2023 Fiscal Year Research-status Report
脂質酸化酵素リポキシゲナーゼによる魚類香気の生合成機序
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22K05828
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Research Institution | Fisheries Research and Education Agency |
Principal Investigator |
河邉 真也 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産大学校, 講師 (60579415)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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Keywords | リポキシゲナーゼ / 完全長cDNA / GC/MS / 香気分析 |
Outline of Annual Research Achievements |
完全長cDNA配列を得るために、RACE-PCRに着手した。SMART法により3’-RACEを実施し、ポリA尾部を含むcDNAの3’-側の未知領域の解読を試みた。また、5’-キャップ構造を持つ完全長mRNAのみからRACE-ready cDNAを構築するoligo-capping法により5’-RACEを実施し、転写開始点を含むcDNAの5’-側の未知領域の解読を試みた。5’-および3’-RACEにより、ウマヅラハギ12S-LOXおよびEF-1α、マサバEF-1αのオープンリーディングフレーム(ORF)を同定し、さらに転写開始点を含む5’-非翻訳領域(UTR)とポリA尾部を含む3’-UTRの同定に成功した。マサバ12S-LOXにおいては、3’-RACEにより3’-UTRの同定に成功したが、5’-RACE産物は得られなかった。次に、遺伝子のプロモーター領域を同定するために、転写開始点より上流の未知ゲノムDNA領域の解析に着手した。ウマヅラハギとマサバの普通筋からゲノムDNAを精製し、制限酵素処理に供した後、アダプター配列を付加することでゲノムウォーキングのライブラリーを構築した。遺伝子解析と平行して、魚類組織の香気分析に着手した。マサバの背側と腹側の普通筋、鰓、皮、血合筋の5組織を封入したバイアル内に発生するヘッドスペースガスをSPMEファイバーに吸着・濃縮し、GC/MS分析に供した。また、ヘッドスペースガスをにおい識別センサーシステム(α-FOX)に供し、得られたセンサー応答値を主成分分析することで組織間の香気の識別を試みた。GC/MS分析により、アルコール類とアルデヒド類のピーク面積は鰓が最も大きいことから、鰓のLOX活性が他組織よりも高いことが示唆された。α-FOX分析により、5組織は全て識別が可能であり、血合筋の香気が他組織よりも強いことが示唆された。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度は、RACE-PCRによりマサバおよびウマヅラハギの12S-LOX遺伝子とEF-1α遺伝子の完全長cDNA配列の取得を試みた。マサバの12S-LOXの5’-RACEからは目的のPCR産物は得られなかったが、他のRACE-PCRからは目的の遺伝子が増幅され、計画通りに完全長cDNA配列を取得することができた。これらの3遺伝子は転写開始点とORFが同定できたため、プロモーター領域の解析とタンパク質合成実験を行うための基盤が整ったことになる。平行して、鮮魚の魚臭さを構成するアルコール類やアルデヒド類(短鎖オキシリピン)の組織分布と組織間の香気の特徴を、マサバにおいて明らかにした。これらの知見から、遺伝子発現レベル、酵素活性および短鎖オキシリピン量との関係性を考察することが可能となる。これらの進捗状況から、おおむね順調に進展していると判断した。
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Strategy for Future Research Activity |
タンパク質レベルで12S-LOXとEF-1αを検出するために、同定したORFから一次構造を予測し、抗原に適した箇所の合成ペプチドを用いて抗ペプチドポリクローナル抗体を作製する。また、ゲノムウォーキング法により、12S-LOX遺伝子の転写開始点より上流のゲノムDNAを解析し、プロモーター領域の情報を得る。さらに、無細胞系翻訳システムの条件設定に着手する。oligo-capping法とは原理が異なるが、SMART法においても転写開始点までPCRで伸長させることが可能と考えられる。そこで、本年度に情報が得られなかったマサバ12S-LOXの5’-RACEについては、SMART法を検討する。
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Causes of Carryover |
シーケンス解析が予定より少なくなったため、次年度使用額が生じた。次年度のシーケンス解析費用にあてる予定である。
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