2023 Fiscal Year Research-status Report
Novel roles of DNA methylation in stress response mediated by nuclear receptor AhR
| Project/Area Number |
22K06728
|
|---|
| Research Institution | Iwate Medical University |
|---|
Principal Investigator |
幅野 渉 岩手医科大学, 薬学部, 教授 (50332979)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
|
| Keywords | 核内受容体 / DNAメチル化 / ストレス応答 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
細胞が環境変化のストレスにさらされたとき、核内受容体aryl hydrocarbon receptor（AhR）はストレスをリガンドとして感知するセンサーと、必要な応答を誘導する転写因子の2役を担う。前研究課題では、AhRが転写因子として非メチル化状態の標的遺伝子（CYP1B1）に選択的に結合することを証明してきた。そこで本研究課題では、細胞がDNAメチル化修飾を利用してAhRを介したストレス応答を変動させる可能性を探索する。
研究期間の開始となる令和4年度は、5-aza-2’-deoxycytidine（DAC）の処理でDNA脱メチル化を誘導したヒト肝臓がんHepG2およびHuH7細胞において、AhRのリガンド（β-naphthoflavone、βNF）の曝露によりCYP2あるいはCYP3遺伝子の発現誘導が起こるのかを検証した。これらのCYP遺伝子はCYP1遺伝子とは異なり、βNFの曝露によりAhRを介した発現の誘導は起こらないことが知られている。その結果、AhRの標的XRE配列を完全に非メチル化の状態とした場合でも、発現の誘導が検出されることはなかった。これより、AhRを介した遺伝子発現誘導はXRE配列を有するだけでは起こらず、よりダイナミックなクロマチンレベルの制御機構が関わる可能性が示唆された。
令和5年度は、4種の大腸がん細胞（LoVo、LS180、DLD-1、HCT116）に、βNF、DACまたはDACとβNFの併用の各薬剤処理を行い、各細胞からRNAを抽出した。これらのRNAを対象に遺伝子発現の網羅解析を行った（Rhelixa社による受託解析）。このデータをもとに、βNF による遺伝子発現誘導がDAC曝露（DNA脱メチル化）によって増強される複数種類の遺伝子を抽出した。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
4種の大腸がん細胞を対象に、AhRを介した発現の応答性がDNAメチル化状態により変動する複数の遺伝子の候補を見出すことができた。次年度は各遺伝子について詳細な検証を行う。当初の研究計画よりも少し遅れているが、着実に進展している。
|
| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度に選出した候補遺伝子について、定量的PCRを用いて正確な発現量の変動を確認する。さらに各遺伝子において標的XRE配列を検索し、その周辺配列のメチル化解析を行う。両者の結果をすり合わせることで、DNAメチル化状態によってAhRによる応答性が制御される遺伝子を同定する。同定された遺伝子の生物学的機能を考慮することで、ストレス応答への意義を模索する。
|
| Causes of Carryover |
次年度に遺伝子発現網羅解析データをさらに詳細に解析するために必要な新規パソコンの購入を予定しており、本年度は少しでも支出を抑える必要があった。
|
