希少糖による腸内細菌叢制御を基盤とした新たな免疫制御法の開発

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 22K06663
• Research Institution: Kagawa University
• Principal Investigator: 内田 俊平 香川大学, 医学部附属病院, 助教 (20791099)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: 希少糖 / 短鎖脂肪酸 / 免疫制御

Outline of Annual Research Achievements

複数のC57BL/6Jマウスを同一ケージで飼育し腸内細菌叢を均一化した後に単頭飼育することにより、糞食が腸内細菌叢に及ぼす影響を回避する。この状態で、ベースラインの糞便と、３％D-タガトース水溶液または水道水を４週間自由摂取させた後の糞便を採取し、16S rRNA遺伝子領域を次世代シーケンサーで解析し、腸内細菌叢を決定した。統計学的に有意な変化が認められたのはClostridiales目に属している細菌群であることが改めて明らかとなった。Clostridiales目細菌は、難消化性である食物繊維を代謝して短鎖脂肪酸（主に酪酸、プロピオン酸、酢酸）を産生する。この中でとりわけ酪酸は、免疫調節作用や腸管上皮保護作用により、適切な腸管免疫環境の維持に重要な役割を果たすことから、糞便中の短鎖脂肪酸濃度測定を実施した。この結果、当初の想定に反して、３％D-タガトース水溶液投与群では、n-酪酸の糞便中の濃度が低下し、他の短鎖脂肪酸においては酢酸やプロピオン酸濃度の低下も同時に認められた。一方で乳酸やコハク酸は増加が認められた。ギ酸、iso-酪酸、iso-吉草酸、n-吉草酸に関してはいずれの群においても濃度が低く、有意な変化とは考えていない。他の希少糖についても、同様の検討を進めている。具体的にはD-アルロースについては腸内細菌叢解析を実施し、ラクノスピラ科の細菌群やアトポビアセア・パルブラム等の細菌の増加を認めている。D-アロースについても同様に解析中である。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

最終年度に向けて全てのデータ取得を終了させる予定であったが、16S rRNA遺伝子領域解析の解釈による遅れおよび、この解析結果から発展的に予測メタゲノム解析を実施したために、遅延している。予測メタゲノム解析では、当初の想定通りD-タガトースの投与により酪酸産生に関与する遺伝子群の変化が改めて示されたが、コスト面から腸内細菌叢のメタゲノム解析は実施しないこととして、短鎖脂肪酸を中心とした質量分析法による直接測定を主軸にデータ取得を進めることとした。

Strategy for Future Research Activity

既に収集したデータについては、アップデートされた細菌ゲノムテンプレートを用いて再度解析を行うとともに、別の既報にある解析アルゴリズムを用いて再解析をすることで新たな知見が得られないか確認する。これらにより、精度の高いデータ抽出を行うとともに、複雑で理解しにくい腸内細菌叢データを、より視覚的に理解しやすいように作図をする。D-アロースについては、希少糖専門家からの意見により、他の希少糖と代謝に関わる経路が異なるために、より腸内細菌叢の変動に寄与しやすいだろうとの指摘があり、これに基づき細菌叢の再評価と短鎖脂肪酸またはメタボローム解析等によるより広範な代謝産物解析を予定する。

Causes of Carryover

既に得られた次世代シーケンサによるデータの再解析において追加で必要となった経費額が小さく、このため予定額よりも支出が減り次年度使用額が生じている。