材育成することも重要である。今年度は初級者および中級者向けの講習会を開催した。また拡大班会議においても情報解析講習会を開催した。今後もROIS-BSIや他の機関とも連携し、情報解析講習会を充実させ、ゲノム科学のすそ野拡大を進めたい。また、支援の際に依頼者のグループの若手を支援側に派遣してもらい、指導を受けて自分たちのデータの解析を行うOJTも非常に有効であるため積極的に進めていく。
・最先端機器を組み合わせ多様かつ膨大なデータから新たな知識を見出す研究が世界の主流となっており、現在一律で設定している消耗品経費の限度額では満足な成果が得られない状況となりつつある。中途半端な支援は効率が悪く、経費をかけた割には成果が出ないという状態になりかねない。採択率が多少下がっても、高効率の支援ができるよう、限度額を上げるなど検討する。

Remarks

MitoFish(魚類ミトコンドリアゲノムデータベース)http://mitofish.aori.u-tokyo.ac.jp/
ProkAtlas(微生物生息環境データベース)https://msk33.github.io/prokatlas.html

  • Research Products

    (581 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (182 results) (of which Int'l Joint Research: 38 results,  Peer Reviewed: 164 results,  Open Access: 125 results) Presentation (377 results) (of which Int'l Joint Research: 81 results,  Invited: 121 results) Book (6 results) Remarks (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (5 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] US Food and Drug Administration/National Institutes of Health/Stanford University School of Medicine(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      US Food and Drug Administration/National Institutes of Health/Stanford University School of Medicine
    • # of Other Institutions
      25
  • [Int'l Joint Research] Fudan University/National Institute of Metrology/Zhejiang University(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Fudan University/National Institute of Metrology/Zhejiang University
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] Monash University/University of Canberra/SAHMRI(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      Monash University/University of Canberra/SAHMRI
  • [Int'l Joint Research] John Innes Centre/University of Cambridge/University of East Anglia(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      John Innes Centre/University of Cambridge/University of East Anglia
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] SLU(スウェーデン)

    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      SLU
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      17
  • [Journal Article] Machine learning enables prediction of metabolic system evolution in bacteria2023

    • Author(s)
      Naoki Konno、Wataru Iwasaki
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1126/sciadv.adc9130

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Naked Mole-Rat as a Model for Healthy Aging2023

    • Author(s)
      Kaori Oka、Masanori Yamakawa、Yoshimi Kawamura、Nobuyuki Kutsukake、Kyoko Miura
    • Journal Title

      Annual Review of Animal Biosciences

      Volume: 11 Pages: 207~226

    • DOI

      10.1146/annurev-animal-050322-074744

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mutations Related to Antibiotics Resistance in Helicobacter pylori Clinical Isolates from Bangladesh2023

    • Author(s)
      Kartika Afrida Fauzia、Hafeza Aftab、Evariste Tshibangu-Kabamba、Ricky Indra Alfaray、Batsaikhan Saruuljavkhlan、Alain Cimuanga-Mukanya、Takashi Matsumoto、Phawinee Subsomwong、Junko Akada、Muhammad Miftahussurur、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      Antibiotics

      Volume: 12 Pages: 279

    • DOI

      10.3390/antibiotics12020279

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Staphylococcus aureus MazG hydrolyzes oxidized guanine nucleotides and contributes to oxidative stress resistance2023

    • Author(s)
      Fuki Nigo、Ryosuke Nakagawa、Yuuki Hirai、Lina Imai、Yutaka Suzuki、Kazuyuki Furuta、Chikara Kaito
    • Journal Title

      Biochimie

      Volume: 209 Pages: 52~60

    • DOI

      10.1016/j.biochi.2023.02.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MED26‐containing Mediator may orchestrate multiple transcription processes through organization of nuclear bodies2023

    • Author(s)
      Hidefumi Suzuki、Kazuki Furugori、Ryota Abe、Shintaro Ogawa、Sayaka Ito、Tomohiko Akiyama、Keiko Horiuchi、Hidehisa Takahashi
    • Journal Title

      BioEssays

      Volume: 45 Pages: e2200178

    • DOI

      10.1002/bies.202200178

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] BAY61-3606 Alters snRNP Composition and Enhances Usage of Suboptimal Splice Acceptor Site2023

    • Author(s)
      Kenji Tomita、Shinichi Nakagawa、Hiroyoshi Ariga、Hiroshi Maita
    • Journal Title

      Biological and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 46 Pages: 147~157

    • DOI

      10.1248/bpb.b22-00471

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Claspin-Dependent and -Independent Chk1 Activation by a Panel of Biological Stresses2023

    • Author(s)
      Hao-Wen Hsiao、Chi-Chun Yang、Hisao Masai
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 13 Pages: 125

    • DOI

      10.3390/biom13010125

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cancer-specific tissue-resident memory T-cells express ZNF683 in colorectal cancer2023

    • Author(s)
      Masatoshi Kitakaze、Mamoru Uemura、Tomoaki Hara、Ryota Chijimatsu、Daisuke Motooka、Toshiro Hirai、Masamitsu Konno、Daisuke Okuzaki、Yuki Sekido、Tsuyoshi Hata、Takayuki Ogino、Hidekazu Takahashi、Norikatsu Miyoshi、Ken Ofusa、Tsunekazu Mizushima、Hidetoshi Eguchi、Yuichiro Doki、Hideshi Ishii
    • Journal Title

      British Journal of Cancer

      Volume: 128(10) Pages: 1828~1837

    • DOI

      10.1038/s41416-023-02202-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An integrative epigenomic approach identifies ELF3 as an oncogenic regulator in ASCL1-positive neuroendocrine carcinoma2023

    • Author(s)
      Masafumi Horie、Hidenori Tanaka、Masami Suzuki、Yoshihiko Sato、So Takata、Erina Takai、Naoya Miyashita、Akira Saito、Yoichiro Nakatani、Shinichi Yachida
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/cas.15764

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spatial genomic diversity associated with APOBEC mutagenesis in squamous cell carcinoma arising from ovarian teratoma2023

    • Author(s)
      Ryo Tamura、Hirofumi Nakaoka、Nozomi Yachida、Haruka Ueda、Tatsuya Ishiguro、Teiichi Motoyama、Ituro Inoue、Takayuki Enomoto、Kosuke Yoshihara
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114(5) Pages: 2145~2157

    • DOI

      10.1111/cas.15754

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Inflammatory cytokine‐enriched microenvironment plays key roles in the development of breast cancers2023

    • Author(s)
      Yasuto Takeuchi、Noriko Gotoh
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114(5) Pages: 1792~1799

    • DOI

      10.1111/cas.15734

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The oncogenic driving force of CD30 signaling‐induced chromosomal instability in adult T‐cell leukemia/lymphoma2023

    • Author(s)
      Makoto Nakashima、Atae Utsunomiya、Toshiki Watanabe、Ryouichi Horie、Kaoru Uchimaru
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114(4) Pages: 1556~1568

    • DOI

      10.1111/cas.15706

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Metabolic adaptations of cancer in extreme tumor microenvironments2023

    • Author(s)
      Ryuichi Nakahara、Keisuke Maeda、Sho Aki、Tsuyoshi Osawa
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Pages: 1200~1207

    • DOI

      10.1111/cas.15722

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatial and single-cell transcriptomics decipher the cellular environment containing HLA-G cancer cells and SPP1 macrophages in colorectal cancer2023

    • Author(s)
      Yuki Ozato、Yasuhiro Kojima、Yuta Kobayashi、Yuuichi Hisamatsu、Takeo Toshima、Yusuke Yonemura、Takaaki Masuda、Kouichi Kagawa、Yasuhiro Goto、Mitsuaki Utou、Mituko Fukunaga、Ayako Gamachi、Kiyomi Imamura、Yuta Kuze、Junko Zenkoh、Ayako Suzuki、Atsushi Niida、Yutaka Suzuki、Teppei Shimamura、Koshi Mimoriet al.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 111929

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111929

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemical nature of attention deficit hyperactivity disorder (ADHD) - related chemical subfamily2023

    • Author(s)
      Masami Ishido
    • Journal Title

      Chemosphere

      Volume: 313 Pages: 137495

    • DOI

      10.1016/j.chemosphere.2022.137495

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Murine breast cancers disorganize the liver transcriptome in a zonated manner2023

    • Author(s)
      Alexis Vandenbon、Rin Mizuno、Riyo Konishi、Masaya Onishi、Kyoko Masuda、Yuka Kobayashi、Hiroshi Kawamoto、Ayako Suzuki、Chenfeng He、Yuki Nakamura、Kosuke Kawaguchi、Masakazu Toi、Masahito Shimizu、Yasuhito Tanaka、Yutaka Suzuki、Shinpei Kawaoka
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6(1) Pages: 97

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04479-w

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bioinformatics approaches for unveiling virus-host interactions2023

    • Author(s)
      Hitoshi Iuchi、Junna Kawasaki、Kento Kubo、Tsukasa Fukunaga、Koki Hokao、Gentaro Yokoyama、Akiko Ichinose、Kanta Suga、Michiaki Hamada
    • Journal Title

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      Volume: 21 Pages: 1774~1784

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2023.02.044

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Low-grade intestinal metaplasia in Indonesia: Insights into the expression of proinflammatory cytokines during Helicobacter pylori infection and unique East-Asian CagA characteristics2023

    • Author(s)
      Muhammad Miftahussurur、Ricky Indra Alfaray、Kartika Afrida Fauzia、Astri Dewayani、Dalla Doohan、Langgeng Agung Waskito、Yudith Annisa Ayu Rezkitha、Didik Huswo Utomo、Gde Somayana、Ari Fahrial Syam、Masrul Lubis、Junko Akada、Takashi Matsumoto、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      Cytokine

      Volume: 163 Pages: 156122

    • DOI

      10.1016/j.cyto.2022.156122

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The Drosophila AWP1 ortholog Doctor No regulates JAK/STAT signaling for left-right asymmetry in the gut by promoting receptor endocytosis2023

    • Author(s)
      Yi-Ting Lai、Takeshi Sasamura、Junpei Kuroda、Reo Maeda、Mitsutoshi Nakamura、Ryo Hatori、Tomoki Ishibashi、Kiichiro Taniguchi、Masashi Ooike、Tomohiro Taguchi、Naotaka Nakazawa、Shunya Hozumi、Takashi Okumura、Toshiro Aigaki、Mikiko Inaki、Kenji Matsuno
    • Journal Title

      Development

      Volume: 150 Pages: dev201224

    • DOI

      10.1242/dev.201224

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reconsideration of the previously classified incompatibility groups of plasmids, IncP-1 and IncP-112023

    • Author(s)
      Masaki Shintani、Haruo Suzuki、Hideaki Nojiri、Masato Suzuki
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/1462-2920.16345

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Pattern and trends of Helicobacter pylori genotypes in gastric cancer: A Kenyan 8-year study2023

    • Author(s)
      Priscilla Njenga、Allan Njau、Zahir Moloo、Gunturu Revathi、Evariste Tshibangu、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      Frontiers in Medicine

      Volume: 10 Pages: 1119513

    • DOI

      10.3389/fmed.2023.1119513

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular mapping of genomic regions and identification of possible candidate genes associated with gynoecious sex expression in bitter gourd2023

    • Author(s)
      Vinay N. D.、Hideo Matsumura、Anilabha Das Munshi、Ranjith Kumar Ellur、Viswanathan Chinnusamy、Ankita Singh、Mir Asif Iquebal、Sarika Jaiswal、Gograj Singh Jat、Ipsita Panigrahi、Ambika Baladev Gaikwad、A. R. Rao、Shyam Sundar Dey、Tusar Kanti Behera
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 14 Pages: 1071648

    • DOI

      10.3389/fpls.2023.1071648

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The cytosolic lncRNA dutA affects STATa signaling and developmental commitment in Dictyostelium2023

    • Author(s)
      Yukika Saga、Yudai Shimoyama、Yoko Yamada、Naoki Morikawa、Takefumi Kawata
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 28 Pages: 111~128

    • DOI

      10.1111/gtc.12997

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification2023

    • Author(s)
      Ryza Rynazal、Kota Fujisawa、Hirotsugu Shiroma、Felix Salim、Sayaka Mizutani、Satoshi Shiba、Shinichi Yachida、Takuji Yamada
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 24 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s13059-023-02858-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Best practices for comprehensive annotation of neuropeptides of Gryllus bimaculatus2023

    • Author(s)
      Takako Mochizuki、Mika Sakamoto、Yasuhiro Tanizawa、Hitomi Seike、Zhen Zhu、Yi Jun Zhou、Keisuke Fukumura、Shinji Nagata、Yasukazu Nakamura
    • Journal Title

      Insects

      Volume: 14(2) Pages: 121

    • DOI

      10.3390/insects14020121

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ribosome profiling analysis reveals the roles of DDX41 in translational regulation2023

    • Author(s)
      Saruul Tungalag、Satoru Shinriki、Mayumi Hirayama、Akiko Nagamachi、Akinori Kanai、Toshiya Inaba、Hirotaka Matsui
    • Journal Title

      International Journal of Hematology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1007/s12185-023-03558-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Further notice of omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2023

    • Author(s)
      Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology

      Volume: 58 Pages: 427~428

    • DOI

      10.1007/s00535-022-01951-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] NKG2D Ligand Expression Induced by Oxidative Stress Mitigates Cutaneous Ischemia-Reperfusion Injury2023

    • Author(s)
      Keishi Makita、Noriyuki Otsuka、Utano Tomaru、Koji Taniguchi、Masanori Kasahara
    • Journal Title

      Journal of Histochemistry & Cytochemistry

      Volume: 71 Pages: 61~72

    • DOI

      10.1369/00221554221147582

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aberrant association of chromatin with nuclear periphery induced by Rif1 leads to mitotic defect2023

    • Author(s)
      Yutaka Kanoh、Masaru Ueno、Motoshi Hayano、Satomi Kudo、Hisao Masai
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 6 Pages: e202201603

    • DOI

      10.26508/lsa.202201603

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Web Services for RNA-RNA Interaction Prediction2023

    • Author(s)
      Tsukasa Fukunaga、Junichi Iwakiri、Michiaki Hamada
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: - Pages: 175~195

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2768-6_11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fast RNA-RNA Interaction Prediction Methods for Interaction Analysis of Transcriptome-Scale Large Datasets2023

    • Author(s)
      Tsukasa Fukunaga、Michiaki Hamada
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: - Pages: 163~173

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2768-6_10

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome Sequence of Basidiomycetous Yeast Mrakia gelida MGH-2, Isolated from Skarvsnes Ice-Free Area, East Antarctica2023

    • Author(s)
      Masaharu Tsuji、Jun-ichi Ishihara、Atsushi Toyoda、Hiroki Takahashi、Sakae Kudoh
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 12(1) Pages: e0106422

    • DOI

      10.1128/mra.01064-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polyphasic Characterization of Geotalea uranireducens NIT-SL11 Newly Isolated from a Complex of Sewage Sludge and Microbially Reduced Graphene Oxide2023

    • Author(s)
      Li Xie、Naoko Yoshida、Lingyu Meng
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 11 Pages: 349

    • DOI

      10.3390/microorganisms11020349

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Claspin is Required for Growth Recovery from Serum Starvation through Regulating the PI3K-PDK1-mTOR Pathway in Mammalian Cells2023

    • Author(s)
      Chi-Chun Yang、Hisao Masai
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 43 Pages: 1~21

    • DOI

      10.1080/10985549.2022.2160598

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MitoFish, MitoAnnotator, and MiFish Pipeline: Updates in 10 Years2023

    • Author(s)
      Tao Zhu、Yukuto Sato、Tetsuya Sado、Masaki Miya、Wataru Iwasaki
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 40 Pages: -

    • DOI

      10.1093/molbev/msad035

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Loss-of-function approach using mouse retinal explants showed pivotal roles of Nmnat2 in early and middle stages of retinal development2023

    • Author(s)
      Hiroshi Kuribayashi、Miku Katahira、Makoto Aihara、Yutaka Suzuki、Sumiko Watanabe
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 34(1) Pages: ar4

    • DOI

      10.1091/mbc.e22-03-0078

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A divergent RWP‐RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium2023

    • Author(s)
      Hiroyuki Sekimoto、Ayumi Komiya、Natsumi Tsuyuki、Junko Kawai、Naho Kanda、Ryo Ootsuki、Yutaka Suzuki、Atsushi Toyoda、Asao Fujiyama、Masahiro Kasahara、Jun Abe、Yuki Tsuchikane、Tomoaki Nishiyama
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 237 Pages: 1636~1651

    • DOI

      10.1111/nph.18662

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitochondrial gene defects in Arabidopsis can broadly affect mitochondrial gene expression through copy number2023

    • Author(s)
      Hiroki Ayabe、Atsushi Toyoda、Akitoshi Iwamoto、Nobuhiro Tsutsumi、Shin-ichi Arimura
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 191 Pages: 2256~2275

    • DOI

      10.1093/plphys/kiad024

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Zygnematophycean algae: Possible models for cellular and evolutionary biology2023

    • Author(s)
      Kinuka Ohtaka、Hiroyuki Sekimoto
    • Journal Title

      Seminars in Cell & Developmental Biology

      Volume: 134 Pages: 59~68

    • DOI

      10.1016/j.semcdb.2022.03.042

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Elucidation of Physiological Functions of Vitamin K in the Brain and Development of New Derivatives for Neuroregeneration2023

    • Author(s)
      Yoshihisa Hirota
    • Journal Title

      YAKUGAKU ZASSHI

      Volume: 143 Pages: 199~203

    • DOI

      10.1248/yakushi.22-00187

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Long-Read Whole-Genome Sequencing Using a Nanopore Sequencer and Detection of Structural Variants in Cancer Genomes2023

    • Author(s)
      Yasuhiko Haga、Yoshitaka Sakamoto、Miyuki Arai、Yutaka Suzuki、Ayako Suzuki
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: - Pages: 177~189

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2996-3_13

    • Open Access
  • [Journal Article] Using Spinning Disk Microscopy to Observe the Mitotic and Cytokinetic Apparatus in Physcomitrium patens2023

    • Author(s)
      Yuji Hiwatashi、Takashi Murata
    • Journal Title

      The Plant Cytoskeleton

      Volume: - Pages: 159~171

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2867-6_12

  • [Journal Article] 大腸菌を用いた長期実験進化への挑戦~ストレスを受け入れ生き延びる方法の探求~2023

    • Author(s)
      岸本利彦
    • Journal Title

      生産と技術

      Volume: 75(1) Pages: 35~37

  • [Journal Article] 腸内細菌と化学療法2023

    • Author(s)
      柴 知史
    • Journal Title

      胆と膵

      Volume: Vol.44 No.3 Pages: 255~259

  • [Journal Article] エピジェネティック・プライミングによる植物の再生能力獲得メカニズム2023

    • Author(s)
      右橋 雅子 、 松永 幸大
    • Journal Title

      放射線生物研究

      Volume: 58(1) Pages: 58~68

  • [Journal Article] Nitric oxide‐soluble guanylyl cyclase pathway as a contributor to age‐related memory impairment in Drosophila2022

    • Author(s)
      Ayako Tonoki、Saki Nagai、Zhihua Yu、Tong Yue、Sizhe Lyu、Xue Hou、Kotomi Onuki、Kaho Yabana、Hiroki Takahashi、Motoyuki Itoh
    • Journal Title

      Aging Cell

      Volume: 21 Pages: -

    • DOI

      10.1111/acel.13691

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Long‐read sequence analysis for clustered genomic copy number aberrations revealed architectures of intricately intertwined rearrangements2022

    • Author(s)
      Takeaki Tamura、Keiko Yamamoto Shimojima、Nobuhiko Okamoto、Hiroshi Yagasaki、Ichiro Morioka、Hitoshi Kanno、Yohei Minakuchi、Atsushi Toyoda、Toshiyuki Yamamoto
    • Journal Title

      American Journal of Medical Genetics Part A

      Volume: 191 Pages: 112~119

    • DOI

      10.1002/ajmg.a.62997

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Somatic GJA4 gain-of-function mutation in orbital cavernous venous malformations2022

    • Author(s)
      Hiroki Hongo、Satoru Miyawaki、Yu Teranishi、Jun Mitsui、Hiroto Katoh、Daisuke Komura、Kinya Tsubota、Takashi Matsukawa、Masakatsu Watanabe、Masakazu Kurita、Jun Yoshimura、Shogo Dofuku、Kenta Ohara、Daiichiro Ishigami、Atsushi Okano、Motoi Kato、Fumihiko Hakuno、Shinichi Morishita、Shoji Tsuji、Nobuhito Saito et al.
    • Journal Title

      Angiogenesis

      Volume: 26 Pages: 37~52

    • DOI

      10.1007/s10456-022-09846-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hitherto-Unnoticed Self-Transmissible Plasmids Widely Distributed among Different Environments in Japan2022

    • Author(s)
      Masaya Hayakawa、Maho Tokuda、Kensei Kaneko、Koichiro Nakamichi、Yukie Yamamoto、Tatsuya Kamijo、Honoka Umeki、Reimi Chiba、Ryo Yamada、Mitsuya Mori、Kosuke Yanagiya、Ryota Moriuchi、Masahiro Yuki、Hideo Dohra、Hiroyuki Futamata、Moriya Ohkuma、Kazuhide Kimbara、Masaki Shintani
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology

      Volume: 88(18) Pages: e0111422

    • DOI

      10.1128/aem.01114-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Replicon hypothesis revisited2022

    • Author(s)
      Hisao Masai
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 633 Pages: 77~80

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.09.060

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mirage 2.0: fast and memory-efficient reconstruction of gene-content evolution considering heterogeneous evolutionary patterns among gene families2022

    • Author(s)
      Tsukasa Fukunaga、Wataru Iwasaki
    • Journal Title

      Bioinformatics

      Volume: 38 Pages: 4039~4041

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac433

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] LinAliFold and CentroidLinAliFold: fast RNA consensus secondary structure prediction for aligned sequences using beam search methods2022

    • Author(s)
      Tsukasa Fukunaga、Michiaki Hamada
    • Journal Title

      Bioinformatics Advances

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1093/bioadv/vbac078

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Prediction of RNA-protein interactions using a nucleotide language model2022

    • Author(s)
      Keisuke Yamada、Michiaki Hamada
    • Journal Title

      Bioinformatics Advances

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1093/bioadv/vbac023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Notch Missense Mutations in Drosophila Reveal Functions of Specific EGF-like Repeats in Notch Folding, Trafficking, and Signaling2022

    • Author(s)
      Hilman Nurmahdi、Mao Hasegawa、Elzava Yuslimatin Mujizah、Takeshi Sasamura、Mikiko Inaki、Shinya Yamamoto、Tomoko Yamakawa、Kenji Matsuno
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 12 Pages: 1752

    • DOI

      10.3390/biom12121752

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Pancreatic Cancer Research beyond DNA Mutations2022

    • Author(s)
      Hiromichi Sato、Kazuki Sasaki、Tomoaki Hara、Yoshiko Tsuji、Yasuko Arao、Chihiro Otsuka、Yumiko Hamano、Mirei Ogita、Shogo Kobayashi、Eric di Luccio、Takaaki Hirotsu、Yuichiro Doki、Hidetoshi Eguchi、Taroh Satoh、Shizuka Uchida、Hideshi Ishii
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 12 Pages: 1503

    • DOI

      10.3390/biom12101503

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Newtic1 Is a Component of Globular Structures That Accumulate along the Marginal Band of Erythrocytes in the Limb Blastema of Adult Newt, Cynops pyrrhogaster2022

    • Author(s)
      Xutong Chen、Ryo Ando、Roman Martin Casco-Robles、Martin Miguel Casco-Robles、Fumiaki Maruo、Shuichi Obata、Chikafumi Chiba
    • Journal Title

      Biomedicines

      Volume: 10 Pages: 2772

    • DOI

      10.3390/biomedicines10112772

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] RNA Modification in Inflammatory Bowel Diseases2022

    • Author(s)
      Mika Nakayama、Yuki Ozato、Yoshiko Tsuji、Yasuko Arao、Chihiro Otsuka、Yumiko Hamano、Genzo Sumi、Ken Ofusa、Shizuka Uchida、Andrea Vecchione、Hideshi Ishii
    • Journal Title

      Biomedicines

      Volume: 10 Pages: 1695

    • DOI

      10.3390/biomedicines10071695

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Aberrant EVI1 splicing contributes to EVI1-rearranged leukemia2022

    • Author(s)
      Atsushi Tanaka、Taizo A. Nakano、Masaki Nomura、Hiromi Yamazaki、Jan P. Bewersdorf、Roger Mulet-Lazaro、Simon Hogg、Bo Liu、Alex Penson、Akihiko Yokoyama、Weijia Zang、Marije Havermans、Miho Koizumi、Yasutaka Hayashi、Hana Cho、Akinori Kanai、Stanley C. Lee、Muran Xiao、Miki Fukumoto、Yumi Aoyama、Daichi Inoue et al.
    • Journal Title

      Blood

      Volume: 140 Pages: 875~888

    • DOI

      10.1182/blood.2021015325

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Association Between Diet and Fusobacterium nucleatum in the Feces of Healthy Adults: A Hospital-based Cross-sectional Study2022

    • Author(s)
      Nobuhiro Narii、Ling Zha、Tomotaka Sobue、Tetsuhisa Kitamura、Satoshi Shiba、Sayaka Mizutani、Takuji Yamada、Shinichi Yachida
    • Journal Title

      Cancer Prevention Research

      Volume: 16 Pages: 119~126

    • DOI

      10.1158/1940-6207.capr-22-0399

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ2022

    • Author(s)
      Momoko Tokura、Jun Nakayama、Marta Prieto-Vila、Sho Shiino、Masayuki Yoshida、Tomofumi Yamamoto、Naoaki Watanabe、Shin Takayama、Yutaka Suzuki、Koji Okamoto、Takahiro Ochiya、Takashi Kohno、Yasushi Yatabe、Akihiko Suto、Yusuke Yamamoto
    • Journal Title

      Cancer Research

      Volume: 82 Pages: 3236~3248

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-22-0090

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HNF1B‐driven three‐dimensional chromatin structure for molecular classification in pancreatic cancers2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Kato、Keisuke Tateishi、Dosuke Iwadate、Keisuke Yamamoto、Hiroaki Fujiwara、Takuma Nakatsuka、Yotaro Kudo、Yoku Hayakawa、Hideaki Ijichi、Motoyuki Otsuka、Takahiro Kishikawa、Ryota Takahashi、Koji Miyabayashi、Yousuke Nakai、Yoshihiro Hirata、Atsushi Toyoda、Shinichi Morishita、Mitsuhiro Fujishiro
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Pages: 1672~1685

    • DOI

      10.1111/cas.15690

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Carcinogenesis resistance in the longest-lived rodent, the naked mole-rat2022

    • Author(s)
      Yuki Yamamura、Yoshimi Kawamura、Kaori Oka、Kyoko Miura
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 4030~4036

    • DOI

      10.1111/cas.15570

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Circulating cancer-associated extracellular vesicles as early detection and recurrence biomarkers for pancreatic cancer2022

    • Author(s)
      Yusuke Yoshioka、Manami Shimomura、Keigo Saito、Hideshi Ishii、Yuichiro Doki、Hidetoshi Eguchi、Tetsuya Nakatsura、Takao Itoi、Masahiko Kuroda、Masaki Mori、Takahiro Ochiya
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 3498~3509

    • DOI

      10.1111/cas.15500

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] High levels of chromosomal instability facilitate the tumor growth and sphere formation2022

    • Author(s)
      Kenji Iemura、Hayato Anzawa、Ryo Funayama、Runa Iwakami、Keiko Nakayama、Kengo Kinoshita、Kozo Tanaka
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 2727~2737

    • DOI

      10.1111/cas.15457

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Runx2 regulates chromatin accessibility to direct the osteoblast program at neonatal stages2022

    • Author(s)
      Hironori Hojo、Taku Saito、Xinjun He、Qiuyu Guo、Shoko Onodera、Toshifumi Azuma、Michinori Koebis、Kazuki Nakao、Atsu Aiba、Masahide Seki、Yutaka Suzuki、Hiroyuki Okada、Sakae Tanaka、Ung-il Chung、Andrew P. McMahon、Shinsuke Ohba
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Pages: 111315

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111315

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A bifurcation concept for B-lymphoid/plasmacytoid dendritic cells with largely fluctuating transcriptome dynamics2022

    • Author(s)
      Keiki Nagaharu、Yasuhiro Kojima、Haruka Hirose、Kodai Minoura、Kunihiko Hinohara、Hirohito Minami、Yuki Kageyama、Yuka Sugimoto、Masahiro Masuya、Shigeru Nii、Masahide Seki、Yutaka Suzuki、Isao Tawara、Teppei Shimamura、Naoyuki Katayama、Hiroyoshi Nishikawa、Kohshi Ohishi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Pages: 111260

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111260

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genomic analysis of an aggressive case with metastatic intrahepatic mucinous cholangiocarcinoma2022

    • Author(s)
      Yoshiharu Masaki、Noriyuki Akutsu、Yasushi Adachi、Keisuike Ishigami、Norikazu Iwata、Takao Endo、Yoshifumi Ishii、Yasushi Sasaki、Minoru Nagayama、Yasutoshi Kimura、Hiroshi Nakase
    • Journal Title

      Clinical Journal of Gastroenterology

      Volume: 15 Pages: 809~817

    • DOI

      10.1007/s12328-022-01649-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Helicobacter pylori Infection, Its Laboratory Diagnosis, and Antimicrobial Resistance: a Perspective of Clinical Relevance2022

    • Author(s)
      Shamshul Ansari、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      Clinical Microbiology Reviews

      Volume: 35 Pages: -

    • DOI

      10.1128/cmr.00258-21

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Single-cell transcriptomics of the goldfish retina reveals genetic divergence in the asymmetrically evolved subgenomes after allotetraploidization2022

    • Author(s)
      Tetsuo Kon、Kentaro Fukuta、Zelin Chen、Koto Kon-Nanjo、Kota Suzuki、Masakazu Ishikawa、Hikari Tanaka、Shawn M. Burgess、Hideki Noguchi、Atsushi Toyoda、Yoshihiro Omori
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5(1) Pages: 1404

    • DOI

      10.1038/s42003-022-04351-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Bayesian statistical method for detecting structural and topological diversity in polymorphic proteins2022

    • Author(s)
      Shuto Hayashi、Jun Koseki、Teppei Shimamura
    • Journal Title

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      Volume: 20 Pages: 6519~6525

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2022.11.038

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Paternally inherited H3K27me3 affects chromatin accessibility in mouse embryos produced by round spermatid injection2022

    • Author(s)
      Mizuki Sakamoto、Daiyu Ito、Rei Inoue、Sayaka Wakayama、Yasuyuki Kikuchi、Li Yang、Erika Hayashi、Rina Emura、Hirosuke Shiura、Takashi Kohda、Satoshi H. Namekawa、Takashi Ishiuchi、Teruhiko Wakayama、Masatoshi Ooga
    • Journal Title

      Development

      Volume: 149(18) Pages: dev200696

    • DOI

      10.1242/dev.200696

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cellular responses in the FGF10 ‐mediated improvement of hindlimb regenerative capacity inXenopus laevis revealed by single‐cell transcriptomics2022

    • Author(s)
      Nodoka Yanagi、Sumika Kato、Taro Fukazawa、Takeo Kubo
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation

      Volume: 64 Pages: 266~278

    • DOI

      10.1111/dgd.12795

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TrBase: A genome and transcriptome database of Temnopleurus reevesii2022

    • Author(s)
      Sonoko Kinjo、Masato Kiyomoto、Haruka Suzuki、Takashi Yamamoto、Kazuho Ikeo、Shunsuke Yaguchi
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation

      Volume: 64 Pages: 210~218

    • DOI

      10.1111/dgd.12780

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chromosome-scale genome assembly of a Japanese chili pepper landrace, Capsicum annuum ‘Takanotsume’2022

    • Author(s)
      Kenta Shirasawa、Munetaka Hosokawa、Yasuo Yasui、Atsushi Toyoda、Sachiko Isobe
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 30 Pages: dsac052

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac052

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chromosome-scale genome assembly of Glycyrrhiza uralensis revealed metabolic gene cluster centred specialized metabolites biosynthesis2022

    • Author(s)
      Amit Rai、Hideki Hirakawa、Megha Rai、Yohei Shimizu、Kenta Shirasawa、Shinji Kikuchi、Hikaru Seki、Mami Yamazaki、Atsushi Toyoda、Sachiko Isobe、Toshiya Muranaka、Kazuki Saito
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 29(6) Pages: dsac043

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac043

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of a genome-wide marker design workflow for onions and its application in target amplicon sequencing-based genotyping2022

    • Author(s)
      Daisuke Sekine、Satoshi Oku、Tsukasa Nunome、Hideki Hirakawa、Mai Tsujimura、Toru Terachi、Atsushi Toyoda、Masayoshi Shigyo、Shusei Sato、Hikaru Tsukazaki
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 29(5) Pages: dsac020

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac020

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Whole-genome sequencing analysis and protocol for RNA interference of the endoparasitoid wasp Asobara japonica2022

    • Author(s)
      Takumi Kamiyama、Yuko Shimada-Niwa、Hiroyuki Tanaka、Minami Katayama、Takayoshi Kuwabara、Hitoha Mori、Akari Kunihisa、Takehiko Itoh、Atsushi Toyoda、Ryusuke Niwa
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 29(4) Pages: dsac019

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac019

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spatial and single-cell transcriptome analysis reveals changes in gene expression in response to drug perturbation in rat kidney2022

    • Author(s)
      Naoki Onoda、Ayako Kawabata、Kumi Hasegawa、Megumi Sakakura、Itaru Urakawa、Masahide Seki、Junko Zenkoh、Ayako Suzuki、Yutaka Suzuki
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 29(2) Pages: dsac007

    • DOI

      10.1093/dnares/dsac007

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Glutamine synthetase mRNA releases sRNA from its 3′UTR to regulate carbon/nitrogen metabolic balance in Enterobacteriaceae2022

    • Author(s)
      Masatoshi Miyakoshi、Teppei Morita、Asaki Kobayashi、Anna Berger、Hiroki Takahashi、Yasuhiro Gotoh、Tetsuya Hayashi、Kan Tanaka
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 11 Pages: e82411

    • DOI

      10.7554/elife.82411

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Helicobacter pylori prevalence in Indonesia: Higher infection risk in Eastern region population2022

    • Author(s)
      Hasan Maulahela、Dalla Doohan、Yudith Annisa Ayu Rezkhita、Ari Fahrial Syam、Langgeng Agung Waskito、Camilia Metadea Aji Savitri、Marselino Richardo、Abdul Rahman、Yoma Sari Namara、Hamzah Shatri、Andri Sanityoso、Gontar Alamsyah Siregar、Eko Sudarmo、Tomohisa Uchida、Yoshio Yamaoka、Muhammad Miftahussurur et al.
    • Journal Title

      F1000Research

      Volume: 11 Pages: 1581

    • DOI

      10.12688/f1000research.127094.1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Squalomix: shark and ray genome analysis consortium and its data sharing platform2022

    • Author(s)
      Osamu Nishimura、John Rozewicki、Kazuaki Yamaguchi、Kaori Tatsumi、Yuta Ohishi、Tazro Ohta、Masaru Yagura、Taiki Niwa、Chiharu Tanegashima、Akinori Teramura、Shotaro Hirase、Akane Kawaguchi、Milton Tan、Salvatore D'Aniello、Filipe Castro、Andre Machado、Mitsumasa Koyanagi、Atsushi Toyoda、Shigehiro Kuraku et al.
    • Journal Title

      F1000Research

      Volume: 11 Pages: 1077

    • DOI

      10.12688/f1000research.123591.1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Notch Signalling Under Maternal-to-Zygotic Transition2022

    • Author(s)
      Tomoko Yamakawa、Elzava Yuslimatin Mujizah、Kenji Matsuno
    • Journal Title

      Fly

      Volume: 16 Pages: 347~359

    • DOI

      10.1080/19336934.2022.2139981

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A region-dependent allele-biased expression of Dopa decarboxylase in mouse brain2022

    • Author(s)
      Kit-Yeng Sheng、Toru Nakano、Shinpei Yamaguchi
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 10 Pages: 1078927

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.1078927

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Genetic dissection of innate immune memory in Drosophila melanogaster2022

    • Author(s)
      Chang Tang、Shoichiro Kurata、Naoyuki Fuse
    • Journal Title

      Frontiers in Immunology

      Volume: 13 Pages: 857707

    • DOI

      10.3389/fimmu.2022.857707

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] doublesex Controls Both Hindwing and Abdominal Mimicry Traits in the Female-Limited Batesian Mimicry of Papilio memnon2022

    • Author(s)
      Shinya Komata、Chung-Ping Lin、Haruhiko Fujiwara
    • Journal Title

      Frontiers in Insect Science

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.3389/finsc.2022.929518

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Unique role of DDX41, a DEAD-box type RNA helicase, in hematopoiesis and leukemogenesis2022

    • Author(s)
      Satoru Shinriki、Hirotaka Matsui
    • Journal Title

      Frontiers in Oncology

      Volume: 12 Pages: 992340

    • DOI

      10.3389/fonc.2022.992340

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Targeting the regulation of aberrant protein production pathway in gastrointestinal cancer treatment2022

    • Author(s)
      Hiromichi Sato、Kazuki Sasaki、Tomoaki Hara、Shogo Kobayashi、Yuichiro Doki、Hidetoshi Eguchi、Taroh Satoh、Hideshi Ishii
    • Journal Title

      Frontiers in Oncology

      Volume: 12 Pages: 1018333

    • DOI

      10.3389/fonc.2022.1018333

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Emerging roles of long noncoding and circular RNAs in pancreatic ductal adenocarcinoma2022

    • Author(s)
      Hiromichi Sato、Tomoaki Hara、Shotaro Tatekawa、Kazuki Sasaki、Shogo Kobayashi、Toru Kitagawa、Yuichiro Doki、Hidetoshi Eguchi、Kazuhiko Ogawa、Shizuka Uchida、Hideshi Ishii
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 13 Pages: 1025923

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.1025923

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phenolic signals for prehaustorium formation in Striga hermonthica2022

    • Author(s)
      Natsumi Aoki、Songkui Cui、Chiharu Ito、Kie Kumaishi、Shungo Kobori、Yasunori Ichihashi、Satoko Yoshida
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 1077996

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.1077996

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An open and continuously updated fern tree of life2022

    • Author(s)
      Joel H. Nitta、Eric Schuettpelz、Santiago Ramirez-Barahona、Wataru Iwasaki
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 909768

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.909768

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Regulatory Modules Involved in the Degradation and Modification of Host Cell Walls During Cuscuta campestris Invasion2022

    • Author(s)
      Ryusuke Yokoyama、Toshiya Yokoyama、Takeshi Kuroha、Jihwan Park、Koh Aoki、Kazuhiko Nishitani
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 904313

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.904313

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] De novo transgenerational inheritance of male rat hyperactivity by rotenone2022

    • Author(s)
      Masami Ishido
    • Journal Title

      Fund Toxicol Sci

      Volume: 9 Pages: 111~115

    • DOI

      10.2131/fts.9.111

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of Quiescent LGR5 Stem Cells in the Human Colon2022

    • Author(s)
      Keiko Ishikawa、Shinya Sugimoto、Mayumi Oda、Masayuki Fujii、Sirirat Takahashi、Yuki Ohta、Ai Takano、Kazuhiro Ishimaru、Mami Matano、Kosuke Yoshida、Hikaru Hanyu、Kohta Toshimitsu、Kazuaki Sawada、Mariko Shimokawa、Megumu Saito、Kenta Kawasaki、Ryota Ishii、Koji Taniguchi、Takeshi Imamura、Takanori Kanai、Toshiro Sato
    • Journal Title

      Gastroenterology

      Volume: 163 Pages: 1391~1406.e24

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2022.07.081

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional unit of supergene in female-limited Batesian mimicry of Papilio polytes2022

    • Author(s)
      Shinya Komata、Shinichi Yoda、Yusuke KonDo、Souta Shinozaki、Kouki Tamai、Haruhiko Fujiwara
    • Journal Title

      Genetics

      Volume: - Pages: iyac177

    • DOI

      10.1093/genetics/iyac177

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assessing reproducibility of inherited variants detected with short-read whole genome sequencing2022

    • Author(s)
      Bohu Pan、Luyao Ren、Vitor Onuchic、Meijian Guan、Rebecca Kusko、Steve Bruinsma、Len Trigg、Andreas Scherer、Baitang Ning、Chaoyang Zhang、Christine Glidewell-Kenney、Chunlin Xiao、Eric Donaldson、Fritz J. Sedlazeck、Gary Schroth、Gokhan Yavas、Haiying Grunenwald、Haodong Chen、Yoichi Gondo、Huixiao Hong et al.
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 23(1) Pages: 2

    • DOI

      10.1186/s13059-021-02569-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Gene recruitments and dismissals in the argonaut genome provide insights into pelagic lifestyle adaptation and shell-like eggcase reacquisition2022

    • Author(s)
      Masa aki Yoshida、Kazuki Hirota、Junichi Imoto、Miki Okuno、Hiroyuki Tanaka、Rei Kajitani、Atsushi Toyoda、Takehiko Itoh、Kazuho Ikeo、Takenori Sasaki、Davin H E Setiamarga
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 14(11) Pages: evac140

    • DOI

      10.1093/gbe/evac140

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Local Adaptation and the Evolution of Genome Architecture in Threespine Stickleback2022

    • Author(s)
      Qiushi Li、Dorothea Lindtke、Carlos Rodriguez-Ramirez、Ryo Kakioka、Hiroshi Takahashi、Atsushi Toyoda、Jun Kitano、Rachel L. Ehrlich、Joshua Chang Mell、Sam Yeaman
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 14(6) Pages: evac075

    • DOI

      10.1093/gbe/evac075

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Analysis of gastric microbiota and Helicobacter pylori infection in gastroesophageal reflux disease2022

    • Author(s)
      Titong Sugihartono、Kartika Afrida Fauzia、Muhammad Miftahussurur、Langgeng Agung Waskito、Purwo Sri Rejeki、Reny I’tishom、Ricky Indra Alfaray、Dalla Doohan、Rizki Amalia、Camilia Metadea Aji Savitri、Yudith Annisa Ayu Rezkitha、Junko Akada、Takashi Matsumoto、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      Gut Pathogens

      Volume: 14(1) Pages: 38

    • DOI

      10.1186/s13099-022-00510-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multiomics identifies the link between intratumor steatosis and the exhausted tumor immune microenvironment in hepatocellular carcinoma2022

    • Author(s)
      Hiroki Murai、Takahiro Kodama、Kazuki Maesaka、Shoichiro Tange、Daisuke Motooka、Yutaka Suzuki、Yasuyuki Shigematsu、Kentaro Inamura、Yoshihiro Mise、Akio Saiura、Yoshihiro Ono、Yu Takahashi、Yota Kawasaki、Satoshi Iino、Shogo Kobayashi、Masashi Idogawa、Takashi Tokino、Tomomi Hashidate‐Yoshida、Tetsuo Takehara et al.
    • Journal Title

      Hepatology

      Volume: 77(1) Pages: 77~91

    • DOI

      10.1002/hep.32573

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A heterozygous GRID2 mutation in autosomal dominant cerebellar ataxia2022

    • Author(s)
      Kishin Koh、Haruo Shimazaki、Matsuo Ogawa、Yoshihisa Takiyama
    • Journal Title

      Human Genome Variation

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41439-022-00204-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Thymic self-antigen expression for immune tolerance and surveillance2022

    • Author(s)
      Rayene Benlaribi、Qiao Gou、Hiroyuki Takaba
    • Journal Title

      Inflammation and Regeneration

      Volume: 42 Pages: 28

    • DOI

      10.1186/s41232-022-00211-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae)2022

    • Author(s)
      Kakeru Yokoi、Seiichi Furukawa、Rui Zhou、Akiya Jouraku、Hidemasa Bono
    • Journal Title

      Insects

      Volume: 13 Pages: 1172

    • DOI

      10.3390/insects13121172

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mediation effect of intestinal microbiota on the relationship between fiber intake and colorectal cancer2022

    • Author(s)
      Yoshimitsu Shimomura、Ling Zha、Sho Komukai、Nobuhiro Narii、Tomotaka Sobue、Tetsuhisa Kitamura、Satoshi Shiba、Sayaka Mizutani、Takuji Yamada、Norie Sawada、Shinichi Yachida
    • Journal Title

      International Journal of Cancer

      Volume: 152 Pages: 1752~1762

    • DOI

      10.1002/ijc.34398

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Profiling a single-stranded DNA region within an rDNA segment that affects the loading of bacterial condensin2022

    • Author(s)
      Koichi Yano、Hideki Noguchi、Hironori Niki
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 105504

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105504

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Establishment of a reference single-cell RNA sequencing dataset for human pancreatic adenocarcinoma2022

    • Author(s)
      Ryota Chijimatsu、Shogo Kobayashi、Yu Takeda、Masatoshi Kitakaze、Shotaro Tatekawa、Yasuko Arao、Mika Nakayama、Naohiro Tachibana、Taku Saito、Daisuke Ennishi、Shuta Tomida、Kazuki Sasaki、Daisaku Yamada、Yoshito Tomimaru、Hidenori Takahashi、Daisuke Okuzaki、Daisuke Motooka、Yutaka Suzuki、Hideshi Ishii et al.
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104659

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104659

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism in the short-day plant Lemna aequinoctialis2022

    • Author(s)
      Tomoaki Muranaka、Shogo Ito、Hiroshi Kudoh、Tokitaka Oyama
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104634

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104634

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Helicobacter pylori genomes reveal Paleolithic human migration to the east end of Asia2022

    • Author(s)
      Rumiko Suzuki、Naruya Saitou、Osamu Matsuari、Seiji Shiota、Takashi Matsumoto、Junko Akada、Nagisa Kinjo、Fukunori Kinjo、Kuniko Teruya、Makiko Shimoji、Akino Shiroma、Mototsugu Kato、Kazuhito Satou、Takashi Hirano、Masahiro Asaka、Kirill Kryukov、Yoshan Moodley、Yoshio Yamaoka
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104477

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104477

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Vulcanimicrobium alpinus gen. nov. sp. nov., the first cultivated representative of the candidate phylum “Eremiobacterota”, is a metabolically versatile aerobic anoxygenic phototroph2022

    • Author(s)
      Shuhei Yabe、Kiyoaki Muto、Keietsu Abe、Akira Yokota、Hubert Staudigel、Bradley M. Tebo
    • Journal Title

      ISME Communications

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s43705-022-00201-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Unexpected absence of ribosomal protein genes from metagenome-assembled genomes2022

    • Author(s)
      Kazumori Mise、Wataru Iwasaki
    • Journal Title

      ISME Communications

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s43705-022-00204-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Unraveling unique features of plasma cell clones in POEMS syndrome with single-cell analysis2022

    • Author(s)
      Yusuke Isshiki、Motohiko Oshima、Naoya Mimura、Kensuke Kayamori、Yurie Miyamoto-Nagai、Masahide Seki、Yaeko Nakajima-Takagi、Takashi Kanamori、Eisuke Iwamoto、Tomoya Muto、Shokichi Tsukamoto、Yusuke Takeda、Chikako Ohwada、Sonoko Misawa、Jun-ichiro Ikeda、Masashi Sanada、Yutaka Suzuki、Atsushi Iwama et al.
    • Journal Title

      JCI Insight

      Volume: 7(20) Pages: e151482

    • DOI

      10.1172/jci.insight.151482

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Foxc1 and Foxc2 are indispensable for the maintenance of nephron and stromal progenitors in the developing kidney2022

    • Author(s)
      Masaru Motojima、Masayuki Tanaka、Tsutomu Kume
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 135(19) Pages: jcs260356

    • DOI

      10.1242/jcs.260356

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation2022

    • Author(s)
      Yukari Tanaka、Riu Yamashita、Junko Kawashima、Hiroshi Mori、Ken Kurokawa、Shinji Fukuda、Yasuhiro Gotoh、Keiji Nakamura、Tetsuya Hayashi、Yoshiyuki Kasahara、Yukuto Sato、Shin Fukudo
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology

      Volume: 57 Pages: 748~760

    • DOI

      10.1007/s00535-022-01888-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comprehensive analysis of alternative splicing coupled with nonsense-mediated mRNA decay (AS-NMD) in C. elegans2022

    • Author(s)
      Hidehito Kuroyanagi
    • Journal Title

      Journal of Japanese Biochemical Society

      Volume: 94 Pages: 868~874

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2022.940868

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DDX41 coordinates RNA splicing and transcriptional elongation to prevent DNA replication stress in hematopoietic cells2022

    • Author(s)
      Satoru Shinriki、Mayumi Hirayama、Akiko Nagamachi、Akihiko Yokoyama、Takeshi Kawamura、Akinori Kanai、Hidehiko Kawai、Junichi Iwakiri、Rin Liu、Manabu Maeshiro、Saruul Tungalag、Masayoshi Tasaki、Mitsuharu Ueda、Kazuhito Tomizawa、Naoyuki Kataoka、Takashi Ideue、Yutaka Suzuki、Kiyoshi Asai、Hirotaka Matsui et al.
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 36 Pages: 2605~2620

    • DOI

      10.1038/s41375-022-01708-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Histone Modification Analysis of Low-Mappability Regions2022

    • Author(s)
      Naoko Yoshizawa-Sugata、Hisao Masai
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: - Pages: 163~185

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2433-3_18

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High-Quality Genome Sequence of Cystobasidium tubakii JCM 31526 T, Isolated from East Ongul Island, Antarctica2022

    • Author(s)
      Masaharu Tsuji、Jun-ichi Ishihara、Atsushi Toyoda、Hiroki Takahashi
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11(10) Pages: e0074122

    • DOI

      10.1128/mra.00741-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Hyaluronate Lyase HysA- and HysB-Producing, Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Sequence Type 30, Staphylococcal Cassette Chromosome mec Type IVc Strain Isolated from Furunculosis in Japan2022

    • Author(s)
      Yuma Koizumi、Junzo Hisatsune、Atsushi Toyoda、Osamu Yamasaki、Jun Kaneko、Motoyuki Sugai
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11(9) Pages: e0030822

    • DOI

      10.1128/mra.00308-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Draft Genome Sequences of Five Cystobasidium ongulense Strains Isolated from Areas near Syowa Station, East Antarctica2022

    • Author(s)
      Masaharu Tsuji、Jun-ichi Ishihara、Yasuhiro Gotoh、Tetsuya Hayashi、Hiroki Takahashi
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 11(7) Pages: e0022422

    • DOI

      10.1128/mra.00224-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evolutionary History of Sexual Differentiation Mechanism in Insects2022

    • Author(s)
      Yasuhiko Chikami、Miki Okuno、Atsushi Toyoda、Takehiko Itoh、Teruyuki Niimi
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 39 Pages: msac145

    • DOI

      10.1093/molbev/msac145

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Estrogen receptor α K303R mutation reorganizes its binding to forkhead box protein A1 regions and induces chromatin opening2022

    • Author(s)
      Tomoyoshi Nakadai、Liying Yang、Kohei Kumegawa、Reo Maruyama
    • Journal Title

      Molecular Biology Reports

      Volume: 50 Pages: 1209~1220

    • DOI

      10.1007/s11033-022-08089-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Integrative omics indicate FMRP sequesters mRNA from translation and deadenylation in human neuronal cells2022

    • Author(s)
      Tatsuaki Kurosaki、Shuhei Mitsutomi、Alexander Hewko、Nobuyoshi Akimitsu、Lynne E. Maquat
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 82 Pages: 4564~4581.e11

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.10.018

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of ancestral sex chromosomes in the frogGlandirana rugosa bearing XX‐XY and ZZ‐ZW sex‐determining systems2022

    • Author(s)
      Ikuo Miura、Foyez Shams、Daniel Lee Jeffries、Yukako Katsura、Shuuji Mawaribuchi、Nicolas Perrin、Michihiko Ito、Mitsuaki Ogata、Tariq Ezaz
    • Journal Title

      Molecular Ecology

      Volume: 31 Pages: 3859~3870

    • DOI

      10.1111/mec.16551

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Long-Read-Resolved, Ecosystem-Wide Exploration of Nucleotide and Structural Microdiversity of Lake Bacterioplankton Genomes2022

    • Author(s)
      Yusuke Okazaki、Shin-ichi Nakano、Atsushi Toyoda、Hideyuki Tamaki
    • Journal Title

      mSystems

      Volume: 7(4) Pages: e0043322

    • DOI

      10.1128/msystems.00433-22

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] PBSIM3: a simulator for all types of PacBio and ONT long reads2022

    • Author(s)
      Yukiteru Ono、Michiaki Hamada、Kiyoshi Asai
    • Journal Title

      NAR Genomics and Bioinformatics

      Volume: 4 Pages: -

    • DOI

      10.1093/nargab/lqac092

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Vasculature atrophy causes a stiffened microenvironment that augments epidermal stem cell differentiation in aged skin2022

    • Author(s)
      Ryo Ichijo、Koichiro Maki、Mio Kabata、Teruasa Murata、Arata Nagasaka、Seiichiro Ishihara、Hisashi Haga、Tetsuya Honda、Taiji Adachi、Takuya Yamamoto、Fumiko Toyoshima
    • Journal Title

      Nature Aging

      Volume: 2 Pages: 592~600

    • DOI

      10.1038/s43587-022-00244-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global landscape of replicative DNA polymerase usage in the human genome2022

    • Author(s)
      Eri Koyanagi、Yoko Kakimoto、Tamiko Minamisawa、Fumiya Yoshifuji、Toyoaki Natsume、Atsushi Higashitani、Tomoo Ogi、Antony M. Carr、Masato T. Kanemaki、Yasukazu Daigaku
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 7221

    • DOI

      10.1038/s41467-022-34929-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Repeated out-of-Africa expansions of Helicobacter pylori driven by replacement of deleterious mutations2022

    • Author(s)
      Harry A. Thorpe、Elise Tourrette、Koji Yahara、Filipa F. Vale、Siqi Liu、Monica Oleastro、Teresa Alarcon、Tsachi-Tsadok Perets、Saeid Latifi-Navid、Yoshio Yamaoka、Beatriz Martinez-Gonzalez、Ioannis Karayiannis、Timokratis Karamitros、Dionyssios N. Sgouras、Wael Elamin、Ben Pascoe、Daniel Falush et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 6842

    • DOI

      10.1038/s41467-022-34475-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The N6-methyladenosine methyltransferase METTL16 enables erythropoiesis through safeguarding genome integrity2022

    • Author(s)
      Masanori Yoshinaga、Kyuho Han、David W. Morgens、Takuro Horii、Ryosuke Kobayashi、Tatsuaki Tsuruyama、Fabian Hia、Shota Yasukura、Asako Kajiya、Ting Cai、Pedro H. C. Cruz、Alexis Vandenbon、Yutaka Suzuki、Yukio Kawahara、Izuho Hatada、Michael C. Bassik、Osamu Takeuchi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 6435

    • DOI

      10.1038/s41467-022-34078-y

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An analysis modality for vascular structures combining tissue-clearing technology and topological data analysis2022

    • Author(s)
      Kei Takahashi、Ko Abe、Shimpei I. Kubota、Noriaki Fukatsu、Yasuyuki Morishita、Yasuhiro Yoshimatsu、Satoshi Hirakawa、Yoshiaki Kubota、Tetsuro Watabe、Shogo Ehata、Hiroki R. Ueda、Teppei Shimamura、Kohei Miyazono
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 5239

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32848-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strigolactones are chemoattractants for host tropism in Orobanchaceae parasitic plants2022

    • Author(s)
      Satoshi Ogawa、Songkui Cui、Alexandra R. F. White、David C. Nelson、Satoko Yoshida、Ken Shirasu
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 4653

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32314-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Glutamine deficiency in solid tumor cells confers resistance to ribosomal RNA synthesis inhibitors2022

    • Author(s)
      Melvin Pan、Christiane Zorbas、Maki Sugaya、Kensuke Ishiguro、Miki Kato、Miyuki Nishida、Hai-Feng Zhang、Marco M. Candeias、Akimitsu Okamoto、Takamasa Ishikawa、Tomoyoshi Soga、Hiroyuki Aburatani、Juro Sakai、Yoshihiro Matsumura、Tsutomu Suzuki、Christopher G. Proud、Denis L. J. Lafontaine、Tsuyoshi Osawa
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 3706

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31418-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nitrogen represses haustoria formation through abscisic acid in the parasitic plant Phtheirospermum japonicum2022

    • Author(s)
      Anna Kokla、Martina Leso、Xiang Zhang、Jan Simura、Phanu T. Serivichyaswat、Songkui Cui、Karin Ljung、Satoko Yoshida、Charles W. Melnyk
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 2976

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30550-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The 3′ Pol II pausing at replication-dependent histone genes is regulated by Mediator through Cajal bodies’ association with histone locus bodies2022

    • Author(s)
      Hidefumi Suzuki、Ryota Abe、Miho Shimada、Tomonori Hirose、Hiroko Hirose、Keisuke Noguchi、Yoko Ike、Nanami Yasui、Kazuki Furugori、Yuki Yamaguchi、Atsushi Toyoda、Yutaka Suzuki、Tatsuro Yamamoto、Noriko Saitoh、Shigeo Sato、Chieri Tomomori-Sato、Ronald C. Conaway、Joan W. Conaway、Hidehisa Takahashi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 2905

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30632-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Selective translation of epigenetic modifiers affects the temporal pattern and differentiation of neural stem cells2022

    • Author(s)
      Quan Wu、Yuichi Shichino、Takaya Abe、Taeko Suetsugu、Ayaka Omori、Hiroshi Kiyonari、Shintaro Iwasaki、Fumio Matsuzaki
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13(1) Pages: 470

    • DOI

      10.1038/s41467-022-28097-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single mutation makes Escherichia coli an insect mutualist2022

    • Author(s)
      Ryuichi Koga、Minoru Moriyama、Naoko Onodera-Tanifuji、Yoshiko Ishii、Hiroki Takai、Masaki Mizutani、Kohei Oguchi、Reiko Okura、Shingo Suzuki、Yasuhiro Gotoh、Tetsuya Hayashi、Masahide Seki、Yutaka Suzuki、Yudai Nishide、Takahiro Hosokawa、Yuichi Wakamoto、Chikara Furusawa、Takema Fukatsu
    • Journal Title

      Nature Microbiology

      Volume: 7 Pages: 1141~1150

    • DOI

      10.1038/s41564-022-01179-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Expression profile analysis in cells overexpressing DRPLA cDNA to explore the roles of DRPLAp as a transcriptional coregulator2022

    • Author(s)
      Keiko Hatano、Hidetoshi Date、Hiroyuki Ishiura、Takashi Matsukawa、Masaki Tanaka、Jun Mitsui、Jun Goto、Jun Yoshimura、Koichiro Doi、Shinichi Morishita、Shoji Tsuji
    • Journal Title

      Neurology and Clinical Neuroscience

      Volume: 10 Pages: 210~217

    • DOI

      10.1111/ncn3.12607

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MPP6 stimulates both RRP6 and DIS3 to degrade a specified subset of MTR4-sensitive substrates in the human nucleus2022

    • Author(s)
      Naoko Fujiwara、Maki Shigemoto、Mizuki Hirayama、Ken-ichi Fujita、Shigeto Seno、Hideo Matsuda、Masami Nagahama、Seiji Masuda
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 50 Pages: 8779~8806

    • DOI

      10.1093/nar/gkac559

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of Galectin-7 as a crucial metastatic enhancer of squamous cell carcinoma associated with immunosuppression2022

    • Author(s)
      Jianbo An、Yushi Nagaki、Satoru Motoyama、Yuta Kuze、Midori Hoshizaki、Kohei Kemuriyama、Tomokazu Yamaguchi、Takashi Ebihara、Yoshihiro Minamiya、Yutaka Suzuki、Yumiko Imai、Keiji Kuba
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: 41 Pages: 5319~5330

    • DOI

      10.1038/s41388-022-02525-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic architecture and functional unit of mimicry supergene in female limited Batesian mimic Papiliobutterflies2022

    • Author(s)
      Shinya Komata、Rei Kajitani、Takehiko Itoh、Haruhiko Fujiwara
    • Journal Title

      Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences

      Volume: 377(1856) Pages: 20210198

    • DOI

      10.1098/rstb.2021.0198

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MarpolBase Expression: A Web-Based, Comprehensive Platform for Visualization and Analysis of Transcriptomes in the Liverwort Marchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Shogo Kawamura、Facundo Romani、Masaru Yagura、Takako Mochizuki、Mika Sakamoto、Shohei Yamaoka、Ryuichi Nishihama、Yasukazu Nakamura、Katsuyuki T Yamato、John L Bowman、Takayuki Kohchi、Yasuhiro Tanizawa
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 63 Pages: 1745~1755

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac129

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Transcriptome dynamics of rice in natura : Response of above and below ground organs to microclimate2022

    • Author(s)
      Maya Matsunami、Mari Murai‐Hatano、Tsuneo Kuwagata、Uzuki Matsushima、Yoichi Hashida、Yoko Tominaga、Yusuke Masuya、Atsushi J. Nagano
    • Journal Title

      Plant, Cell & Environment

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/pce.14439

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transcriptome features of innate immune memory in Drosophila2022

    • Author(s)
      Naoyuki Fuse、Chisaki Okamori、Ryoma Okaji、Chang Tang、Kikuko Hirai、Shoichiro Kurata
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 18 Pages: e1010005

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1010005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Intraspecies variation of the mitochondrial genome: An evaluation for phylogenetic approaches based on the conventional choices of genes and segments on mitogenome2022

    • Author(s)
      Jesus Moron-Lopez、Karen Vergara、Masanao Sato、Gonzalo Gajardo、Shoko Ueki
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0273330

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0273330

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Turnover of mammal sex chromosomes in the Sry-deficient Amami spiny rat is due to male-specific upregulation of Sox92022

    • Author(s)
      Miho Terao、Yuya Ogawa、Shuji Takada、Rei Kajitani、Miki Okuno、Yuta Mochimaru、Kentaro Matsuoka、Takehiko Itoh、Atsushi Toyoda、Tomohiro Kono、Takamichi Jogahara、Shusei Mizushima、Asato Kuroiwa
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(49) Pages: e2211574119

    • DOI

      10.1073/pnas.2211574119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromatin structure undergoes global and local reorganization during murine dendritic cell development and activation2022

    • Author(s)
      Daisuke Kurotaki、Kenta Kikuchi、Kairong Cui、Wataru Kawase、Keita Saeki、Junpei Fukumoto、Akira Nishiyama、Kisaburo Nagamune、Keji Zhao、Keiko Ozato、Pedro P. Rocha、Tomohiko Tamura
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(34) Pages: e2207009119

    • DOI

      10.1073/pnas.2207009119

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Adrenergic receptor signaling induced by Klf15, a regulator of regeneration enhancer, promotes kidney reconstruction2022

    • Author(s)
      Nanoka Suzuki、Akinori Kanai、Yutaka Suzuki、Hajime Ogino、Haruki Ochi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(33) Pages: e2204338119

    • DOI

      10.1073/pnas.2204338119

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A genetically linked pair of NLR immune receptors shows contrasting patterns of evolution2022

    • Author(s)
      Motoki Shimizu、Akiko Hirabuchi、Yu Sugihara、Akira Abe、Takumi Takeda、Michie Kobayashi、Yukie Hiraka、Eiko Kanzaki、Kaori Oikawa、Hiromasa Saitoh、Thorsten Langner、Mark J. Banfield、Sophien Kamoun、Ryohei Terauchi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(27) Pages: e2116896119

    • DOI

      10.1073/pnas.2116896119

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover inTakifugupufferfish2022

    • Author(s)
      Ahammad Kabir、Risa Ieda、Sho Hosoya、Daigaku Fujikawa、Kazufumi Atsumi、Shota Tajima、Aoi Nozawa、Takashi Koyama、Shotaro Hirase、Osamu Nakamura、Mitsutaka Kadota、Osamu Nishimura、Shigehiro Kuraku、Yasukazu Nakamura、Hisato Kobayashi、Atsushi Toyoda、Satoshi Tasumi、Kiyoshi Kikuchi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(23) Pages: e2121469119

    • DOI

      10.1073/pnas.2121469119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic and transcriptomic analyses of the subterranean termite Reticulitermes speratus: Gene duplication facilitates social evolution2022

    • Author(s)
      Shuji Shigenobu、Yoshinobu Hayashi、Dai Watanabe、Gaku Tokuda、Masaru Y. Hojo、Kouhei Toga、Ryota Saiki、Hajime Yaguchi、Yudai Masuoka、Ryutaro Suzuki、Shogo Suzuki、Moe Kimura、Masatoshi Matsunami、Yasuhiro Sugime、Kohei Oguchi、Teruyuki Niimi、Hiroki Gotoh、Masaru K. Hojo、Atsushi Toyoda、Kiyoto Maekawa et al.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119(3) Pages: e2110361119

    • DOI

      10.1073/pnas.2110361119

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DETECTION OF TRANSGENERATIONAL GENETIC EFFECTS BASED ON WHOLE-GENOME SEQUENCING IN THE MOUSE MODEL2022

    • Author(s)
      Gondo Yoichi
    • Journal Title

      Radiation Protection Dosimetry

      Volume: 198 Pages: 1137~1142

    • DOI

      10.1093/rpd/ncac079

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A gene network of uterine luminal epithelium organizes mouse blastocyst implantation2022

    • Author(s)
      Shizu Aikawa、Yasushi Hirota、Yamato Fukui、Chihiro Ishizawa、Rei IIda、Tetsuaki Kaku、Tomoyuki Hirata、Shun Akaeda、Takehiro Hiraoka、Mitsunori Matsuo、Yutaka Osuga
    • Journal Title

      Reproductive Medicine and Biology

      Volume: 21(1) Pages: e12435

    • DOI

      10.1002/rmb2.12435

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNA Methylation and Histone Modification Are the Possible Regulators of Preimplantation Blastocyst Activation in Mice2022

    • Author(s)
      Daiki Hiratsuka、Shizu Aikawa、Yasushi Hirota、Yamato Fukui、Shun Akaeda、Takehiro Hiraoka、Mitsunori Matsuo、Yutaka Osuga
    • Journal Title

      Reproductive Sciences

      Volume: 30 Pages: 494~525

    • DOI

      10.1007/s43032-022-00988-x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SNP-based heritability estimates of gout and its subtypes determined by genome-wide association studies of clinically defined gout2022

    • Author(s)
      Yu Toyoda、Masahiro Nakatochi、Akiyoshi Nakayama、Yusuke Kawamura、Hirofumi Nakaoka、Kenji Wakai、Keitaro Matsuo、Hirotaka Matsuo、Kimiyoshi Ichida、Yukinori Okada、Tappei Takada、Seiko Shimizu、Yuya Shirai、Ken Yamamoto、Ituro Inoue
    • Journal Title

      Rheumatology

      Volume: - Pages: keac597

    • DOI

      10.1093/rheumatology/keac597

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing2022

    • Author(s)
      Junichi Iwakiri、Kumiko Tanaka、Takeshi Chujo、Hiro Takakuwa、Tomohiro Yamazaki、Goro Terai、Kiyoshi Asai、Tetsuro Hirose
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 29(2) Pages: 170~177

    • DOI

      10.1261/rna.079469.122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BATF epigenetically and transcriptionally controls the activation program of regulatory T cells in human tumors2022

    • Author(s)
      Kota Itahashi、Takuma Irie、Junichiro Yuda、Shogo Kumagai、Tokiyoshi Tanegashima、Yi-Tzu Lin、Sho Watanabe、Yasushi Goto、Jun Suzuki、Keiju Aokage、Masahiro Tsuboi、Yosuke Minami、Genichiro Ishii、Yuichiro Ohe、Wataru Ise、Tomohiro Kurosaki、Yutaka Suzuki、Shohei Koyama、Hiroyoshi Nishikawa
    • Journal Title

      Science Immunology

      Volume: 7(76) Pages: eabk0957

    • DOI

      10.1126/sciimmunol.abk0957

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Live imaging of delamination in Drosophila shows epithelial cell motility and invasiveness are independently regulated2022

    • Author(s)
      Mikiko Inaki、Smitha Vishnu、Kenji Matsuno
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12(1) Pages: 16210

    • DOI

      10.1038/s41598-022-20492-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Semibulk RNA-seq analysis as a convenient method for measuring gene expression statuses in a local cellular environment2022

    • Author(s)
      Kyoko Muto、Issei Tsuchiya、Soo Hyeon Kim、Satoi Nagasawa、Mariko Takishita、Koichiro Tsugawa、Hiroaki Saito、Yusuke Komazaki、Toru Torii、Teruo Fujii、Yutaka Suzuki、Ayako Suzuki、Masahide Seki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12(1) Pages: 15309

    • DOI

      10.1038/s41598-022-19391-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The latent dedifferentiation capacity of newt limb muscles is unleashed by a combination of metamorphosis and body growth2022

    • Author(s)
      Zhan Yang Yu、Shota Shiga、Martin Miguel Casco-Robles、Kazuhito Takeshima、Fumiaki Maruo、Chikafumi Chiba
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12(1) Pages: 11653

    • DOI

      10.1038/s41598-022-15879-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Early prediction of functional prognosis in neurofibromatosis type 2 patients based on genotype-phenotype correlation with targeted deep sequencing2022

    • Author(s)
      Yu Teranishi、Satoru Miyawaki、Hirofumi Nakatomi、Kenta Ohara、Hiroki Hongo、Shogo Dofuku、Atsushi Okano、Shunsaku Takayanagi、Takahiro Ota、Jun Yoshimura、Wei Qu、Jun Mitsui、Shinichi Morishita、Shoji Tsuji、Nobuhito Saito
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12(1) Pages: 9543

    • DOI

      10.1038/s41598-022-13580-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A mucin protein predominantly expressed in the female-specific symbiotic organ of the stinkbug Plautia stali2022

    • Author(s)
      Minoru Moriyama、Toshinari Hayashi、Takema Fukatsu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12(1) Pages: 7782

    • DOI

      10.1038/s41598-022-11895-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Protocol for viral vector-mediated measurement of transcription factor activity of mouse brain2022

    • Author(s)
      Hajime Yamamoto、Kentaro Abe
    • Journal Title

      STAR Protocols

      Volume: 3 Pages: 101633

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2022.101633

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reducing the number of accepted species inAspergillusseriesNigri2022

    • Author(s)
      C. Bian、Y. Kusuya、F. Sklenar、E. D'hooge、T. Yaguchi、S. Ban、C.M. Visagie、J. Houbraken、H. Takahashi、V. Hubka
    • Journal Title

      Studies in Mycology

      Volume: 102 Pages: 95~132

    • DOI

      10.3114/sim.2022.102.03

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of Fungal Communities Isolated from Himalayan Glacier Cryoconites2022

    • Author(s)
      Gandhali M. Dhume、Masaharu Tsuji、Shiv Mohan Singh
    • Journal Title

      Sustainability

      Volume: 14 Pages: 14814

    • DOI

      10.3390/su142214814

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] UTX deficiency in neural stem/progenitor cells results in impaired neural development, fetal ventriculomegaly, and postnatal death2022

    • Author(s)
      Miho Koizumi、Hikaru Eto、Mai Saeki、Masahide Seki、Tsuyoshi Fukushima、Shoichiro Mukai、Hisamitsu Ide、Yasuyuki Sera、Masayuki Iwasaki、Yutaka Suzuki、Atsushi Tohei、Yusuke Kishi、Hiroaki Honda
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 36(12) Pages: e22662

    • DOI

      10.1096/fj.202201002rr

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single‐cell analytical technologies: uncovering the mechanisms behind variations in immune responses2022

    • Author(s)
      Yukie Kashima、Patrick Reteng、Yasuhiko Haga、Junya Yamagishi、Yutaka Suzuki
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/febs.16622

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] TT-pocket/HIRAN: binding to 3'-terminus of DNA for recognition and processing of stalled replication forks2022

    • Author(s)
      Hisao Masai
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 172 Pages: 57~60

    • DOI

      10.1093/jb/mvac042

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Auxin signaling is essential for organogenesis but not for cell survival in the liverwortMarchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Hidemasa Suzuki、Hirotaka Kato、Megumi Iwano、Ryuichi Nishihama、Takayuki Kohchi
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 35 Pages: 1058~1075

    • DOI

      10.1093/plcell/koac367

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The renaissance and enlightenment of Marchantia as a model system2022

    • Author(s)
      John L Bowman、Mario Arteaga-Vazquez、Frederic Berger、Liam N Briginshaw、Philip Carella、Adolfo Aguilar-Cruz、Kevin M Davies、Tom Dierschke、Liam Dolan、Ana E Dorantes-Acosta、Tom J Fisher、Eduardo Flores-Sandoval、Kazutaka Futagami、Kimitsune Ishizaki、Takayuki Kohchi、Yasuhiro Tanizawa、Sabine Zachgo et al.
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 34 Pages: 3512~3542

    • DOI

      10.1093/plcell/koac219

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Active Expression of Genes for Protein Modification Enzymes in Habu Venom Glands2022

    • Author(s)
      Akiko Isomoto、Eiichi Shoguchi、Kanako Hisata、Jun Inoue、Yinrui Sun、Kenji Inaba、Noriyuki Satoh、Tomohisa Ogawa、Hiroki Shibata
    • Journal Title

      Toxins

      Volume: 14 Pages: 300

    • DOI

      10.3390/toxins14050300

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ゲノムから探るニホンオオカミと日本犬の歴史の紹介: ニホンオオカミと日本犬2022

    • Author(s)
      寺井洋平
    • Journal Title

      Yaponesia

      Volume: あき号 Pages: -

  • [Journal Article] 植物ホルモン・オーキシンによるタンパク質分解系(AID法)を利用した核内セントロメア構造の解析2022

    • Author(s)
      西村 浩平、深川 竜郎、嘉村 巧
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 6(13) Pages: 1259~1263

  • [Journal Article] ペプチド工学の新展開 4 環境ストレス応答に関わる植物ペプチド2022

    • Author(s)
      高橋 史憲
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 6(8) Pages: 697~701

  • [Journal Article] 古代ゲノム研究の最先端(3)2022

    • Author(s)
      太田 博樹
    • Journal Title

      遺伝子医学

      Volume: 42号Vol.12 No.4 Pages: 71~77

  • [Journal Article] 古代ゲノム研究の最先端(2)2022

    • Author(s)
      太田 博樹
    • Journal Title

      遺伝子医学

      Volume: 41号Vol.12 No.3 Pages: 103~108

  • [Journal Article] 古代ゲノム研究の最先端(1)2022

    • Author(s)
      太田 博樹
    • Journal Title

      遺伝子医学

      Volume: 40号Vol.12 No.2 Pages: 71~77

  • [Journal Article] 神経変性疾患における細胞死研究2022

    • Author(s)
      星野 友則、 高橋 良輔、 松澤 秀一
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 283巻5号 Pages: 464~468

  • [Journal Article] メラノーマのゲノム異常2022

    • Author(s)
      肥田時征
    • Journal Title

      癌と化学療法

      Volume: 49 Pages: 409~412

  • [Journal Article] Melanoma and Non-Melanoma Skin Cancers2022

    • Author(s)
      宇原 久
    • Journal Title

      癌と化学療法

      Volume: 49 Pages: 407~408

  • [Journal Article] 翻訳とRNA分解制御と免疫2022

    • Author(s)
      三野 享史、 竹内 理
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 54(12) Pages: 696~699

  • [Journal Article] AID法と4C解析法を組み合わせた核内セントロメア構造の解析2022

    • Author(s)
      西村 浩平、深川 竜郎、嘉村 巧
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 54(11) Pages: 667~670

  • [Journal Article] Architectural RNAと液-液相分離【ArcRNAとストレス応答】2022

    • Author(s)
      二宮 賢介 、 廣瀬 哲郎
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 54(8) Pages: 426~429

  • [Journal Article] ゲノムから探るニホンオオカミと日本犬の歴史2022

    • Author(s)
      寺井洋平
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 76(5) Pages: 340 ~ 345

  • [Presentation] Dual roles of BRD9 in normal and malignant hematopoiesis2023

    • Author(s)
      Daichi Inoue
    • Organizer
      2023 Normal/Malignant Hematopoiesis and Novel Therapies for Hematologic Malignancies Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Pathogenesis of central nervous system germ cell tumors elucidated by transcriptome and methylome analyses2023

    • Author(s)
      Hirokazu Takami、et al.
    • Organizer
      23rd International Conference on Brain Tumor Research and Therapy
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Analysis of neural stem cell regulatory mechanisms using optogenetics2023

    • Author(s)
      今吉格
    • Organizer
      Cellular mechanisms of learning and memoryシンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Two approaches for isolation of bioactive natural products: Fishing by protein-beads and microorganism-animal cells co-incubation2023

    • Author(s)
      Midori Arai
    • Organizer
      Future Drug Discovery Empowered by Chemical Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Analysis of neural stem cell regulatory mechanisms using optogenetics2023

    • Author(s)
      今吉格
    • Organizer
      International Symposium on Neural Development and Diseases
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Altered Post-transcriptional Regulation in Malignant Hematopoiesis2023

    • Author(s)
      井上大地
    • Organizer
      IRCMS Mini Symposium on Normal Hematopoiesis and Transformation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of mononuclear phagocyte differentiation and activation2023

    • Author(s)
      Daisuke Kurotaki
    • Organizer
      NIH Affinity Group Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Analysis of Genes Expressed during the Flowering and the Dormancy Induction in Duckweeds2023

    • Author(s)
      Shogo Ito、Tokitaka Oyama
    • Organizer
      Plant and animal genome conference PAG30
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 3D chromatin structure reorganization during immune cell differentiation and activation2023

    • Author(s)
      Daisuke Kurotaki
    • Organizer
      The 1st IMEG Meeting of the Research Center for High Depth Omics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Physical nature of euchromatic domains in living cells2023

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      UK-Japan Genome Stability Meeting (Sussex, UK)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A targeted protein knockdown with the power of plants2023

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      UK-Japan Genome Stability Meeting (Sussex, UK)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Tumor invasion initiates at Invasion Hotspots, an epithelial tissue-intrinsic microenvironment2023

    • Author(s)
      Rei Kobayashi、Junki Ikeguchi、Sheng Deng、Yasuyuki Fujita、Yoichiro Tamori
    • Organizer
      64th Annual Drosophila Research Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of Transcription Factors Associated with Depressive Behavior with Transcription Factor Activity Profiling2023

    • Author(s)
      Hajime Yamamoto、Satomi Araki and Kentaro Abe
    • Organizer
      ACC International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Intensive Single Cell Analysis for Elucidating Immune Cell Diversity among Healthy Individuals2023

    • Author(s)
      Yutaka Suzuki
    • Organizer
      AGBT General Meeting 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Developmental and molecular mechanisms of hybrid male sterility between two sympatric stickleback species.2023

    • Author(s)
      Genta Okude、Jun Kitano
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Speciation (The Origin and Persistence of Species)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Developmental and molecular mechanisms of hybrid male sterility between two sympatric stickleback species.2023

    • Author(s)
      Genta Okude、Jun Kitano
    • Organizer
      Gordon Research Seminar, Speciation (The Origin and Persistence of Species).
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Chromosome conformation affects the clustered breakage and complex chromosomal rearrangement in germline2023

    • Author(s)
      Hidehito Inagaki、Takema Kato、Atsushi Toyoda、Yoshio Makita、Hiroki Kurahashi
    • Organizer
      ICHG 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Population structure and conservation genomics of North Pacific green turtles & Loggerhead turtles2023

    • Author(s)
      Tomoko Hamabata
    • Organizer
      Sea Turtle Genomes Forum
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular mechanics governed by the genetic left-right asymmetry programme underlying cardiac outflow tract morphogenesis.2023

    • Author(s)
      Kenta Yashiro
    • Organizer
      Yamada Conference LXXV: “Origin of left-right asymmetry in animals”
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] エストロゲン受容体の新しいエピゲノム制御メカニズム2023

    • Author(s)
      堀江公仁子、池田和博、井上聡
    • Organizer
      第30回日本ステロイドホルモン学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 代謝物によるエピゲノム調節を介した脂肪細胞分化制御2023

    • Author(s)
      稲垣 毅
    • Organizer
      第36回日本糖尿病・肥満動物学会年次学術集会
    • Invited
  • [Presentation] マウス精子形成期におけるエピゲノムおよびクロマチン制御機構2023

    • Author(s)
      前澤 創
    • Organizer
      第3回有性生殖研究会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム関連解析手法の展開:シングルセル解析から空間解析へ2023

    • Author(s)
      鈴木穣
    • Organizer
      第45回日本造血・免疫細胞療法学会総会
    • Invited
  • [Presentation] リン枯渇環境におけるダメージ関連パターン受容体を介した植物免疫制御2023

    • Author(s)
      西條 雄介
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 腫瘍由来血中循環DNA(ctDNA)による デジタルPCRプローブライブラリーを用いた がん治療モニタリング検査2023

    • Author(s)
      西塚哲
    • Organizer
      第7回Liquid Biopsy研究会
    • Invited
  • [Presentation] バクテリアゲノム設計原理のバイオインフォマティクス2023

    • Author(s)
      岩崎渉
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Invited
  • [Presentation] シロイヌナズナを細菌感染モデルとして用いる試み2023

    • Author(s)
      垣内力、石川一也
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Invited
  • [Presentation] 植物の細菌感染モデル生物としての可能性2023

    • Author(s)
      石川一也、垣内力
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Invited
  • [Presentation] 脂肪細胞分化を制御するエピゲノム書き換えにおける鉄の役割2023

    • Author(s)
      稲垣 毅
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
    • Invited
  • [Presentation] Search for a non-canonical amino acid responsive pathway2023

    • Author(s)
      福山征光
    • Organizer
      農芸化学会2023年度大会
    • Invited
  • [Presentation] Isolation and Characterization of Liquid-Liquid Phase Separated Pyrenoid Mutants with the Aberrant Morphology in the Green Alga Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Yumeka Masuda、Tatsuhiro Kotoge、Hideya Fukuzawa、Takashi Yamano
    • Organizer
      19th International Student Seminar
  • [Presentation] Functional analysis of LCI15, which suppresses the CO2-concentrating mechanism in the green algae Chlamydomonas reinhardtii2023

    • Author(s)
      Shizuka Miichi、Daisuke Shimamura、Junko Yasuda、Takashi Yamano、Hideya Fukuzawa
    • Organizer
      19th International Student Seminar
  • [Presentation] Elucidation of brain developmental mechanism causing gender differences in neurodevelopmental disorder.2023

    • Author(s)
      Kikkawa T.、Kawaoka S.、Niwa S.
    • Organizer
      TI-FRIS/FRIS Symposium 2023
  • [Presentation] 乾燥ストレス応答に関わる新規幕タンパク質の機能解析2023

    • Author(s)
      大谷晴香、井上和奏、鈴木健裕、堂前直、高橋史憲
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] リュウキュウツヤハナムグリの構造色多型を生み出す分子メカニズム2023

    • Author(s)
      神村 学、和泉 隆誠、横井 翔、土屋 渉、鈴木 倫太郎、豊田 敦、瀬筒 秀樹
    • Organizer
      第67回日本応用動物昆虫学会大会
  • [Presentation] Induction of miRNA-mediated apoptosis during the poly(I:C)-transfection2023

    • Author(s)
      Shota Azuma、Yoshimasa Asano、Kumiko Ui-Tei
    • Organizer
      感染症研究グローバルネットワークフォーラム2022
  • [Presentation] アオミドロ属Spirogyra parvulaのゲノム解析から探る接合藻類単細胞化と遺伝子喪失2023

    • Author(s)
      西山智明、池谷 仁里、高野 智之、坂山 英俊、関本 弘之
    • Organizer
      植物分類学会第22回大会
  • [Presentation] 神経損傷により惹起された炎症関連細胞の時空間的解析2023

    • Author(s)
      永田 健一 、杏夕采、元岡 大祐、東 光一、黒川 顕、木山 博資
    • Organizer
      第128回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • [Presentation] Role of a novel protease inhibitor for spermatogenesis and immune homeostasis2023

    • Author(s)
      富澤信一
    • Organizer
      第128回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • [Presentation] ピレノイドに局在するSAGA1 タンパク質はCa2+結合性タンパク質CASによる無機炭素輸送体の遺伝子発現に必要である2023

    • Author(s)
      嶋村 大亮、新川友貴、HU Donghui、山野隆志、福澤秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 緑藻のMYB型転写因子LCR1が制御する炭酸脱水酵素とCO2チャネルによるCO2濃縮機構の駆動2023

    • Author(s)
      池内 友彰、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] クラミドモナスにおけるピレノイド形成異常変異株の単離と解析2023

    • Author(s)
      増田 夢佳、小峠 達大、福澤 秀哉、山野 隆志
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] クラミドモナスのCO2濃縮機構を抑制するCobW-WWドメインタンパク質の局在と機能2023

    • Author(s)
      見市 静香、嶋村 大亮、安田 詢子、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第16回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] Enhancement of Vivid-based Photo-Activatable Gal4 Transcription Factor in Mammalian Cells2023

    • Author(s)
      長崎真治、今吉格
    • Organizer
      第16回神経発生討論会
  • [Presentation] 褐虫藻の増殖促進に関する遺伝子発現解析と転写因子のChIP-seq解析2023

    • Author(s)
      吉原静恵
    • Organizer
      第17回日本ゲノム微生物学会年会
  • [Presentation] 樹状細胞分化においてIrf8遺伝子発現を誘導するエンハンサー群の動的制御機構の解明2023

    • Author(s)
      山﨑 貴弥、西山 晃、黒木 心和、田村 智彦
    • Organizer
      第27回造血器腫瘍研究会
  • [Presentation] エストロゲン受容体陽性乳がんにおけるRNA結合蛋白質PSPC1の臨床的意義と作用メカニズムの解明2023

    • Author(s)
      竹岩俊彦、池田和博、鈴木貴、佐藤航、川端英孝、堀江公仁子、井上聡
    • Organizer
      第30回日本ステロイドホルモン学会学術集会
  • [Presentation] コーヒーは尿酸値と独立して痛風リスクを減少させる:日欧の人種集団におけるメンデルランダム化解析より2023

    • Author(s)
      中山昌喜、白井雄也、河村優輔、豊田優、中杤昌弘、清水聖子、四ノ宮成祥、岡田随象、松尾洋孝
    • Organizer
      第33回日本疫学会学術総会
  • [Presentation] パラボリックフライトにおける重力に応じたヒメツリガネゴケ細胞内カルシウムイオン動態のライブイメージング解析2023

    • Author(s)
      日渡祐二、逵かおる、蒲池浩之、唐原一郎、半場祐子、久米篤、藤田知道、鈴木智美、嶋津徹
    • Organizer
      第37回宇宙環境利用シンポジウム
  • [Presentation] Microbes control Drosophila oogenesis2023

    • Author(s)
      須山律子
    • Organizer
      第3回有性生殖研究会
  • [Presentation] 初期胚発生におけるセリン代謝の役割とエピジェネティックな調節機構2023

    • Author(s)
      大我政敏、武田盛也、坂本瑞季、菊池康之、若山清香、若山照彦、林陽平
    • Organizer
      第3回有性生殖研究会
  • [Presentation] コーヒー摂取の習慣は血清尿酸値とは無関係に痛風リスクを減らす:日欧の人種集団におけるゲノムワイド関連解析の結果を活用したメンデルランダム化解析より2023

    • Author(s)
      河村優輔、中山昌喜、豊田優、中杤昌弘、清水聖子、四ノ宮成祥、岡田随象、松尾洋孝
    • Organizer
      第56回日本痛風・尿酸核酸学会総会
  • [Presentation] OAT10は生理学的に重要な尿酸再吸収輸送体である2023

    • Author(s)
      豊田優、高田龍平、河村優輔、中山昌喜、清水聖子、川口真、高田雄三、市田公美、四ノ宮成祥、小林靖、松尾洋孝
    • Organizer
      第56回日本痛風・尿酸核酸学会総会
  • [Presentation] ウキクサ根圏微生物の芳香族分解遺伝子は微生物間相互作用で活性化される2023

    • Author(s)
      石澤秀紘、吉田菜ノ花、田代陽介、井上大介、武尾正弘、池道彦、二又裕之
    • Organizer
      第57回日本水環境学会年会
  • [Presentation] ツノケイソウLhcx1遺伝子のゲノム編集を利用した機能破壊と表現型解析2023

    • Author(s)
      熊沢 穣、石川 規子、辻 祥子、井上(菓子野)名津子、菓子野 康浩、伊福 健太郎
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] キタグニコウキクサにおける光周期依存性休眠の誘導に関与する遺伝子群の解析2023

    • Author(s)
      伊藤 照悟、小山 時隆
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン修飾酵素過剰発現細胞における転写活性領域の観察2023

    • Author(s)
      澁田未央
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるアブシシン酸生合成鍵酵素遺伝子変異株の生理化学的解析2023

    • Author(s)
      中野美波、川上直人、岡本昌憲
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Marpolbase: ゼニゴケのための遺伝子情報および発現量データベースの開発2023

    • Author(s)
      谷澤 靖洋、川村 省吾、Romani Facundo、矢倉 勝、望月 孝子、坂本 美佳、山岡 尚平、西浜 竜一、中村 保一、大和 勝幸、Bowman John、河内 孝之
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ゼニゴケの幹細胞動態調節における転写因子JINGASAの役割2023

    • Author(s)
      高橋 剛、清末 知宏、平川 有宇樹
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] シロイヌナズナの葉の発生分化に関わるAS2と核小体タンパク質によるDNAメチル化維持機能の解明2023

    • Author(s)
      小島晶子、岩川秀和、日比野哲紀、高橋広夫、安藤沙友里、笹部美知子、伊藤正樹、町田泰則、町田千代子
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ウイルス病原性遺伝子を利用した葉形成に関るAYSYMMETRIC-LEAVES2 遺伝子の機能解明2023

    • Author(s)
      鈴木崇紀、岩川秀和、安藤沙友里、小島晶子、町田千代子、笹部美智子、栗原大輔、東山哲也、町田泰則
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] GRAS family transcription factor is a new regulator of asymmetric cell division and polarity in moss Physcomitrium patens2023

    • Author(s)
      Alisa Vyacheslavova、Teh Ooi-Kock、Renqi Wang、Mitsuyasu Hasebe、Tomomichi Fujita
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ツノケイソウの赤色光培養で蓄積する集光性色素タンパク質FCPの同定と機能解析2023

    • Author(s)
      中村 翠、熊沢 穣、長尾 遼、石川 規子、沈建仁、伊福 健太郎
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 褐虫藻Breviolum minutumの増殖制御に関与するcold shock proteinのChIP-seq解析2023

    • Author(s)
      吉原静恵、水口洋平、豊田敦、徳本勇人
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 多細胞接合藻アオミドロ属Spirogyra parvulaゲノムの解読と単細胞性接合藻および陸上植物との比較解析2023

    • Author(s)
      西山智明、池谷 仁里、高野 智之、坂山 英俊、関本 弘之
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Multiple uORF-mediated translational regulation in the Arabidopsis clock gene LHY2023

    • Author(s)
      Haruka Aoyama、Yuma Ise、Akinori Takahashi、Tadashi Yamamoto、Yukako Chiba
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 日本人コホート集団30,685人を対象とした腎性低尿酸血症の臨床遺伝疫学的解析:実際的診断に向けて2023

    • Author(s)
      染谷真澄、河村優輔、中山昌喜、清水聖子、豊田優、鳥羽美帆、竹田圭吾、菊池理園、中嶌真由子、川口真、鈴木聡子、岩澤聡子、中島宏、角田正史、市田公美、若井建志、松尾恵太郎、四ノ宮成祥、松尾洋孝
    • Organizer
      第68回防衛衛生学会
  • [Presentation] なぜ世界中の都市でカタバミの葉は赤く進化しているのか?2023

    • Author(s)
      深野祐也、矢守航、白澤健太、佐藤光彦、立木佑弥、内田圭
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
  • [Presentation] The level of bottleneck experienced by endangered green turtles2023

    • Author(s)
      Tomoko Hamabata、Satomi Kondo、Kazunari Kameda、Takuya Fukuoka、Katsufumi Sato、Makoto Terauchi、Hideki Noguchi、Masakado Kawata
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
  • [Presentation] 適応放散を遂げたシソ科 Oxera 属における隠蔽種の進化史推定2023

    • Author(s)
      池田隆介、陶山佳久、Gildas GETABLE、寺内真、野口英樹、井鷺裕司
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
  • [Presentation] 同所的なメダカ属魚類間における表現型分化の遺伝基盤とゲノム分化2023

    • Author(s)
      柿岡諒、安齋賢、田中理映子、佐藤正祐、北野潤、木村亮介、山平寿智
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
  • [Presentation] 樹形構造がもたらす樹木個体内の遺伝的多様性の解明2023

    • Author(s)
      富本創、佐竹暁子
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会
  • [Presentation] デジタルPCRプライマー・プローブサブライブラリOTS-Seriesの利用可能性2023

    • Author(s)
      開勇人、阿部正和、西塚哲
    • Organizer
      第7回Liquid Biopsy研究会
  • [Presentation] 膀胱癌再発診断における血漿および尿沈渣 変異DNAモニタリングの臨床的妥当性2023

    • Author(s)
      阿部正和、開勇人、露久保敬嗣、小野貞英、前川滋克、田村大地、加藤廉平、藤澤宏光、小原航、西塚哲
    • Organizer
      第7回Liquid Biopsy研究会
  • [Presentation] In vitro transcriptomic remodeling of cardiomyocytes caused by Trypanosoma cruzi2023

    • Author(s)
      Katherine Candray-Medina、Yu Nakagama、Shun Nakagama、Masamichi Ito、Yu Michimuko、Evariste Tshibangu-Kabamba、Akira Kaneko、Yasutoshi Kido
    • Organizer
      第92回日本寄生虫学会大会
  • [Presentation] M13 バクテリオファージを用いた RNA 分解酵素 MazF の発現による大腸菌の増殖抑制技術の開発2023

    • Author(s)
      長谷川 花菜、一色 理乃、宮本 龍樹、高杉 健一、野田 尚宏、常田 聡
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
  • [Presentation] ワサビゲノム解読の現状2023

    • Author(s)
      田中 裕之、堀 立樹、山本 祥平、豊田 敦、矢野 健太郎、山根 京子、伊藤 武彦
    • Organizer
      日本育種学会第143回講演会
  • [Presentation] Quantitative measurement of the activity of transcription factors in the brain during memory formation2023

    • Author(s)
      Ryoma Onodera、Ryotaro Fukue、Takeru Shiraishi and Kentaro Abe
    • Organizer
      日本生理学会第100回記念大会
  • [Presentation] アグリカン型プロテオグリカンの血管新生促進作用とその応用展開2023

    • Author(s)
      水谷健一
    • Organizer
      日本薬学会 第143年会
  • [Presentation] モモ 25 品種の比較ゲノム解析2023

    • Author(s)
      衣川達己、谷澤靖洋、中村保一 、伊藤武彦、田中 裕之、平川 英樹、篠澤章久、馬 場正、小田 賢司、井出大輔、大和 勝幸、石丸恵
    • Organizer
      令和5年園芸学会春季大会
  • [Presentation] ストックのゲノム情報の整備と八重鑑別系統の育成に関与した遺伝子変異の探索2023

    • Author(s)
      峰松美祈、田中裕之、伊藤武彦、鈴木穣、篠澤章久、田崎啓介、中塚貴司
    • Organizer
      令和5年園芸学会春季大会
  • [Presentation] 漁業対象種ヨシキリザメとアオザメを含む 複数軟骨魚種の染色体DNA配列の比較ゲノム解析2023

    • Author(s)
      工樂樹洋、山口和晃、門田満隆、柴田ありさ、増田幸子、白須賢、武島弘彦、野原健司、倉島陽、仙波靖子
    • Organizer
      令和5年度日本水産学会春季大会
  • [Presentation] Gapless sex-determining region unveils the early stage of sex chromosome evolution2023

    • Author(s)
      Ahammad Kabir、Sho Hosoya、Kiyoshi Kikuchi
    • Organizer
      令和5年度日本水産学会春季大会
  • [Presentation] Gonadal stem cell: a possible solution of futuristic aquaculture.2023

    • Author(s)
      Tapas Chakraborty、Sota Kawao、Kodai mizumura、Akira Eguchi、Sipra Mohapatra、Takehiko Itoh、Atsushi Toyoda、Naoki Nagano、Kohei Ohta、Michiya Matsuyama
    • Organizer
      令和5年度日本水産学会春季大会
  • [Presentation] Dissecting the mechanisms for cancer development caused by aberrant splicing2022

    • Author(s)
      井上大地
    • Organizer
      12th AACR-JCA Joint Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular control of Treg cell differentiation and function by Foxp3 and TCR signals2022

    • Author(s)
      Shohei Hori
    • Organizer
      2022 FIMSA Advanced Immunology Course
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Multifaceted interactions between cancer cells and glial cells in brain metastasis2022

    • Author(s)
      Eishu Hirata
    • Organizer
      2nd Chinese Oncology Young Elite Summit
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Outstanding features of developmental gene repertoires of slow-evolving genomes of elasmobranchs2022

    • Author(s)
      Shigehiro Kuraku
    • Organizer
      8th Meeting of European Society for Evolutionary Developmental Biology (EED) in Naples
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] H. pylori and the pathogenesis of gastric cancer2022

    • Author(s)
      Yamaoka Y.
    • Organizer
      ASEAN Gastro 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Liquid-like domain organization of early DNA replication regions in living human cells2022

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      Chromosome Replication in the New Era: Old and New Questions in Life Science.
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Epigenetic control of transposable elements2022

    • Author(s)
      Tetsuji Kakutani
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia, Integrative Epigenetics in Plants
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Role of subplate neurons in neocortical development and evolution2022

    • Author(s)
      Chiaki Ohtaka-Maruyama
    • Organizer
      Cortical Development Conference2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Understanding the emerging role of single cells genomics2022

    • Author(s)
      Yutaka Suzuki
    • Organizer
      ESMO Advanced Course on Biomarkers for Precision Medicine 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] What do shark genomes tell us about vertebrate evolution?2022

    • Author(s)
      Shigehiro Kuraku
    • Organizer
      Genomics of Convergence Symposium in Konstanz
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bioinformatics for revealing rules behind gene-content evolution2022

    • Author(s)
      Wataru Iwasaki
    • Organizer
      GIW XXXI/ISCB-Asia V (GIW/ISCB Asia 2022)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A Long Read Sequencing Analysis of Cancers; From Phasing to Multi-omics Analyses2022

    • Author(s)
      Yutaka Suzuki
    • Organizer
      HCA Asia meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular control of Treg cell function by Foxp3 and TCR signals2022

    • Author(s)
      Shohei Hori
    • Organizer
      ImmunOctoberfest 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Speciation and phenotypic diversification of freshwater animals in ancient lake systems on Sulawesi, Wallace’s ‘anomalous island’2022

    • Author(s)
      Kakioka R、Yamahira K
    • Organizer
      INTECOL2022 (the 13th International Congress of Ecology)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The spread of Homo sapiens into East Eurasia after the Out-of-Africa, and the subsequent Out-of-Eurasia2022

    • Author(s)
      Hiroki Oota
    • Organizer
      International Symposium “Human Dispersal from north Eurasia via Beringia into North America”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Characteristics of subplate neuron molecular expression elucidated by single-cell and spatial transcriptome analysis2022

    • Author(s)
      Chiaki Ohtaka-Maruyama
    • Organizer
      International Symposium on Development and Plasticity of Neural System
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ancient genome analysis of human remains in the Japanese archipelago2022

    • Author(s)
      Hiroki Oota
    • Organizer
      International Symposium: Insights into Human History in the Eurasian Stone Age: Recent Developments in Archaeology, Palaeoanthropology, and Genetics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Towards the elucidation of the molecular mechanism of horn development in Trypoxylus dichotomus2022

    • Author(s)
      Niimi T. and Morita S.
    • Organizer
      JAPAN-SINGAPORE JOINT DEVELOPMENTAL BIOLOGY MEETING
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Dynamic changes in higher-order chromatin structures and the role of IRF8 during dendritic cell development and activation2022

    • Author(s)
      Tomohiko Tamura
    • Organizer
      JSICR/MMCB 2022 Joint Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 3D chromatin structure dynamics during immune cell differentiation and activation2022

    • Author(s)
      Daisuke Kurotaki
    • Organizer
      SixERS & UST Joint Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The membrane-linked adaptor FRS2beta fashions a cytokine-rich inflammatory microenvironment that promotes breast cancer carcinogenesis2022

    • Author(s)
      Noriko Gotoh
    • Organizer
      Symposium on World Cancer Research 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CO2-dependent migration and relocation of LCIB, a pyrenoid-peripheral protein in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Takashi Yamano
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ancient human footprints left in Helicobacter pylori2022

    • Author(s)
      Yoshio Yamaoka
    • Organizer
      The 11th Asian Pacific Topic Conference in the 108th General Meeting of the Japanese Society of Gastroenterology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Genetic abnormalities of melanoma in Asians2022

    • Author(s)
      Hida T
    • Organizer
      The 12th Asian Dermatological Congress
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Viruses as part of Earth’s life system2022

    • Author(s)
      Ogata H.
    • Organizer
      The 12th Asian Symposium on Microbial Ecology (ASME2022)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Aberrant splicing events lead to altered cell fate of hematopoietic stem cells2022

    • Author(s)
      井上大地
    • Organizer
      The 19th Stem Cell Research Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Exploring the relationship between DNA replication and non-genomic information with an improved Okazaki-sequencing method2022

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      The 1st International Symposium on Replication of Non-genome(東京)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Applications of Spatial Transcriptome Analysis to elucidate the cancer Heterogeneity2022

    • Author(s)
      Yutaka Suzuki
    • Organizer
      The 40th Sapporo International Cancer Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mapping the chromatin profiles of IPMN lineages to unveil their biological vulnerabilities2022

    • Author(s)
      加藤裕之
    • Organizer
      United European Gastroenterology Week
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Estimating fluctuations in cell state dynamics and predicting fate bifurcations under influenza infection using deep learning2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Hitherto-unnoticed self-transmissible plasmids widely distributed among different environments2022

    • Author(s)
      Masaki Shintani
    • Organizer
      18th International Symposium on Microbial Ecology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Long-read-resolved, ecosystem-wide exploration of nucleotide and structural microdiversity of lake bacterioplankton genomes2022

    • Author(s)
      Okazaki Y、Nakano S、Toyoda A、Tamaki H
    • Organizer
      18th International Symposium on Microbial Ecology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Unveiling highly fluctuating single-cell transcriptome dynamics at a novel bifurcation point in human lymphoid pathway2022

    • Author(s)
      Keiki Nagaharu、Yasuhiro Kojima、Yuki Kageyama、Yuka Sugimoto、Masahiro Masuya、Shigeru Nii、Masahide Seki、Yutaka Suzuki、Isao Tawara、Teppei Shimamura、Naoyuki Katayama、Kohshi Ohishi
    • Organizer
      64th ASH Annual Meeting & Exposition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Hi-C analysis in patient-derived organoids reveals the impact of three-dimensional chromatin structures on pancreatic cancer transcriptional subtypes2022

    • Author(s)
      加藤裕之
    • Organizer
      AACR Special Conference: Pancreatic cancer
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The gene expression and epigenetic regulation of individual nuclei within the same osteoclast is heterogeneous: Evidence from Intra-single cell sequencing (iscSeq)2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Okada
    • Organizer
      ASBMR 2022 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A universal subcuticular bacterial symbiont of the coral predator, crown-of-thorns starfish2022

    • Author(s)
      Naohisa WADA、Hideaki YUASA、Rei KAJITANI、Yasuhiro GOTOH、Yoshitoshi OGURA、Dai YOSHIMURA、Atsushi TOYODA、Sen-Lin TANG、Yukio HIGASHIMURA、Hugh SWEATMAN、Zac FORSMAN、Omri BRONSTEIN、Gal EYAL、Nalinee THONGTHAM、Kei Zaitsu、Tetsuya HAYASHI、Takehiko ITOH、Nina YASUDA
    • Organizer
      Australian Marine Science Association 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] m7G RNA modification by METTL1 stabilizes tRNAs and maintains fertility via controlling spermatogenesis in Drosophila melanogaster2022

    • Author(s)
      Shunya KANEKO、Keita MIYOSHI、Shu KONDO、Atsushi TOYODA、Makoto TERAUCHI、Hideki NOGUCHI、Kuniaki SAITO
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia, RNA Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MCMBP promotes the assembly of the MCM2-7 hetero-hexamer to ensure robust DNA replication in human cells2022

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Symposium on Genome Integrity (NY, USA)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of stem cell-promoting CLE peptide signaling in the liverwort Marchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Yuki Hirakawa
    • Organizer
      EMBO Workshop on An integrated view of early land plant evolution
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium2022

    • Author(s)
      Sekimoto H.、Tsuyuki N.、Komiya A.、Nishiyama T.
    • Organizer
      EMBO Workshop_An integrated view of early land plant evolution
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of electroactive microorganisms associated with stibnite mine wastewater.2022

    • Author(s)
      Hamamura N.、Kashima H.、Mitsunobu S.
    • Organizer
      Goldschmidt2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Within-individual genetic diversity in tropical trees2022

    • Author(s)
      Sou Tomimoto、Ryosuke Imai、Akiko Satake
    • Organizer
      INTECOL2022 (the 13th International Congress of Ecology)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Involvement of the pituitary gland in social-environment-dependent sex change2022

    • Author(s)
      Yume Yamamoto、Shoma Hanai、Tapas Chakraborty、Astushi Toyoda、 Takehiko Itoh、Michiya Matsuyama、Yoshitaka Nagahama、Kohei Ohta
    • Organizer
      International Conference on Responsible Aquaculture and Sustainable Fisheries Interact
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular characterization of fucoxanthin-chlorophyll a/c proteins in the diatom Chaetoceros gracilis: the unique diversification process of the light-harvesting complexes in red-algal lineage2022

    • Author(s)
      Minoru Kumazawa、Hiroyo Nishide、Ryo Nagao、Natsuko Inoue-Kashino、Ikuo Uchiyama、Yasuhiro Kashino、Jian-Ren Shen、Takeshi Nakano、Kentaro Ifuku
    • Organizer
      International Congress on Photosynthesis Research 2022 (Dunedin, New Zealand)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Global genome study of helicobacter pylori phage opens new paradigm on their worldwide distribution, genetic feature, and impacts on antimicrobial resistance, disease advancement, and achievement for phage-based therapy2022

    • Author(s)
      Alfaray IR、Saruuljavkhlan B、Fauzia KA、Matsumoto T、Yamaoka Y.
    • Organizer
      International Digestive Disease Forum
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Phylogenetic diversity of light harvesting complex proteins in diatoms and other red-lineage algae2022

    • Author(s)
      Minoru Kumazawa、Hiroyo Nishide、Ryo Nagao、Natsuko Inoue-Kashino、Ikuo Uchiyama、Yasuhiro Kashino、Jian-Ren Shen、Takeshi Nakano、Kentaro Ifuku
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation (Kobe)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Incompatibility groups of Pseudomonas plasmids revisited: comprehensive analysis of R factors belonging to IncP-1 to P-132022

    • Author(s)
      Masaki Shintani、Hideaki Nojiri、Haruo Suzuki、Masato Suzuki
    • Organizer
      International Symposium on Plasmid Biology 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Host ranges of plasmid could be predicted using genomic signature2022

    • Author(s)
      Maho Tokuda、Haruo Suzuki、Masahiro Yuki、Moriya Ohkuma、Kazuhide Kimbara、Masaki Shintani
    • Organizer
      International Symposium on Plasmid Biology 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis and exploration of Kenyon cells increased with behavioral evolution in hymenopteran insects2022

    • Author(s)
      Takayoshi Kuwabara、Hiroki Kohno、Masatsugu Hatakeyama、Takeo Kubo
    • Organizer
      IUSSI2022 19th Congress of the International Union for the Study of Social Insects
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Prokaryotic Genome annotation and data submission pipeline2022

    • Author(s)
      Yasuhiro Tanizawa
    • Organizer
      KOBIC-DDBJ meeting in Mishima, 2022- for International Network Formation
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Abnormal pyrenoid morphology due to the SAGA1 mutation affects CAS-dependent gene expression and CAS localization in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • Author(s)
      Daisuke Shimamura、Takashi Yamano、Yuuki Niikawa、Hu Donghui、Hideya Fukuzawa
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] FXYD3 functionally demarcates an ancestral breast cancer stem cell subpopulation with features of drug tolerant persisters2022

    • Author(s)
      Noriko Gotoh
    • Organizer
      The 12th AACR-JCA Joint Conference:
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The impact of mobile genetic elemants and toxin-antitoxin system on Helicobacter pylori adaptability and antimicrobial resistance: A wisdom from Japan-South Korea whole-genome sequence collection.2022

    • Author(s)
      Alfaray RI、Batsaikhan S、Fauzia KA、Akada J、Matsumoto T、Yamaoka Y.
    • Organizer
      The 18th Japan-Korea H. pylori Joint Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of Flagella and Outer Membrane Protein Genes associated with Biofilm Formation2022

    • Author(s)
      Kartika Afrida Fauzia, Yamaoka Y.
    • Organizer
      The 21st International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comprehensive Study of Helicobacter pylori Genomic Islands and Their Correlation to Gastric Diseases, Phylogenetic Pattern.2022

    • Author(s)
      Saruuljavkhlan B、Yamaoka Y.
    • Organizer
      The 21st International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Single cell lineage analysis for tracing drug-tolerant persister cells in patient-derived colorectal cancer cells2022

    • Author(s)
      Morino S.、Mashima T.、Suzuki Y.、Nagayama S.、Shirai F.、Katayama R.、Seimiya H.
    • Organizer
      The 26th JFCR-International Symposium on Cancer Chemotherapy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A lncRNA associated with chronic gastritis and gastric cancer inhibits apoptosis through stress granule formation.2022

    • Author(s)
      Hiroshi Kitajima、Reo Maruyama、Takeshi Niinuma、Akira Takasawa、Eiichiro Yamamoto、Kazuya Ishiguro、Ayano Yoshido、Masahiro Kai、Makoto Osanai、Takashi Tokino、Hiroshi Nakase、Hiromu Suzuki
    • Organizer
      The 40th Sapporo International Cancer Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dynamic nuclear lamina-chromatin interactions during spermatogenesis2022

    • Author(s)
      前澤 創
    • Organizer
      The International Symposium "Totipotency and Germ Cell Development"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Gonadal stem cells in a sex changing fish, Pseudolabrus sieboldi.2022

    • Author(s)
      Kodai Mizumura、Tapas Chakraborty、Kazuki Tateyama、Shoma Hanai、Yoshihara Yuya、Yume Yamamoto、Sipra Mohapatra、Yumiko Yamasaki、Atsushi Toyota、 Ito Takehiko、Michiya Matsuyama、Yoshitaka Nagahama、Kohei Ohta
    • Organizer
      The International Symposium "Totipotency and Germ Cell Development"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Large-scale genome structure dynamics shapes transcriptional subtype in pancreatic cancer2022

    • Author(s)
      加藤裕之
    • Organizer
      The Joint Congress of the 26th Meeting of International Association of Pancreatology and the 53rd Annual Meeting of Japan Pancreas Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Male sex-determining region retained after transition from heterothallism to homothallism in a Thai strain of Volvox africanus2022

    • Author(s)
      Kayoko Yamamoto、Ryo Matsuzaki、Wuttipong Mahakham、Wirawan Heman、Hiroyuki Sekimoto、Masanobu Kawachi、Yohei Minakuchi、Atsushi Toyoda、and Hisayoshi Nozaki
    • Organizer
      Volvox2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genomic measures relevant to the conservation of green turtles2022

    • Author(s)
      Tomoko Hamabata、Satomi Kondo、Kazunari Kameda、Takuya Fukuoka、Katsufumi Sato、Makoto Terauchi、Hideki Noguchi、Masakado Kawata
    • Organizer
      Tohoku University - OIST 3rd Joint Workshop on Biodiversity
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 野生メダカ集団を対象としたエピゲノム解析-消化管長の季節変動に着目して2022

    • Author(s)
      勝村啓史
    • Organizer
      2022年度日本魚類学会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 多様な魚類の核ゲノムDNA情報が明らかにした脊椎動物5億年の進化2022

    • Author(s)
      工樂樹洋
    • Organizer
      2022年度日本魚類学会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 我々の祖先と海洋環境のいまを映す生命情報学―水族館との連携と非日本型コアラボ構築が生んだサメゲノム研究2022

    • Author(s)
      工樂樹洋
    • Organizer
      2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会
    • Invited
  • [Presentation] がん脳転移微小環境の細胞分子基盤2022

    • Author(s)
      平田 英周
    • Organizer
      Breast Cancer Seminar in Hanshin 2022
    • Invited
  • [Presentation] Ushimado Marine Institute, Okayama University2022

    • Author(s)
      Sakamoto Tatsuya
    • Organizer
      I-MaC program @Roscoff
    • Invited
  • [Presentation] 発生期のニワトリ大脳におけるグリア細胞発現様式2022

    • Author(s)
      隈元拓馬、宋祥赫、丸山千秋
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Identification of embryonic molecular markers of mouse subplate neurons and search for their developmental origins2022

    • Author(s)
      丸山千秋
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
    • Invited
  • [Presentation] FXYX3, a subunit of Na+ pump, determines the origin of triple-negative breast cancer stem-like cells, the preeminent driver of drug resistance2022

    • Author(s)
      後藤典子
    • Organizer
      The 19th Stem Cell Research Symposium
    • Invited
  • [Presentation] Iron is crucial for determining cell fate via epigenetic rewriting2022

    • Author(s)
      Takeshi Inagaki
    • Organizer
      The 8th IMCR symposium on eodocrine and metabolism, Beyond the frontiers of endocrinology & metabolism
    • Invited
  • [Presentation] Multifaceted interactions between cancer cells and glial cells in brain metastasis2022

    • Author(s)
      Eishu Hirata
    • Organizer
      The 8th Neuroscience Network in Kobe Symposium 2022
    • Invited
  • [Presentation] 生命進化可能性のバイオインフォマティクス2022

    • Author(s)
      岩崎渉
    • Organizer
      極限環境生物学会第23回シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] NGS解析によるヒト精子エピゲノムプロフィール多様性の検討2022

    • Author(s)
      岡田由紀
    • Organizer
      第115回繁殖生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] メラノーマの分子生物学的背景2022

    • Author(s)
      肥田時征
    • Organizer
      第121回日本皮膚科学会総会
    • Invited
  • [Presentation] 微生物ゲノム研究法の進展とその応用2022

    • Author(s)
      高橋弘喜
    • Organizer
      第121回日本皮膚科学会総会
    • Invited
  • [Presentation] 機能未知遺伝子の機能推測から「遺伝子誕生学」へ2022

    • Author(s)
      岩崎渉
    • Organizer
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] キタグニコウキクサの光周期依存性の休眠誘導と休眠芽形成時に機能する遺伝子群の解析2022

    • Author(s)
      伊藤 照悟、小山 時隆
    • Organizer
      第29回時間生物学会学術大会
    • Invited
  • [Presentation] Mathematical Analysis of Tumor Immune Escape in Colorectal Cancer2022

    • Author(s)
      Hiroshi Haeno
    • Organizer
      第2回ASHBi 数理ヒト生物学研究会(Mathhub 2022)
    • Invited
  • [Presentation] 便マルチオミクス解析を用いた大腸多段階発癌に関連する腸内微生物・微小環境の大腸癌術後における変化2022

    • Author(s)
      高丸博之、柴知史、斎藤豊
    • Organizer
      第30回 日本消化器関連学会週間 JDDW2022 FUKUOKA
    • Invited
  • [Presentation] 末端型、粘膜型、Spitz型メラノーマの遺伝子異常2022

    • Author(s)
      肥田時征
    • Organizer
      第31回日本色素細胞学会学術大会
    • Invited
  • [Presentation] 新規探索法による生物活性天然物の開拓2022

    • Author(s)
      荒井緑
    • Organizer
      第32回新薬創製談話会
    • Invited
  • [Presentation] 脳転移微小環境におけるグリアがん免疫2022

    • Author(s)
      平田 英周
    • Organizer
      第32回日本サイトメトリー学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんの微小環境ニッチと腫瘍不均一性解明による新たな標的治療の可能性2022

    • Author(s)
      後藤典子
    • Organizer
      第32回日本サイトメトリー学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 有用物質生産に向けた実用藻類ツノケイソウの光合成機能の最適化2022

    • Author(s)
      伊福 健太郎
    • Organizer
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会大会・シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 体細胞変異に基づく新規高感度 腫瘍マーカーの社会実装2022

    • Author(s)
      西塚哲、開勇人、阿保亜紀子、岩谷岳
    • Organizer
      第42回日本分子腫瘍マーカー研究会
    • Invited
  • [Presentation] ヒト細胞におけるDNA複製2022

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 脆弱X症候群原因因子FMRPによる胎生脳のmRNA調節機構について2022

    • Author(s)
      吉川貴子、Sara Ebrahimiazar、Cristine R. Casingal、稲田仁、大隅典子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] メディエーター複合体による新規の転写スピード調節機構の解明2022

    • Author(s)
      鈴木 秀文、阿部 竜太、嶋田 美穂、廣瀬 智威、廣瀬 博子、野口 慶介、池 陽子、安井 七海、古郡 華月、山口 雄輝、豊田 敦、鈴木 穣、山本 達郎、斉藤 典子、Sato Shigeo、Tomomori-Sato Chieri、Conaway Ronald、Conaway Joan、髙橋 秀尚
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] What is the physical nature of chromatin domains in euchromatin?2022

    • Author(s)
      Kazuhiro Maeshima
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Laboratory evolution of bacterial multispecies community for antibiotic resistance2022

    • Author(s)
      Tomoya Maeda、Chikara Furusawa
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Sry遺伝子に依存しない哺乳類の性決定メカニズムの解明2022

    • Author(s)
      黒岩麻里
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] キンギョ網膜のシングルセルRNA-seq解析による全ゲノム重複後の遺伝子進化の解明2022

    • Author(s)
      Tetsuo Kon、Fukuta Kentaro、Masakazu Ishikawa、Hikari Tanaka、Hideki Noguchi、Atsushi Toyoda、Yoshihiro Omori
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] ブロモドメインタンパクの転写後制御を介した造血幹細胞運命制御機構2022

    • Author(s)
      井上大地
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習で細胞社会を読み解く2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] METTL1-mediated m7G modification regulates tRNA expression level to preserve complete fertility in Drosophila melanogaster2022

    • Author(s)
      Shunya KANEKO、Keita MIYOSHI、Shu KONDO、Atsushi TOYODA、Makoto TERAUCHI、Hideki NOGUCHI、Kuniaki SAITO
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] トリプルネガティブタイプ乳がん臨床検体のスフェロイド培養から明らかになってきた「親玉がん幹細胞」2022

    • Author(s)
      後藤典子
    • Organizer
      第4回がん三次元培養研究会
    • Invited
  • [Presentation] 樹状細胞の分化と活性化における三次元クロマチン構造の動態解析2022

    • Author(s)
      黒滝 大翼
    • Organizer
      第51回日本免疫学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Molecular control of Treg cell differentiation and function by Foxp3 and TCR signals2022

    • Author(s)
      Shohei Hori
    • Organizer
      第51回日本免疫学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Personalized circulating tumor DNA test in daily practice for cancer patients2022

    • Author(s)
      Takeshi Iwaya、Satoshi Nishizuka
    • Organizer
      第60回日本癌治療学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 精密なリキッドバイオプシーのための一分子一細胞レベルの難治性 消化器がんの解析2022

    • Author(s)
      石井 秀始
    • Organizer
      第60回日本癌治療学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第60回日本癌治療学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 性染色体上遺伝子UTX/UTYによるヒト分化多能性の維持機構2022

    • Author(s)
      秋山智彦
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 腫瘍由来血中循環DNAによる 腫瘍再発モニタリング検査2022

    • Author(s)
      岩谷 岳
    • Organizer
      第76回日本食道学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 食道癌患者における Nonactionable変異を用いた ctDNAモニタリング2022

    • Author(s)
      岩谷 岳、遠藤 史隆、藤澤 良介、西塚 哲
    • Organizer
      第76回日本食道学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 人骨・糞石・土壌 ? 古代ゲノム学の挑戦2022

    • Author(s)
      太田博樹
    • Organizer
      第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会
    • Invited
  • [Presentation] 腫瘍由来血中循環DNAによる最新の腫瘍再発モニタリング検査2022

    • Author(s)
      西塚哲
    • Organizer
      第77回日本消化器外科学会総会
    • Invited
  • [Presentation] Microenvironment creates premalignant mammary tissues and therapy-resistant persistent tumor cells in breast cancer2022

    • Author(s)
      後藤典子
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] シングルセルから空間解析へ:情報学的手法を中心に2022

    • Author(s)
      鈴木穣
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] A New Modality Using Deep Learning for Elucidating Tumor Microenvironment2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] 腫瘍マーカーとしての体細胞変異2022

    • Author(s)
      西塚哲
    • Organizer
      第94回日本病理学会東北支部学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 改良オーキシンデグロン法AID2を利用してDNA複製と非ゲノム情報の関係を探る2022

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] がん細胞進化における必然性と倍数性2022

    • Author(s)
      田守 洋一郎
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 1細胞空間トランスクリプトミクスへの挑戦2022

    • Author(s)
      鈴木穣
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 内部寄生蜂由来毒成分による宿主ショウジョウバエ幼虫の上皮組織の撹乱2022

    • Author(s)
      島田裕子、上山拓己、森一葉、丹羽隆介
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Self-recognition by regulatory T cells for immunological self-tolerance2022

    • Author(s)
      Shohei Hori
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] ブロモドメインタンパクのスプライシング異常がもたらす細胞運命制御2022

    • Author(s)
      井上大地
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • Author(s)
      島村 徹平
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会企画シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] トリプルネガティブタイプ乳がんの親玉がん幹細胞-root-Cancer stem cells2022

    • Author(s)
      後藤典子
    • Organizer
      日本患者由来がんモデル学会学術集会2022
    • Invited
  • [Presentation] 千葉県市原市の縄文遺跡出土人骨ゲノム解析2022

    • Author(s)
      太田博樹
    • Organizer
      日本考古学協会第88回(2022年度)総会
    • Invited
  • [Presentation] クワガタムシ科におけるメス化遺伝子transformer 遺伝子の解析2022

    • Author(s)
      大津 樹、山内 花音、後藤 寛貴
    • Organizer
      日本昆虫学会第82回大会
    • Invited
  • [Presentation] 緑藻ピレノイドの相分離現象とCO2濃縮2022

    • Author(s)
      山野 隆志
    • Organizer
      日本植物学会第86会大会
    • Invited
  • [Presentation] 植物ペプチドシグナルの世も無常?ゲノムが語る栄枯転変の物語2022

    • Author(s)
      古水 千尋
    • Organizer
      日本植物学会第86会大会
    • Invited
  • [Presentation] 短日性アオウキクサの花成限界日長が日本で多様化する理由とその分子機構2022

    • Author(s)
      村中智明、伊藤照悟、工藤洋、小山時隆
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Invited
  • [Presentation] Signal integration between phosphate starvation response and plant immunity2022

    • Author(s)
      Yusuke Saijo
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Invited
  • [Presentation] トンボの不思議を追いかけて2022

    • Author(s)
      二橋亮
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
    • Invited
  • [Presentation] Roles of m7G-RNA modification in Drosophila fertility2022

    • Author(s)
      齋藤都暁
    • Organizer
      日本発生生物学会第55回大会
    • Invited
  • [Presentation] 鉱山汚染環境における有害金属濃集を伴う電気栄養微生物活動;電極バイオフィルム・炭酸塩沈殿物複合体2022

    • Author(s)
      鹿島裕之、濱村奈津子、光延聖
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
    • Invited
  • [Presentation] Giant viruses share their large gene pool via horizontal gene transfer2022

    • Author(s)
      Ogata H.、Meng L.、Wu J.、Garcia K.G.、Kijima S.
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
    • Invited
  • [Presentation] 軟骨魚類と条鰭魚類を分けるゲノムの性質の探究2022

    • Author(s)
      工樂樹洋
    • Organizer
      令和4年度 水産育種研究会・定例シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Differential immune responsiveness between host and non-host Drosophila species against the parasitoid wasp Asobara japonica2022

    • Author(s)
      Hitoha Mori、Takumi Kamiyama、Yuko Shimada-Niwa、Ryusuke Niwa
    • Organizer
      15th Japan Drosophila Research Conference
  • [Presentation] Venom action on host and non-host Drosophila for the parasitism by the parasitoid wasp Asobara japonica2022

    • Author(s)
      Takumi Kamiyama、Hitoha Mori、Naoki Tani、Akira Nakamura、Yuko Shimada-Niwa、Ryusuke Niwa
    • Organizer
      15th Japan Drosophila Research Conference
  • [Presentation] カンゾウ培養ストロンにおけるグリチルリチン生合成遺伝子の発現におよぼすDNAメチル化酵素阻害剤の効果2022

    • Author(s)
      藤原健太郎、高上馬希重、村中俊哉、關 光
    • Organizer
      2022年度(第11回)近畿植物学会講演会
  • [Presentation] 放線菌のカルコフォア合成様遺伝子群の発現制御を担うシグマ因子SigCの解析2022

    • Author(s)
      藤本正浩、Salvatore Cosentino、按田瑞恵、佐藤光彦、中村佳司、小椋義俊、林哲也、岩崎渉、上田賢志、髙野英晃
    • Organizer
      2022年度(第36回)日本放線菌学会大会
  • [Presentation] インドネシア・ポソ湖で同所的種分化したメダカ属魚類におけるゲノム分化と遺伝子浸透2022

    • Author(s)
      柿岡諒、K. W. A. Masengi、木村亮介、山平寿智
    • Organizer
      2022年度日本魚類学会年会
  • [Presentation] シングルセル系譜解析による大腸がん患者由来drug-tolerant persister細胞の追跡2022

    • Author(s)
      森野峻、馬島哲夫、鈴木穣、白井文幸、長山聡、片山量平、清宮啓之
    • Organizer
      2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会
  • [Presentation] キンギョ網膜のシングルセル遺伝子発現解析による全ゲノム重複後のサブゲノム初期進化過程の理解2022

    • Author(s)
      大森義裕、今鉄男、福多賢太郎、野口英樹、豊田敦
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
  • [Presentation] Neural signaling from central autonomic control network to bone marrow2022

    • Author(s)
      檜山武史
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
  • [Presentation] 内側視索前野へ投射する扁桃体海馬野ニューロンは養育行動にて相反する亜集団を有する2022

    • Author(s)
      佐藤 圭一郎、奥野 浩行、尾藤 晴彦、南 雅文、天野 大樹
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
  • [Presentation] 光操作技術を用いた神経幹細胞の制御メカニズムの解析2022

    • Author(s)
      山田真弓、長崎真治、Seongchun Yang、今吉格
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
  • [Presentation] Generation and single-cell level characterization of neurons directly differentiated from human T lymphocytes2022

    • Author(s)
      斉藤陽一
    • Organizer
      NEURO2022 第45回日本神経科学大会 第65回日本神経化学会大会 第32回日本神経回路学会大会
  • [Presentation] mRNA安定化制御を通じた慢性的低酸素に応答した解糖系の調節2022

    • Author(s)
      張再軍
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2022
  • [Presentation] シングルセルRNA解析によるサブプレートニューロンのサブタイプ同定2022

    • Author(s)
      阿知波ひとみ、森岡歩夢、隈元拓馬、原雄一郎、川路英哉、多賀厳太郎、丸山千秋
    • Organizer
      シングルセルゲノミクス研究会
  • [Presentation] シングルセル系譜解析による大腸がん患者由来drug-tolerant persister細胞の追跡2022

    • Author(s)
      森野峻、馬島哲夫、鈴木穣、白井文幸、長山聡、片山量平、清宮啓之
    • Organizer
      シングルセルゲノミクス研究会2022
  • [Presentation] ミツバチのダンスコミュニケーションに関わる神経細胞種の探索 ~ミツバチとマルハナバチの脳高次中枢の比較scRNA-seq解析~2022

    • Author(s)
      桑原嵩佳、河野大輝、久保健雄
    • Organizer
      シングルセルゲノミクス研究会2022
  • [Presentation] 異なるアーバスキュラー菌根菌が接種されたミナトカモジグサにおける 遺伝子共発現ネットワークの比較2022

    • Author(s)
      菅井徹人、永山航平、丸山隼人、佐藤匠、神山拓也、熊石紀恵、市橋泰範
    • Organizer
      菌根研究会2022年度大会(JCOM2022)
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるアルデヒド酸化酵素遺伝子の遺伝学的解析2022

    • Author(s)
      鈴木 渓一朗、中野美波、渡邊俊介、瀬尾光範、岡本昌憲
    • Organizer
      植物化学調節学会第57回大会
  • [Presentation] シロイヌナズナの時計遺伝子LHYにおける上流ORFを介した日周的に変動する翻訳制御機構2022

    • Author(s)
      青山 悠、荒江 星拓、反田 直之、豊田 敦、千葉 由佳子
    • Organizer
      第10回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
  • [Presentation] 長鎖非翻訳RNA ECONEXINによる胎生期神経分化制御メカニズムの解明2022

    • Author(s)
      渡辺 新也.鈴木 美穂.室伏 善照.近藤 豊.
    • Organizer
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Presentation] 慢性胃炎・胃がん関連長鎖non-coding RNAはストレス顆粒形成を促進し、アポトーシスを抑制する2022

    • Author(s)
      北嶋洋志、丸山玲緒、新沼猛、高澤啓、石黒一也、甲斐正広、吉戸文乃、小山内誠、時野隆至、仲瀬裕志、鈴木拓
    • Organizer
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Presentation] Tumor invasion initiates at Invasion Hotspots, an epithelial tissue-intrinsic microenvironment2022

    • Author(s)
      Rei Kobayashi、Yasuyuki Fujita、Yoichiro Tamori
    • Organizer
      第15回日本ショウジョウバエ研究集会
  • [Presentation] Deep single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula2022

    • Author(s)
      Shunta Sakaguchi、Yasushi Okochi、Chiharu Tanegashima、Osamu Nishimura、Mitsutaka Kadota、Honda Naoki、Takefumi Kondo
    • Organizer
      第15回日本ショウジョウバエ研究集会
  • [Presentation] OAT10は腎臓に発現する生理的に重要な尿酸輸送体である2022

    • Author(s)
      豊田優、高田龍平、河村優輔、中山昌喜、森本渓音、清水聖子、藤原慎、鳥羽美帆、菊池理園、四ノ宮成祥、小林靖、松尾洋孝
    • Organizer
      第16回トランスポーター研究会年会
  • [Presentation] 日本人集団3万人における尿酸再吸収輸送体遺伝子URAT1/SLC22A12の機能消失型変異がもたらす影響についての臨床遺伝学的検討2022

    • Author(s)
      中山昌喜、河村優輔、豊田優、清水聖子、染谷真澄、田中里沙、森友理乃、今給黎敏彦、岩澤聡子、中島宏、角田正史、伊藤敬一、有澤孝吉、嶽崎俊郎、田中恵太郎、高田龍平、市田公美、若井建志、四ノ宮成祥、松尾洋孝
    • Organizer
      第16回トランスポーター研究会年会
  • [Presentation] 緑藻のC/Nストレス応答におけるタンパク質リン酸化酵素TAR1とDYRKP1の機能比較2022

    • Author(s)
      石川 拓海、辻 敬典、木下 あかり、新川 はるか、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第18回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
  • [Presentation] CO2濃縮機構を制御する緑藻クラミドモナスのWWドメイン含有タンパク質2022

    • Author(s)
      嶋村 大亮、安田 詢子、大垣 美萌、山原 洋佑、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      第18回京大植物縦横無尽の会ワークショップ
  • [Presentation] 個体成長を支える宿主―微生物叢相互作用2022

    • Author(s)
      服部 佑佳子
    • Organizer
      第23回京都大学生命科学研究科シンポジウム
  • [Presentation] TRBP-LGP2 interaction induces apoptosis during viral infection by affecting miRNA biogenesis and OAS-RNase L pathway2022

    • Author(s)
      Shota Azuma、Yuko Nakano、Yoshimasa Asano、Tomoko Takahashi、Koji Onomoto、Mitsutoshi Yoneyama、Kumiko Ui-Tei
    • Organizer
      第23回日本RNA学会年会
  • [Presentation] A lncRNA associated with chronic gastritis and gastric cancer promotes stress granule formation and inhibits apoptosis.2022

    • Author(s)
      Hiroshi Kitajima、Reo Maruyama、Takeshi Niinuma、Akira Takasawa、Eiichiro Yamamoto、Kazuya Ishiguro、Ayano Yoshido、Masahiro Kai、Takashi Tokino、Hiroshi Nakase、Hiromu Suzuki
    • Organizer
      第23回日本RNA学会年会
  • [Presentation] RNA structure profiling reveals differential accessibility of regulatory RBPs in responses to immune stimulation2022

    • Author(s)
      Takashi Mino、Fabian Hia、Kotaro Akaki、Osamu Takeuchi
    • Organizer
      第23回日本RNA学会年会
  • [Presentation] Drosophila METTL1 Induces m7G into tRNA to Preserve Complete Fertility2022

    • Author(s)
      Shunya Kaneko、Keita Miyoshi、Shu Kondo、Atsushi Toyoda、Makoto Terauchi、Hideki Noguchi、Kuniaki Saito
    • Organizer
      第23回日本RNA学会年会
  • [Presentation] Microglia sense dysfunction of astrocytes by P2Y12 receptors and prevent disease progression of Alexander disease model mice2022

    • Author(s)
      齋藤光象
    • Organizer
      第26回グリア研究会
  • [Presentation] シングルセル系譜解析による大腸がん患者由来drug-tolerant persister細胞の追跡2022

    • Author(s)
      森野峻、馬島哲夫、片山量平、清宮啓之
    • Organizer
      第26回日本がん分子標的治療学会学術集会
  • [Presentation] トリプルネガティブ乳がん幹細胞の起源ルミナル前駆細胞は、Na+ポンプFXYD3を利用し抗がん剤耐性を獲得する2022

    • Author(s)
      Mengjiao Li
    • Organizer
      第26回日本がん分子標的治療学会学術集会
  • [Presentation] Phenotypic analysis of immunodeficient medaka2022

    • Author(s)
      Hiyori Sakaguchi、Masaru Matsuda、Norimasa Iwanami
    • Organizer
      第28回小型魚類研究会
  • [Presentation] mazF 搭載バクテリオファージを用いた新規抗菌技術の開発2022

    • Author(s)
      長谷川 花菜、一色 理乃、宮本 龍樹、高杉 健一、野田 尚宏、常田 聡
    • Organizer
      第2回ファージセラピー研究集会
  • [Presentation] 新規難聴原因遺伝子SLC12A2モデル動物の蝸牛における遺伝子発現解析2022

    • Author(s)
      務台英樹、和佐野浩一郎、松永達雄
    • Organizer
      第32回日本耳科学会総会・学術講演会
  • [Presentation] 樹木個体内で生じる体細胞変異は遺伝的多様性を高めるか? ゲノムデータと数理モデルによる統合解析2022

    • Author(s)
      富本創、今井亮介、佐竹暁子
    • Organizer
      第32回日本数理生物学会大会
  • [Presentation] 廃用関節では滑膜マクロファージおよび滑膜線維芽細胞の特異的クラスターが軟骨変性に寄与する2022

    • Author(s)
      石倉 久年、齋藤 琢
    • Organizer
      第34回軟骨代謝学会
  • [Presentation] FGF受容体ファミリーの変異が子宮頸癌放射線治療予後に及ぼす影響2022

    • Author(s)
      吉本由哉、佐々木泰史、尾池貴洋、安藤謙、濱本純子、鈴木義行、中野隆史、時野隆至、大野達也
    • Organizer
      第35回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
  • [Presentation] スルピリドおよびプロラクチンを介した雄マウスの仔マウスへの攻撃行動調節2022

    • Author(s)
      天野大樹、濱崎 友美、伊藤 和貴、南雅文
    • Organizer
      第35回日本行動神経内分泌研究会
  • [Presentation] エピジェネティック酵素阻害剤がカンゾウ培養ストロンにおけるグリチルリチン生合成遺伝子の発現におよぼす効果2022

    • Author(s)
      藤原健太郎、高上馬希重、村中俊哉、關 光
    • Organizer
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会大会・シンポジウム
  • [Presentation] 分裂酵母の胞子におけるヒストン修飾の網羅的解析2022

    • Author(s)
      林亜紀、中川れい子、大川恭行、中山潤一
    • Organizer
      第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] コーヒーは尿酸値とは無関係に痛風リスクを減らす:ゲノムワイド関連解析の結果を用いたメンデルランダム化解析から2022

    • Author(s)
      中山昌喜、白井雄也、河村優輔、豊田優、中杤昌弘、清水聖子、四ノ宮成祥、岡田随象、松尾洋孝
    • Organizer
      第40回日本ヒト細胞学会学術集会
  • [Presentation] ヒトiPS細胞を用いたHBV integrationモデルの樹立と悪性形質獲得に関わる分子機構の解析2022

    • Author(s)
      新田 沙由梨、柿沼 晴、稲田賢人、持田 知洋、渡壁 慶也、志水 太郎、土屋 淳、三好 正人、金子俊、北畑 富貴子、村川 美也子、井津井 康浩、中川 美奈、朝比奈 靖浩
    • Organizer
      第44回日本肝臓学会東部会
  • [Presentation] トランスクリプトームデータ 解析で探るサブプレートニューロンの発生起源2022

    • Author(s)
      野口友理佳、阿知波ひとみ、隈元拓馬、丸山千秋
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ショウジョウバエin vivoモデルを用いたLeader-Follower細胞を伴う浸潤性腫瘍の細胞周期制御機構の解析2022

    • Author(s)
      Junki Ikeguchi、Sheng Deng、Rei Kobayashi、Yasuyuki Fujita、Yoichiro Tamori
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] TRBP-LGP2相互作用はmiRNA生合成とOAS-RNase L経路に作用し、ウイルス感染時のアポトーシスを誘導する2022

    • Author(s)
      Shota Azuma、Yuko Nakano、Yoshimasa Asano、Tomoko Takahashi、Koji Onomoto、Mitsutoshi Yoneyama、Kumiko Ui-Tei
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] piRNA生合成機構におけるQinの分子機能解析2022

    • Author(s)
      難波祐里香
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] In vivoケミカルマッピングによる出芽酵母ゲノムにおけるヒストンH1ホモログHho1のDNA結合2022

    • Author(s)
      落合汀、坂本優太、香川亘、柳田顕郎、清水光弘
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 出芽酵母のリボソームタンパク質遺伝子におけるHMGホモログHmo1の結合とヌクレオソームポジショニングとの関連2022

    • Author(s)
      渡邉隼太、高附宏暢、香川亘、柳田顕、加藤太陽、清水光弘
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 出芽酵母ゲノムにおけるセントロメア特異的ヌクレオソームの分子構築:in vivo ケミカルマッピングによる解析2022

    • Author(s)
      口開弥優、野上尭弘、香川亘、柳田顕郎、加藤太陽、清水光弘
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 内部寄生蜂ニホンアソバラコマユバチの飼い殺し型寄生を司る毒遺伝子の探索2022

    • Author(s)
      上山拓己、森一葉、谷直紀、中村輝、島田-丹羽裕子、丹羽隆介
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 分裂酵母における胞子クロマチン構造の網羅的解析2022

    • Author(s)
      林亜紀、中川れい子、大川恭行、中山潤一
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 生体内転写因子活性プロファイリングが明かす生活習慣による認知機能変化の機構2022

    • Author(s)
      大森彩音、山本創、安部仁美、安部健太郎
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 昼夜の学習効率の違いを生み出す脳内細胞状態変化の分子機構2022

    • Author(s)
      川島海大、森田裕也、鎌田里実、安部健太郎
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 記憶形成に関わる脳内転写因子の同定とその制御の試み2022

    • Author(s)
      福江遼太朗、白石健、小野寺諒馬、安部健太郎
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 幼若脳の神経発達においてコヒーシンローダーは遺伝子発現とクロマチン制御に必要である2022

    • Author(s)
      酒井晶子、中戸隆一郎、大庭ジーナ未来、Heiko Peters、 白髭克彦、杉山清佳
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] インプリンティングの機能解析のためのキメラ胚実験系の構築2022

    • Author(s)
      東真里奈、山口新平
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] マウス脳におけるインプリンティングの可視化と機能解明2022

    • Author(s)
      山口新平
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 胃炎・胃がん関連lncRNAはストレス顆粒形成を促進し、アポトーシスを抑制する2022

    • Author(s)
      北嶋洋志、丸山玲緒、新沼猛、髙澤啓、山本英一郎、石黒一也、吉戸文乃、甲斐正広、小山内誠、時野隆至、仲瀬裕志、鈴木拓
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Analysis for the CENP-I dependent CENP-A incorporation into centromeres2022

    • Author(s)
      Cao Jinghui、Hori Tetsuya、Fukagawa Tatsuo
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] CCAN-dependent CENP-A assembly mechanism in vertebrate cells.2022

    • Author(s)
      Hori Tetsuya、Cao Jinghui、Fukagawa Tatsuo
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] The gene expression and epigenetic regulation of individual nuclei within the same multinucleated osteoclast is heterogeneous: Evidence from Intra-single cell sequencing (iscSeq)2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Okada
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 個体成長を支える栄養基盤としてのショウジョウバエ共生微生物叢の機能解析2022

    • Author(s)
      牟禮 あゆみ、櫻井望、高橋 優喜、和多田 正義、加藤 紀彦、後藤 愛那、片山 高嶺、上村 匡、服部 佑佳子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] AS2 bodyが関わる葉の発生分化における核小体の新しい機能2022

    • Author(s)
      町田千代子、安藤沙友里、岩川秀和、栗原大輔、東山哲也、笹部美知子、小島晶子、町田泰則
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] フタホシコオロギ Gryllus bimaculatus の神経ペプチドと受容体の包括的アノテーションの事例紹介2022

    • Author(s)
      望月 孝子、坂本 美佳、谷澤 靖洋、清家瞳、祝貞、Yijun Zhou、永田晋治、中村 保一
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ショウジョウバエ骨格筋の核ラミナの組織化は、PIGBによって維持されている2022

    • Author(s)
      山本(日野)美紀
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Translational Regulation in Arabidopsis Clock Gene LHY2022

    • Author(s)
      Haruka Aoyama、Yuma Ise、Akinori Takahashi、Tadashi Yamamoto、Yukako Chiba
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 胚消化管の左右非対称な構造形成に必要なnarigonomaエンハンサーの機能の解明2022

    • Author(s)
      野村 卓矢、Florian Neugebauer、稲木 美紀子、松野 健治
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] インプリントDMRは大腸オルガノイドで維持されている2022

    • Author(s)
      成瀬美衣
    • Organizer
      第49回日本毒性学会学術年会
  • [Presentation] Novel mechanisms for the regulation of Irf8 gene expression during dendritic cell differentiation2022

    • Author(s)
      Takaya Yamasaki、Akira Nishiyama、Tomohiko Tamura
    • Organizer
      第51回日本免疫学会学術集会
  • [Presentation] Tissue-specific deficiency of clonally expanded regulatory T cells underlies tissue-restricted inflammation in Foxp3 A384T mutant mice.2022

    • Author(s)
      Yoshimichi Hoshiya、Ryuichi Murakami、Shohei Hori
    • Organizer
      第51回日本免疫学会学術集会
  • [Presentation] キイチゴ属の分布限界域における交雑は親種 に適応的遺伝資源を供給するか2022

    • Author(s)
      木時始穂、唐振興、三村真紀子
    • Organizer
      第54回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] TERT領域へのHBVゲノム挿入が癌形質獲得に与える影響2022

    • Author(s)
      新田 沙由梨、柿沼 晴、持田 知洋、渡壁 慶也、志水 太郎、土屋 淳、三好 正人、北畑 富貴子、村川 美也子、井津井 康浩、中川 美奈、東 正新、朝比奈 靖浩
    • Organizer
      第58回日本肝臓学会総会
  • [Presentation] 1細胞解析、空間的transcriptome解析を用いた放射線治療によるがん微小環境 変化の解析2022

    • Author(s)
      影山 俊一郎
    • Organizer
      第60回日本癌治療学会学術集会
  • [Presentation] 廃用関節では滑膜マクロファージおよび滑膜線維芽細胞の特異的クラスターが軟骨変性に寄与する2022

    • Author(s)
      石倉 久年、齋藤 琢
    • Organizer
      第61回日本生体医工学会大会2022
  • [Presentation] プラズマローゲン生産株の探索と効率的プラズマローゲン生産法の検討2022

    • Author(s)
      桑原 芽美、入交 伶、藤野 泰寛、本庄 雅則、馬渡 志郎、藤野 武彦、土居 克実
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
  • [Presentation] 遺伝子発現から見た植物共生細菌の種間相互作用と代謝スイッチング2022

    • Author(s)
      石澤秀紘、田代陽介、井上大介、池道彦、二又裕之
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
  • [Presentation] 古人骨ゲノム解析から見た千葉県縄文後晩期の婚姻システム2022

    • Author(s)
      脇山由基、和久大介、中村友香、小金渕佳江、渡辺裕介、大橋順、米田穣、藤田尚、長岡朋人、平田和明、高橋龍三郎、太田博樹
    • Organizer
      第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会
  • [Presentation] 次世代シークエンサ―解析による古人骨DNA残存量と環境および分子因子の相関関係の研究2022

    • Author(s)
      中村友香、和久大介、脇山由基、渡辺裕介、小金渕佳江、長岡朋人、平田和明、大橋順、米田穣、高橋龍三郎、太田博樹
    • Organizer
      第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会
  • [Presentation] メダカ地域集団を用いたアルツハイマー病関連遺伝子と新奇性追及との関連性の検証2022

    • Author(s)
      木村文昭、笠原麗美、太田博樹、小川元之、竹内秀明、勝村啓史
    • Organizer
      第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会
  • [Presentation] 内側視索前野へ投射する扁桃体海馬野ニューロンは養育行動と攻撃行動をコードする異なる2つのニューロン集団を有する2022

    • Author(s)
      佐藤 圭一郎
    • Organizer
      第7回脳と心の研究会
  • [Presentation] 父性発現に寄与する内側視索前野ニューロン変化の分子メカニズム2022

    • Author(s)
      天野大樹
    • Organizer
      第7回脳と心の研究会
  • [Presentation] Transposon-based screening of metastasis-related genes in a colorectal cancer mouse model2022

    • Author(s)
      藤下晃章、梶野リエ、三城恵美、武藤誠、青木正博
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 非コードRNA転写とスーパーエンハンサー活性化によるゲノムの3次元構造維持機構2022

    • Author(s)
      西村聡、佐々木麻起子、高木正稔、磯田健志
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Clinical validity of plasma and urinary pellet DNA monitoring for the diagnosis of recurrent bladder cancer2022

    • Author(s)
      Masakazu Abe、Hayato Hiraki、Daichi Tamura、Renpei Kato、Yoichiro Kato、Shigekatsu Maekawa、Mitsugu Kanehira、Ryo Takata、Wataru Obara、Satoshi Nishizuka
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Multifaceted interactions between cancer cells and glial cells in brain metastasis2022

    • Author(s)
      Eishu Hirata
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] エクソソームを標的とした早期膵臓がんバイオマーカーの開発2022

    • Author(s)
      吉岡 祐亮、下村 真菜美、齊藤 桂吾、石井 秀始、土岐 祐一郎、 江口 英利、中面 哲也、森 正樹、落谷 孝広
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] m6A により制御される PLK1 の細胞周期恒常性は膵癌において新規 放射線治療の標的となる2022

    • Author(s)
      立川 章太郎、玉利 慶介、千々松 良太、光藤 傑、秋田 裕史、小林 省吾、村雲 芳樹、土岐 祐一郎、江口 英利、小川 和彦、石井秀始
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] FXYD3, a subunit of Na+ K+ pump, determines the root of triple-negative breast cancer stem-like cells2022

    • Author(s)
      Mengjiao Li
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] シングルセル免疫プロファイリングによる末端黒子型黒色腫の腫瘍浸潤リンパ球の解析2022

    • Author(s)
      箕輪智幸、村田憲治、廣橋良彦、宇原 久、鳥越俊彦
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] PSPC1はESR1およびSCFD2遺伝子を転写後調節しエストロゲン受容体陽性乳がんの増殖を制御する2022

    • Author(s)
      竹岩俊彦、池田和博、鈴木貴、佐藤航、川端英孝、堀江公仁子、井上聡
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Investigation of the ability of inducing type I IFNs in the tumor microenvironment2022

    • Author(s)
      小坂朱
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 膵癌のシングルセル RNA シークエンスデータセットの統合と再構築2022

    • Author(s)
      竹田 佑、千々松 良太、小林 省吾、北風 雅敏、山田 大作 、高橋 秀典、森 正樹、土岐 祐一郎、江口 英利、石井 秀始
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] miRNA 改変型核酸医薬品はマウス消化器がんモデルで腫瘍を効果的に抑制する2022

    • Author(s)
      佐藤 広陸、佐々木 一樹、荒尾 泰子、中山 実香、竹田 佑、山田 大作、富丸 慶人、三吉 範克、高橋 秀典、小林 省吾、森 正 樹、土岐 祐一郎、江口 英利、石井 秀始
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] シングルセル系譜解析による大腸がん患者由来drug-tolerant persister細胞の追跡2022

    • Author(s)
      森野峻、馬島哲夫、鈴木穣、長山聡、片山量平、清宮啓之
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] A lncRNA associated with chronic gastritis and gastric cancer promotes stress granule formation and inhibits apoptosis.2022

    • Author(s)
      Hiroshi Kitajima、Reo Maruyama、Takeshi Niinuma、Akira Takasawa、Eiichiro Yamamoto、Kazuya Ishiguro、Ayano Yoshido、Masahiro Kai、Makoto Osanai、Takashi Tokino、Hiroshi
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 中枢神経胚細胞腫のomics解析による起源細胞の同定と病態の解明2022

    • Author(s)
      高見浩数、他
    • Organizer
      第81回脳神経外科学術総会
  • [Presentation] 樹状細胞分化におけるIrf8遺伝子発現を制御するエンハンサー群の相互作用2022

    • Author(s)
      山﨑 貴弥、西村 耕太郎、西山 晃、田村 智彦
    • Organizer
      第84回日本血液学会学術集会
  • [Presentation] Identification of human pDC/B bifurcation with highly fluctuating cell state dynamics2022

    • Author(s)
      永春 圭規、小嶋 泰弘、廣瀬 遥香、日野原 邦彦、 杦本 由香、 仁井 栄、俵 功、島村 徹平、片山 直之、大石 晃嗣
    • Organizer
      第84回日本血液学会学術集会
  • [Presentation] 廃用関節では滑膜マクロファージおよび滑膜線維芽細胞の特異的クラスターが軟骨変性に寄与する2022

    • Author(s)
      石倉 久年、齋藤 琢
    • Organizer
      第8回日本筋学会学術集会
  • [Presentation] ザゼンソウ熱産生組織における包括的なトランスクリプトーム及びメタボローム解析2022

    • Author(s)
      谷本 悠、伊藤 菊一
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] Brain sodium sensors underlying body homeostasis2022

    • Author(s)
      Takeshi Hiyama
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] ラビリンチュラ類におけるステロール組成の変化に応じた細胞死および細胞分裂の制御機構の解明2022

    • Author(s)
      山口 舞、石橋 洋平、西田 裕貴、林 雅弘、伊東 信、沖野 望
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 腎臓における尿酸輸送体としてのOAT10の分子生理学的理解2022

    • Author(s)
      豊田優、高田龍平、河村優輔、中山昌喜、森本渓音、清水聖子、四ノ宮成祥、小林靖、松尾洋孝
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] The gene expression and epigenetic regulation of individual nuclei within the same osteoclast is heterogeneous: Evidence from Intra-single cell sequencing (iscSeq)2022

    • Author(s)
      Hiroyuki Okada
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Presentation] 内側視索前野へ投射する扁桃体海馬野ニューロンは養育行動と攻撃行動をコードする異なる2つのニューロン集団を有する2022

    • Author(s)
      佐藤 圭一郎、南 雅文、天野 大樹
    • Organizer
      第96回日本薬理学会年会/第43回日本臨床薬理学会学術総会
  • [Presentation] The mechanisms of which microglia are related to the pathology in the “primary astrocytic disease" Alexander disease2022

    • Author(s)
      齋藤光象
    • Organizer
      第96回日本薬理学会年会/第43回日本臨床薬理学会学術総会
  • [Presentation] 雑草や食品ゴミから都市ガスと電気を生み出す「牛の胃の微生物を使用した 再生可能メタン発酵システム」2022

    • Author(s)
      馬場保徳
    • Organizer
      超異分野学会豊橋フォーラム2022
  • [Presentation] RNAポリメラーゼII-C末端ドメイン脱リン酸化酵素による転写活性領域制御機構の解明2022

    • Author(s)
      澁田未央
    • Organizer
      東北植物学会 第12回大会
  • [Presentation] シロイヌナズナの新規染色体部分的重複変異体における遺伝子発現変動とクロマチン動態2022

    • Author(s)
      杉田和陽、サンジャヤ アルビン、西嶋遼、田中裕之、伊藤武彦、村井耕二、阿部知子、風間裕介
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] ガンマ線が植物ゲノムへ与える影響を照射当代シロイヌナズナのゲノム解析で見る2022

    • Author(s)
      北村智、佐藤勝也、大野豊
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] オウトウショウジョウバエにおける雄の交尾器pregoniteの形態進化の遺伝基盤2022

    • Author(s)
      酒井杏花、田中健太郎、藤近敬子、髙橋文
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] 動原体タンパク質に依存したセントロメアの位置情報の書き込みメカニズム2022

    • Author(s)
      堀 哲也、曹静暉、深川竜郎
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] ショウジョウバエRNAメチル化酵素METTL1はtRNAのm7G修飾を介して精子形成・稔性を制御する2022

    • Author(s)
      金子隼也、三好啓太、近藤周、豊田敦、寺内真、野口英樹、齋藤都暁
    • Organizer
      日本遺伝学会第94回大会
  • [Presentation] 染色体スケールのホウレンソウゲノム配列を活用した間性株の雌花率に関するQTL解析2022

    • Author(s)
      山野薫、豊田敦、平川英樹、小野寺康之
    • Organizer
      日本育種学会・日本作物学会北海道談話会年次講演会
  • [Presentation] イネいもち病抵抗性遺伝子 Pias と対応する非病原 力遺伝子 AVR-Pias の単離2022

    • Author(s)
      清水 元樹、杉原 優、宮路 直実 阿部 陽、寺内 良平
    • Organizer
      日本育種学会第142回講演会
  • [Presentation] ホウレンソウ間性株における雌花着生率に関するQTL解析2022

    • Author(s)
      山野 薫、豊田 敦、平川 英樹、小野寺 康之
    • Organizer
      日本育種学会第142回講演会
  • [Presentation] 遺伝研NBRPの野生イネ:どんどん使ってね! 野生イネの研究基盤整備と活用例2022

    • Author(s)
      津田勝利
    • Organizer
      日本育種学会第142回講演会
  • [Presentation] 日本産キセルガイのPhylogenomics(予報)2022

    • Author(s)
      石川彰人、スティアマルガ・デフィン、豊田敦、鈴木穣、上島励
    • Organizer
      日本貝類学会令和4年度大会
  • [Presentation] ゲノム進化のモデル生物と 疾患の解明を目指す スエヒロタケの全ゲノム解析2022

    • Author(s)
      松前 ひろみ、坂本 美佳、小木曽 映里、須藤 恵美、クリュコフ キリル、望月 孝子、谷澤 靖洋、今西 規、豊田 敦、中村 保一、亀井 克彦、細矢 剛
    • Organizer
      日本菌学会第66回大会
  • [Presentation] 緑藻のC/Nストレス応答におけるタンパク質リン酸化酵素TAR1とDYRKP1の機能比較2022

    • Author(s)
      石川 拓海、辻 敬典、木下 あかり、新川 はるか、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      日本植物学会第86会大会
  • [Presentation] CO2濃縮機構を制御する緑藻クラミドモナスのWWドメイン含有タンパク質2022

    • Author(s)
      嶋村 大亮、安田 詢子、大垣 美萌、山原 洋佑、山野 隆志、福澤 秀哉
    • Organizer
      日本植物学会第86会大会
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるアブシシン酸生合成鍵酵素遺伝子変異株の生理化学的解析2022

    • Author(s)
      中野美波、川上直人、岡本昌憲
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] 異なる性表現タイプのボ ルボックス間比較ゲノム解析からホモタリック化に伴う性決定領域の進化を探る2022

    • Author(s)
      山本荷葉子、松崎 令、Wuttipong Mahakham、Wirawan Heman、関本弘之、河地正伸、水口洋平、豊田敦、野崎久義
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] シュート再生能の獲得に関与するエピジェネティック制御因子の機能解析2022

    • Author(s)
      右橋 雅子、坂本 卓也、大矢恵代、稲垣 宗一、鈴木 穣、角谷 徹仁、松永 幸大
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] 多細胞性接合藻類アオミドロのゲノム解読2022

    • Author(s)
      西山智明、池谷仁里、高野智之、坂山英俊、関本弘之
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] ゼニゴケ幹細胞領域におけるNACファミリー遺伝子JINGASAの機能解析2022

    • Author(s)
      高橋 剛、清末 知宏、平川 有宇樹
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] シュート再生能の獲得に関与するヒストンメチル化酵素の機能解析2022

    • Author(s)
      右橋雅子、坂本卓也、大矢恵代、稲垣宗一、鈴木穣、角谷徹仁、松永幸大
    • Organizer
      日本植物形態学会第34回総会・大会
  • [Presentation] 更新世絶滅動物のDNA配列データからのターゲット由来配列の情報学的な抽出とSNP解析2022

    • Author(s)
      森宙史
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] 集団遺伝学のモデル菌類としてのスエヒロタケのゲノム解析2022

    • Author(s)
      松前ひろみ、坂本美佳、小木曽映里、須藤恵美、クリュコフ キリル、望月孝子、谷澤靖洋、今西規、今西規、豊田敦、中村保一、亀井克彦、細矢剛
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] 新奇性追求の遺伝基盤とその進化的意義の解明に向けた取り組み2022

    • Author(s)
      木村文昭、笠原麗美、太田博樹、小川元之、竹内秀明、勝村啓史
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] 遺伝的多様性とエピジェネティック多様性の相互補償性の検証2022

    • Author(s)
      勝村啓史
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] Genomic divergence of Drosophila albomicans in Japan via migration from Taiwan2022

    • Author(s)
      Lulecioglu、Sultan、Ogawa、Yoshitaka、Tamura、Koichiro
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] オウトウショウジョウバエにおける雄生殖器surstylusの機能および遺伝的基盤の解明2022

    • Author(s)
      熊谷颯之、酒井杏花、藤近敬子、田中健太郎、上村佳孝、髙橋文
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] オウトウショウジョウバエにおける雄交尾器pregoniteの形態進化の背景にある遺伝機構の変化を探る2022

    • Author(s)
      酒井杏花、田中健太郎、藤近敬子、髙橋文
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] ヒメミカヅキモにおけるコピー数変異がもたらした顕著なゲノムサイズ多型と遺伝子発現への影響2022

    • Author(s)
      川口也和子、土金勇樹、田中啓介、太治輝昭、豊田敦、西山智明、関本弘之、土松隆志
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] クワガタムシ科におけるtransformer 遺伝子の解析2022

    • Author(s)
      大津 樹、山内 花音、後藤 寛貴
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] 長寿命植物Shorea laevisにおける幹細胞突然変異速度と分布について2022

    • Author(s)
      今井亮介、佐々木江理子、藤野健、笠原雅弘、谷尚樹、陶山佳久、佐竹暁子
    • Organizer
      日本進化学会第24回沼津大会
  • [Presentation] Effect of the chromatin domains on clustered breakpoint formation in complex chromosomal rearrangement2022

    • Author(s)
      Hidehito Inagaki、Takema Kato、Atsushi Toyoda、Yoshio Makita、Hiroki Kurahas
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第67回大会
  • [Presentation] 腎性低尿酸血症の原因遺伝子URAT1/SLC22A12の日本人30,685名における臨床遺伝学的解析:実際的診断に向けて2022

    • Author(s)
      河村優輔、中山昌喜、清水聖子、豊田優、染谷真澄、小田悠太、鳥羽美帆、川口真、鈴木聡子、岩澤聡子、中島宏、高田龍平、角田正史、有澤幸吉、嶽崎俊郎、田中恵太郎、市田公美、若井建志、四ノ宮成祥、松尾洋孝
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第67回大会
  • [Presentation] RNA polymerase II(RNAPII) Ser7 リン酸化は、 転写と共役したヌクレオソーム再構築を促進して 転写一時停止を安定化する。2022

    • Author(s)
      梶谷卓也、加藤太陽、沖昌也、木村宏、大川恭行、小布施力史、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      日本生化学会北陸支部第40回大会
  • [Presentation] ミナトカモジグサ菌根共生系におけるリン獲得の菌種特徴的分子機構2022

    • Author(s)
      永山航平、菅井徹人、佐藤匠、神山拓也、市橋泰範、渡部敏裕、信濃卓郎、丸山隼人
    • Organizer
      日本土壌肥料学会2022年度東京大会
  • [Presentation] カブトムシの角の機械的強度の増加に関与する転写制御メカニズム2022

    • Author(s)
      森田慎一、新美輝幸
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
  • [Presentation] 日本産淡水棲マミズクラゲの分子系統解析と伝播の考察2022

    • Author(s)
      小林千余子、角谷正朝、中野夏海、川島牧、裏山悟司、永渕昭良
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
  • [Presentation] 寄生蜂A. japonicaに対する、宿主・非宿主ショウジョウバエの応答の比較解析2022

    • Author(s)
      森一葉、上山拓己、島田裕子、丹羽隆介
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
  • [Presentation] Deep single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula2022

    • Author(s)
      Shunta Sakaguchi、Yasushi Okochi、Chiharu Tanegashima、Osamu Nishimura、Mitsutaka Kadota、Honda Naoki、Takefumi Kondo
    • Organizer
      日本発生生物学会第55回大会
  • [Presentation] Single-nucleus RNA-seq identifies transcriptional regulation of embryonic neuromuscular junction in skeletal muscle2022

    • Author(s)
      Bisei Ohkawara
    • Organizer
      日本発生生物学会第55回大会
  • [Presentation] 水稲根圏微生物叢の形成に及ぼす水稲品種、土壌タイプ、施肥の影響2022

    • Author(s)
      天野 真宏、長谷川 昂平、森 拓也、西内 俊策、土井 一行、勝見尚也、Rasit ASILOGLU、高橋 宏和、中園 幹生、村瀬 潤
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
  • [Presentation] “湖の微生物生態系”を対象としたゲノム・多型・遺伝子発現の網羅的比較解析2022

    • Author(s)
      岡崎友輔、中野伸一、豊田敦、玉木秀幸
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
  • [Presentation] The short-term variation of virus community in an enclosed bay of Japan2022

    • Author(s)
      Xia J.、Fang Y.、Yang Q.、Okazaki Y.、Yoshida T.、Nagasaki K.、Hisashi E.、Ogata H.
    • Organizer
      日本微生物生態学会第35回大会
  • [Presentation] FGF受容体ファミリーの変異が子宮頸癌放射線治療予後に及ぼす影響2022

    • Author(s)
      吉本由哉、佐々木泰史、尾池貴洋、安藤謙、濱本純子、鈴木義行、中野隆史、時野隆至、大野達也
    • Organizer
      日本放射線腫瘍学会第35回学術大会
  • [Presentation] 染色体再編成が植物ゲノムに及ぼす影響2022

    • Author(s)
      杉田和陽、サンジャヤ アルビン、西嶋遼、田中裕之、伊藤武彦、阿部知子、風間裕介
    • Organizer
      北陸植物学会第12回大会
  • [Presentation] 社会環境依存型の性転換における脳下垂体の関与2022

    • Author(s)
      山本優芽、花井匠磨、Chakraborty Tapas、豊田敦、伊藤武彦、松山倫也、長濱嘉孝、太田耕平
    • Organizer
      令和4年度日本水産学会秋季大会
  • [Presentation] 内分泌撹乱物質を曝露した胎仔マウス脳における神経系遺伝子の発現変動2022

    • Author(s)
      細瀬摩利、白根共太、石橋知佳、伊藤琴音、田川幸樹、松島綾美
    • Organizer
      令和4年度日本生化学会九州支部例会
  • [Book] 古代ゲノムから見たサピエンス史2023

    • Author(s)
      太田 博樹
    • Total Pages
      272
    • Publisher
      吉川弘文館
    • ISBN
      978-4642059657
  • [Book] ゲノム編集技術~実験上のポイント/産業利用に向けた研究開発動向と安全性周知2023

    • Author(s)
      小西 裕之、兵頭 寿典
    • Total Pages
      315
    • Publisher
      情報機構
    • ISBN
      978-4865022421
  • [Book] 科学で読みとく縄文社会2022

    • Author(s)
      脇山 由基、太田 博樹
    • Total Pages
      216
    • Publisher
      同成社
    • ISBN
      978-4886218865
  • [Book] Edible Alliums, Botany, Production and Uses2022

    • Author(s)
      Mostafa Abdelrahman、Masayoshi Shigyo
    • Total Pages
      328
    • Publisher
      Cab Intl
    • ISBN
      978-1789249996
  • [Book] 金魚いろ×かたち謎解き図鑑2022

    • Author(s)
      大森 義裕
    • Total Pages
      116
    • Publisher
      化学同人
    • ISBN
      978-4759823301
  • [Book] 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド2022

    • Author(s)
      鈴木 穣
    • Total Pages
      244
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4758122610
  • [Remarks] 領域ホームページ

    • URL

      https://www.genome-sci.jp/

  • [Remarks] SonicParanoid(高速オルソログ遺伝子解析ソフトウェア)

    • URL

      http://iwasakilab.k.u-tokyo.ac.jp/sonicparanoid/

  • [Remarks] Mirage(ゲノム進化史再構築ソフトウェア)

    • URL

      https://github.com/fukunagatsu/Mirage

  • [Remarks] Fern Tree of Life(シダ系統樹データベース)

    • URL

      https://fernphy.github.io/

  • [Remarks] Evodictor(ゲノム進化予測ソフトウェア)

    • URL

      https://github.com/IwasakiLab/Evodictor

  • [Patent(Industrial Property Rights)] がんの診断のためのOTSライブラリー2022

    • Inventor(s)
      開 勇人、西塚 哲
    • Industrial Property Rights Holder
      株式会社クオントディテクト
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願PCT/JP2022/043189
    • Overseas
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 膀胱癌に関連した変異DNAの分析方法、並びにそのためのデジタルPCR用プライマー及びプローブ2022

    • Inventor(s)
      阿部 正和、西塚 哲
    • Industrial Property Rights Holder
      株式会社クオントディテクト
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2022-209854
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 脳転移がん抑制剤又は治療剤2022

    • Inventor(s)
      平田 英周、石橋 公二朗
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人金沢大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2022-020000
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 免疫チェックポイント阻害剤に対する感受性の検査方法2022

    • Inventor(s)
      小玉 尚宏、村井 大毅、竹原 徹郎
    • Industrial Property Rights Holder
      小玉 尚宏、村井 大毅、竹原 徹郎
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2022-74111
  • [Patent(Industrial Property Rights)] Galectin-7阻害剤を用いた癌転移抑制剤2022

    • Inventor(s)
      久場 敬司、本山 悟、安 健博、鈴木 穣
    • Industrial Property Rights Holder
      秋田大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2022-143622

URL: 

Published: 2023-12-25  

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