菌血症の原因菌の迅速感受性検査のための細菌由来RNAの高感度解析法の構築

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 22K06739
• Research Institution: Gunma University
• Principal Investigator: 八島 秀明 群馬大学, 大学院医学系研究科, 助教 (60773512)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: 抗菌薬 / RNA / 効果判定

Outline of Annual Research Achievements

近年、多剤耐性菌が原因となる感染症が増加しており、治療ガイドラインなどで推奨されている標準的な治療を行っても臨床効果が得られない症例が増加してきている。特に多剤耐性緑膿菌、カルバペネム耐性腸内細菌科細菌による感染症は近年増加傾向にあり、早期に検出ができれば治療成績の向上が見込める。現在、臨床現場で用いられている病原菌の抗菌薬への感受性検査は細菌培養に依存しており、結果が得られるのに2～3日程度の時間がかかることや、培養ができない場合は全く情報が得られないことが問題である。本研究では緑膿菌、大腸菌、クレブシエラ菌を対象菌種として、細菌由来の核酸のうち生体内での安定性が低いRNAをマーカーとして利用し、細菌培養を行わずに迅速な感染症の原因菌の感受性検査法を確立することが目的である。
2023年度はin vitro実験により、各種抗生物質を緑膿菌に対して曝露した際の、生菌数の変化と細菌から抽出したRNAの関係性を解析した。マーカーとして候補となるに対して定量PCR（プローブ法）での測定系を構築した。このマーカーを用いて、抗菌薬感受性株である緑膿菌PAO-1に対するメロペネムへの感受性判定法の検討を行った。緑膿菌のMICブレイクポイントであるメロペネム16μg/mLでの培養条件において、2時間培養後に非曝露時と明らかな差がみられた。今後はその他の抗菌薬も含めてより多くの種類の緑膿菌において判定が可能か、菌種数を増やして検討していく。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

コロナ禍での研究活動の制限や研究の消耗品の品薄（コロナ禍の間接的な影響）

Strategy for Future Research Activity

感受性判定基準の確からしさを確かめる目的で、より多くの感受性の違う緑膿菌にてRNAのプロファイルを取得していく。そのデータをもとに判定基準を決定する。

Causes of Carryover

コロナ禍による研究活動の制限により検討が遅れているため。