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2022 Fiscal Year Research-status Report

次世代プロテオミクスが紐解く個別化医療に有用なPF-ILDの新規BM開発

Research Project

Project/Area Number 22K08283
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

武田 吉人  大阪大学, 大学院医学系研究科, 准教授 (40452388)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsエクソソーム / マルチオミクス / バイオマーカー / PRISM / AI / システムバイオロジー / バイオインフォマティクス
Outline of Annual Research Achievements

特発性肺線維症(Idiopathic Pulmonary Fibrosis:IPF)は、遺伝的素因に加齢・環境・喫煙などの外的要因が慢性的に加わることで発症する複雑多様な難病である。近年、進行性線維化を伴う間質性肺疾患(progressive fibrosing interstitial lung disease:PF-ILD)におけるニンテダニブの有効性が示されため、診断・治療・新薬開発ストラテジーのパラダイムシフトとして特異性の高いバイオマーカー(BM)開発と更なる病態解明が急務とされる。
種々の細胞が分泌するエンドソーム由来の細胞外小胞(エクソソーム)は、新たな細胞間・臓器間のコミュニケーション手段として注目されている。申請者は、独自に作成のマウスモデルやCOPD患者のエクソソームについて次世代プロテオミクスを駆使したアプローチから、病態や診断に有用な新規BMを同定してきた。さらに、官民研究開発投資拡大プログラム(PRISM)により大阪大学におけるPF-ILDを含む600例のカルテ情報だけでなく、エクソソームの最新プロテオミクスによる国内最大のデータベースを取得した。本研究目的は、PRISMデータを活用し、血中エクソソームの次世代プロテオミクスによる疾患特異的BMを探索することにより、抗線維化薬の対象となるIPFとPF-ILDにおいて個別化医療を目指した診断・病態解明・治療に役立てることである。本事業からPPFの新規BMの同定に成功するだけでなく、新規BM分子について、新規線維化機序解明に至った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本事業からPPFの新規BMの同定に成功するだけでなく、新規BM分子について、新規線維化機序解明に至った。概ね順調な進展である。

Strategy for Future Research Activity

新規BMの実用化を目指すとともに、病態解明のためのKOマウス作成と治療応用を目指す。

Causes of Carryover

次年度使用額が生じた理由は、今年度に大量の解析予定のため、未使用にて持ち越した。次年度に、オミクス解析に供する予定である。

  • Research Products

    (10 results)

All 2023 2022

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 7 results)

  • [Journal Article] A sex-biased imbalance between Tfr, Tph, and atypical B cells determines antibody responses in COVID-19 patients2023

    • Author(s)
      S?ndergaard Jonas N?rskov、Tulyeu Janyerkye、Edahiro Ryuya、Shirai Yuya、Yamaguchi Yuta、Murakami Teruaki、Morita Takayoshi、Kato Yasuhiro、Hirata Haruhiko、Takeda Yoshito、Okuzaki Daisuke、Sakaguchi Shimon、Kumanogoh Atsushi、Okada Yukinori、Wing James Badger
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 120 Pages: e2217902120

    • DOI

      10.1073/pnas.2217902120

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characteristics of hospitalized patients with COVID-19 during the first to fifth waves of infection: a report from the Japan COVID-19 Task Force2022

    • Author(s)
      Lee Ho、Chubachi Shotaro、Namkoong Ho、Miyawaki Satoru、Takahashi Meiko、Matsuda Fumihiko、Omae Yosuke、Tokunaga Katsushi、Ueno Takafumi、The Japan COVID-19 Task Force
    • Journal Title

      BMC Infectious Diseases

      Volume: 22 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s12879-022-07927-w

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Next-generation proteomics of serum extracellular vesicles combined with single-cell RNA sequencing identifies MACROH2A1 associated with refractory COVID-192022

    • Author(s)
      Kawasaki Takahiro、Takeda Yoshito、Edahiro Ryuya、Shiroyama Takayuki、Hirata Haruhiko、Adachi Jun、Okada Yukinori、Kumanogoh Atsushi
    • Journal Title

      Inflammation and Regeneration

      Volume: 42 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s41232-022-00243-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peripheral T cell cytotoxicity predicts the efficacy of anti-PD-1 therapy for advanced non-small cell lung cancer patients2022

    • Author(s)
      Iwahori Kota、Uenami Takeshi、Yano Yukihiro、Ueda Toshihiko、Tone Mari、Naito Yujiro、Suga Yasuhiko、Fukushima Kiyoharu、Shiroyama Takayuki、Miyake Kotaro、Koyama Shohei、Hirata Haruhiko、Nagatomo Izumi、Kida Hiroshi、Mori Masahide、Takeda Yoshito、Kumanogoh Atsushi、Wada Hisashi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-022-22356-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force2022

    • Author(s)
      Wang Qingbo S.、Edahiro Ryuya、Namkoong Ho、Kanai Takanori、Fukunaga Koichi、Okada Yukinori
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32276-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-192022

    • Author(s)
      Namkoong Ho、Edahiro Ryuya、Takano Tomomi、Imoto Seiya、Miyano Satoru、Ogawa Seishi、Kanai Takanori、Fukunaga Koichi、Okada Yukinori、The Biobank Japan Project
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 609 Pages: 754~760

    • DOI

      10.1038/s41586-022-05163-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of the Treatment Line on the Risks and Benefits of Immune Checkpoint Inhibitors in Patients With Non-Small Cell Lung Cancer and Interstitial Lung Disease2022

    • Author(s)
      Matsumoto Kinnosuke、Shiroyama Takayuki、Yamamoto Yuji、Miyake Kotaro、Takeda Yoshito、Kumanogoh Atsushi
    • Journal Title

      Chest

      Volume: 162 Pages: e67~e69

    • DOI

      10.1016/j.chest.2022.02.053

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Longitudinal alterations of the gut mycobiota and microbiota on COVID-19 severity2022

    • Author(s)
      Maeda Yuichi、Motooka Daisuke、Kawasaki Takahiro、Oki Hiroya、Noda Yoshimi、Adachi Yuichi、Niitsu Takayuki、Okamoto Shota、Tanaka Kentaro、Fukushima Kiyoharu、Amiya Saori、Hara Reina、Oguro-Igashira Eri、Matsuki Takanori、Hirata Haruhiko、Takeda Yoshito、Kida Hiroshi、Kumanogoh Atsushi、Nakamura Shota、Takeda Kiyoshi
    • Journal Title

      BMC Infectious Diseases

      Volume: 22 Pages: 572

    • DOI

      10.1186/s12879-022-07358-7

  • [Journal Article] Identification of CD14 and lipopolysaccharide-binding protein as novel biomarkers for sarcoidosis using proteomics of serum extracellular vesicles2022

    • Author(s)
      Futami Yu、Takeda Yoshito、Koba Taro、-Adachi Jun、Tomonaga Takeshi、Ueda Koji、Kumanogoh Atsushi
    • Journal Title

      International Immunology

      Volume: 34 Pages: 327~340

    • DOI

      10.1093/intimm/dxac009

  • [Journal Article] Bronchoalveolar lavage fluid reveals factors contributing to the efficacy of PD-1 blockade in lung cancer2022

    • Author(s)
      Masuhiro Kentaro、-Morita Takayoshi、Imoto Seiya、Uematsu Satoshi、Irie Takuma、Okuzaki Daisuke、Aoshi Taiki、Takeda Yoshito、Kumagai Toru、Hirashima Tomonori、Kumanogoh Atsushi
    • Journal Title

      JCI Insight

      Volume: 7 Pages: e157915

    • DOI

      10.1172/jci.insight.157915

URL: 

Published: 2023-12-25  

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