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2022 Fiscal Year Research-status Report

Regulation of mRNA polyA tail length in response to nutrient signaling and its physiological role

Research Project

Project/Area Number 22K06074
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

入江 賢児  筑波大学, 医学医療系, 教授 (90232628)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords酵母 / mRNA / Ccr4 / Ccr4-Not複合体 / Puf5 / 細胞周期 / サイクリンB
Outline of Annual Research Achievements

本研究計画では、出芽酵母を用いて、栄養リッチなシグナルおよび栄養飢餓のシグナルによる酵母の増殖制御をRNAレベルで調節する系を用いて解析する。Ccr4-Not複合体は、細胞質における主要なデデニラーゼであり、mRNAの分解に機能している。CLB1-6遺伝子は、サイクリン依存性キナーゼCdc28と共に細胞周期進行に関与するB型サイクリンをコードする。Ccr4によるCLB1-6の発現制御について検討した。その結果、ccr4Δ変異体では、すべてのCLB1-6 mRNAレベルが野生型細胞のそれと比較して有意に増加した。CLB6 mRNA内のCcr4を介した制御のためのシスエレメントをさらに分析した結果、コード配列と3'非翻訳領域(3'UTR)の両方に不安定化する配列が存在することがわかった。CLB6の3'UTRはmRNAの不安定化とレポーターGFP遺伝子の減少に十分であり、この不安定化にはCcr4が関与していた。これらの結果から、CLB6の発現が、CLB6 mRNAのコード配列と3'UTRを介してCcr4により制御されていることが示唆された。
また、Puf ファミリー RNA 結合タンパク質Puf5について解析した。puf5Δ clb2Δ二重変異体は増殖低下を示したことから、Puf5が細胞周期進行においてClb2と重複する因子の発現を正に制御していることが示唆された。puf5Δ変異体では、CLB1の発現が低下しており、このCLB1の発現低下がpuf5Δ clb2Δ二重変異体の成長障害に寄与していることがわかった。これらの結果から、Puf5が細胞周期特異的なCLB1の発現制御を通じて細胞周期の進行に寄与していることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究計画では、出芽酵母を用いて、栄養リッチなシグナルおよび栄養飢餓のシグナルによる酵母の増殖制御をRNAレベルで調節する系を用いて解析する。
この研究では、5つのテーマ、①栄養源からのシグナルによるCcr4-Not複合体の活性調節機構、②Pan2-Pan3複合体、Pbp1によるポリA鎖の長さの調節とその生理的役割、③対数増殖期と定常状態におけるポリA鎖の長さと翻訳効率・mRNA安定性の関係、④RNA結合タンパク質Nab6とポリAポリメラーゼPap1による翻訳制御機構、⑤栄養シグナル、栄養飢餓シグナルによるタンパク質の時空間発現制御におけるCcr4-Not複合体、Pan2-Pan3複合体、Pbp1の働きの全体像、をあげているが、すべての因子の変異株、二重変異株等を作製を終えて、解析を進めており、全て順調にデータが得られている。

Strategy for Future Research Activity

Ccr4-Not複合体による細胞増殖の制御、Pan2-Pan3複合体とPbp1の非発酵性炭素源での増殖機能、Ccr4-Not複合体とPan2-Pan3複合体のリン酸化などから、栄養シグナル、栄養飢餓シグナルによる遺伝子発現の転写後制御の全体像を明らかにする。また、定常状態におけるポリA鎖の長さの重要性について、その制御の一般性、遺伝子特異性について解析する。さらに、2022年度に明らかになったCcr4とPuf5による細胞周期の制御機構についてもさらに解析する。

Causes of Carryover

実験消耗品をできるだけ節約し、次年度以降の実験に有効利用しようと考えた。次年度使用額は実験消耗品に利用する。

  • Research Products

    (2 results)

All 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results)

  • [Journal Article] Regulation of CLB6 expression by the cytoplasmic deadenylase Ccr4 through its coding and 3' UTR regions2022

    • Author(s)
      Jastin Edrian Cocuangco Revilleza, Megumi Sato, Kaoru Irie, Yasuyuki Suda, Tomoaki Mizuno, Kenji Irie
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 14 Pages: e0268283

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0268283

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The RNA-binding protein Puf5 and the HMGB protein Ixr1 contribute to cell cycle progression through the regulation of cell cycle-specific expression of CLB1 in Saccharomyces cerevisiae2022

    • Author(s)
      Megumi Sato, Kaoru Irie, Yasuyuki Suda, Tomoaki Mizuno, Kenji Irie
    • Journal Title

      PLoS Genetics

      Volume: 18 Pages: e1010340

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1010340

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2023-12-25  

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