2022 Fiscal Year Research-status Report
形質細胞シングルセルRNAシークエンスによるALアミロイドーシス網羅的遺伝子解析
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22K08447
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
竹田 勇輔 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (60772746)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
堺田 惠美子 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (60422218)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | ALアミロイドーシス / シングルセル解析 / 網羅的遺伝子解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
同じく骨髄腫類縁疾患であり、骨髄中の腫瘍細胞割合が少ないPOEMS症候群を対象とした、当教室の先行研究のシングルセル解析の手法を用い、ALアミロイドーシス患者の骨髄形質細胞解析に向けて準備を進めている。
POEMS症候群におけるシングルセル解析の報告については、昨年申請の時点では論文投稿中であったが、正式にacceptされた（JCI Insight. 2022 Oct 24;7(20):e151482.）。当該手法の先進性、および希少かつ難治性疾患であるPOEMS症候群の解析を行ったことが高く評価されたものであり、本研究のALアミロイドーシスの解析においても同様に重視される点であると考える。
ALアミロイドーシス患者は希少疾患であるため、検体のリクルートを行えるかどうかが非常に重要である。これについては、県内関連病院の当該症例ピックアップを進め、データベースを作成している。遺伝子の網羅的な解析においては、倫理的な面からも十分な配慮が必要であり、一部改訂された「人を対象とする生命科学・医学系研究に関する倫理指針」に準拠する形で改めて説明同意書の整備を行い、完了している。ALアミロイドーシスの患者検体は千葉大学医学部附属病院血液内科において、順調に検体数は収集されている。保存検体については、先行の共同研究より日本赤十字医療センター骨髄腫アミロイドーシスセンターから多数の検体の受け入れをすでに行っている。
並行して、ALアミロイドーシス患者検体におけるシングルセル解析条件の検定を進めており、最適な解析条件について設定を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
新型コロナ流行のため、昨年度は入院患者の受け入れに制限をかけざるを得ず、当初の見込みより新規症例の集積が遅れていると考えられる。また、シングルセル解析の条件検定などに想定より時間を要しており、進行はやや遅れていると判断している。
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| Strategy for Future Research Activity |
今年度については、シングルセル解析を本格的に開始し、ALアミロイドーシス、多発性骨髄腫、MGUSの各症例から、単一形質細胞レベルで複数の遺伝子ライブラリーを作成し、RNAシークエンス解析を行う予定である。
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