2023 Fiscal Year Research-status Report
分岐解析によるヒト心筋細胞モデルデータベース構築と心臓自動能発生機序の統合的解明
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22K06850
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| Research Institution | Kanazawa Medical University |
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Principal Investigator |
倉田 康孝 金沢医科大学, 医学部, 教授 (00267725)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
津元 国親 金沢医科大学, 医学部, 准教授 (70353331)
九田 裕一 金沢医科大学, 医学部, 講師 (50566916)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | システム生理学 / 非線形力学 / 分岐解析 / 数理モデル / シミュレーション |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、心臓生理学者のためのヒト固有心筋および特殊心筋細胞の新たなモデルデータベースを作成し、ヒト心筋細胞における分岐現象の解析システムを構築して、非線形システムの分岐理論に基づく心臓自動能の起源・発生機序の数理生理学的研究やヒト心臓モデル構築のための理論的基盤を確立することである。
2023年度は、2022年度に作成したヒト心房筋・心室筋細胞および洞房結節細胞モデルのデータベースを基に、ヒト幹細胞由来心筋細胞等から得られた最新の電気生理学的実験データから各モデル細胞の実験データ再現性を再検証し、ヒト心房筋・心室筋細胞および洞房結節細胞の標準モデルを改良するとともに、新たにヒト心臓Purkinje線維細胞モデルのモデルデータベースへの組み込みを試み、科学技術計算ソフトウェアMATLAB（MathWorks Inc., USA）のプログラミングモジュールとしてデータベース化することができた。さらに、MATLABおよび分岐追跡ソフトウェアMATCONTを用い、ヒト心室筋・心房筋および洞房結節細胞モデルとともに、ヒトPurkinje線維細胞における自動能の発生機序を解析するための分岐現象解析システムを構築し、データベース化した各モデルのMATLABプログラム（スクリプトファイル）に実装することができた。Purkinje線維細胞モデルは実験で得られた実細胞の自発性活動電位やQT延長症候群における早期後脱分極などの異常自動能をよく再現し、特殊心筋における自動能の発生機序や不整脈発生機序の解析に適していることが証明された。また、これらの細胞モデルの分岐解析により、洞房結節細胞とPurkinje線維細胞（および病的心房・心室筋）では自動能発生の非線形力学的機序（分岐パターン）に本質的な違いがあることを明らかにした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
2022年度に引き続き、各心筋細胞（洞房結節、心房・心室筋、Purkinje線維細胞）のモデルを構築し、自動能発現の非線形力学的機序を統合的に解明するために、モデル細胞の分岐構造（非線形システムの分岐現象）を精密に解析している。11個の細胞モデルの分岐構造を解析・検証しているが、複雑な高次元非線形システムの分岐構造解析は通常のシミュレーションに比べてはるかに時間がかかる上に、Purkinje線維細胞モデルの追加によりモデル数が増加したため、現有のワークステーションでは当初の予定通りの計算が進まず、分岐解析データの生成が予定よりやや遅れている状況である。
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| Strategy for Future Research Activity |
メモリ（RAM）のさらなる増設などでワークステーションのスペック向上（性能アップ）を図り、計算を高速化することで、分岐解析・シミュレーション解析をより効率的に進める必要がある。また、今後はGPU増設とGPU対応ソフトウェア（MATLAB Parallel Computing Toolbox）の導入による計算の高速化、あるいはワークステーションの追加購入も検討している。
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| Causes of Carryover |
分岐解析データの生成・収集がやや遅れているため予定していた解析データ保存用ハードウェアの一部の購入を次年度（2024年度）に先送りしたこと、第１論文（ヒト洞房結節細胞における自動能発生機序）の作成が遅れているため予定していた論文（オープンアクセス）掲載料を次年度に持ち越したこと、により約48万円の差額が生じた。この差額分（残金）は次年度におけるワークステーションのスペック向上（または追加購入）と分岐解析データ保存用ハードディスク購入、論文投稿・掲載料に充てる予定である。
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