2022 Fiscal Year Research-status Report
猫遺伝性多発性嚢胞腎の個体別重症度・進行度の差異のメカニズム解明
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22K06000
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| Research Institution | Iwate University |
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Principal Investigator |
小林 沙織 岩手大学, 農学部, 助教 (60566214)
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2022-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 猫多発性嚢胞腎 / 個体別重症度 / 遺伝疾患 / PKD遺伝子 / 次世代シークエンス / 疫学調査 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、遺伝子配列の変化を検出し、生死判別式を作成することで、猫多発性嚢胞腎の重症度や進行度を予測する因子を明らかにすることを目的としている。
①多発性嚢胞腎に罹患した猫の死亡年齢調査
まず、2015～2021年まで岩手大学附属動物病院でのPKD遺伝子検査が陽性判定だった症例を対象にフォローアップ調査を実施し、死亡年齢を疫学調査した。その結果、これまで経験則のみでの判断だった早期進行群の平均死亡年齢が明らかとなった。この年齢を基に、早期進行群と通常進行群にPKD陽性猫を群分けした。また、本症関連死のリスク因子を抽出した。
②重症度の異なる猫多発性嚢胞腎における全ゲノム配列の解析
本症の個体別重症度や進行度の差異に既知のPKD1遺伝子変異の他の遺伝子変異が関与しているとの仮説を立て、次世代シークエンスを利用して、早期に死亡した多発性嚢胞腎猫（2頭）と老齢まで生存可能であった多発性嚢胞腎の猫（3頭）、本遺伝病を持たない猫（5頭）の全ゲノム解析を実施した。シーケンスリードは高いクオリティを示し、マッピングレートは94.7～98.15％と良好であった。3群において、SnpEffによるアノテーションで得られた各変異について群内共通遺伝子型変異を抽出し、プログラムggVennDiagramにて群共通・特異的遺伝子型変異を抽出した。その結果、PKD通常進行群とPKD早期進行群の比較では、早期進行群に特異的な遺伝子変異は3,286,984リードが検出された。今後は早期進行群でのみ見られた、アミノ酸配列への影響がHighかつトランケーティング変異を抽出して、これまで保存している早期進行型に分類されるPKD陽性猫のDNAを使用して、共通変異を検索していく予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
早期進行型の猫DNAが入手でき次世代シークエンスの変異解析が終了したため、計画通りに2年目では変異配列の特定ならびに多発性嚢胞腎DNAでの変異配列有無の確認に着手予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は早期進行群でのみ見られた、アミノ酸配列への影響がHighかつトランケーティング変異を抽出して、これまで保存している早期進行型に分類されるPKD陽性猫のDNAを使用して、共通変異を検索していく予定である。
また、同時にた0-3歳齢の多発性嚢胞腎猫のCT検査による腎容積、臨床データ（血中クレアチニンや尿素窒素、SDMAなどの腎機能マーカー、尿中のN-アセチルグルコサミニダーゼ(NAG)や尿比重、尿蛋白など）を、これまで作成した4～9歳齢における判別式に加え、より精度のある判別式の作成を試みる。
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| Causes of Carryover |
次世代シークエンスの解析に数か月要し、年度内に終了しなかったため
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