HIV感染者と健常者におけるCOVID-19ワクチンの免疫プロファイリングの解析

2023 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 22K08608
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 斎田 瑞恵 順天堂大学, 医学部, 准教授 (00626351)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 内藤 俊夫 順天堂大学, 医学部, 教授 (10365570) ; 田部 陽子 順天堂大学, 大学院医学研究科, 教授 (70306968)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Keywords: Single cell / 免疫細胞 / HIV感染者

Outline of Annual Research Achievements

昨年度実施した「Single cell RNA-seq解析と血球表面マーカー解析及びサイトカインパネル解析を実施し、先行研究で得られた結果より単球系細胞の役割に注目しつつ、特定の免疫細胞の活性化をシングルセルレベルで明らかにし、これらの変化に関与する細胞シグナル経路や免疫細胞間の相互作用を解明するための解析」で採取した末梢血単核細胞の中から、臨床背景や治療経過によって接種ワクチン毎に2症例を選定し、scRNA-seq, レパトア解析を実施する。シングルセルレベルで免疫細胞クラスター の増減を検出し、昨年度の解析で得られたサイトカイン産生およびリンパ球サブセットデータを検証し、重症化に至る際に活性化されるシグナル経路（TNF-α, JAK-STAT経路等）についても併せて検討した。
HIV感染者とHIV非感染者の免疫細胞クラスターを特定し、併せてリンパ球サブセットデータを解析しており、現段階でわずかな違いではあるが一定の解析結果を得ている。現在、単球系細胞に着目し、活性化をシングルセルレベルでさらなる解析を進めており、scRNA-seq, レパトア解析も並行して解析している。
さらには、中和活性測定の追加を予定しており、細胞シグナル経路や免疫細胞間の相互作用のさらなる解析を検討している。臨床的症状と血液検査、サイトカインパネル解析、シングルセルレベルの解析に至るまで、一連の流れについて、解析を明瞭化し、評価する。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

シングルセルレベルで免疫細胞クラスター の増減を検出し、昨年度の解析で得られたサイトカイン産生およびリンパ球サブセットデータを検証する予定でしたが、データの検証に時間を要してしまい、思うように進められなかった。また、重症化に至る際に活性化されるシグナル経路（TNF-α, JAK-STAT経路等）を併せて検討したが、不十分な検討になっている。

Strategy for Future Research Activity

今年度に続いて「重症化に至る際に活性化されるシグナル経路（TNF-α, JAK-STAT経路等）の検討を十分に行う。
HIV感染者15名、健常人15名における、3回目のワクチン接種の前後において、COVIDワクチン抗体価の測定およびサイトカインとの連動について評価も継続して実施していく。
HIV感染者と健常人におけるわずかな違いが認められるも、データ解析に時間を要していたが、中和活性の測定を追加することにより一定の見解を得られる可能性があり、さらなる解析を行う。

Causes of Carryover

今年度解析に手間取り滞った重症化に至る際に活性化されるシグナル経路（TNF-α, JAK-STAT経路等）検討後の解析のための費用および、研究成果発表のための学会発表旅費に使用予定

Research Products

• [Journal Article] Testing Preferences During the COVID-19 Pandemic in Japan: Infodemiology Study (2024)
  • Author(s): Kanamori R, Umemura F, Uemura K, Miyagami T, Valenti S, Fukui N, Yuda M, Saita M, Mori H, Naito T.
  • Journal Title: JMIR Form Res . Volume: 8 Pages: e52306
  • DOI: 10.2196/52306
• [Journal Article] Risk factors for progressing to severe COVID-19 among people living with HIV in Japan: A hospital claims database study (2024)
  • Author(s): Kanazawa A, Yan Y, Yuda M, Fukui N, Saita M, Mori H, Naito T.
  • Journal Title: J Infect Chemother . Volume: 30 Pages: 40-47
  • DOI: 10.1016/j.jiac.2023.09.009
• [Journal Article] Investigation of the individual genetic evolution of SARS-CoV-2 in a small cluster during the rapid spread of the BF.5 lineage in Tokyo, Japan (2023)
  • Author(s): Jin B, Oyama R, Tabe Y, Tsuchiya K, Hando T, Wakita M, Yan Y, Saita M, Takei S, Horiuchi Y, Miida T, Naito T, Takahashi K, Ogawa H. Front Microbiol. 2023 Sep
  • Journal Title: Front Microbiol Volume: 14 Pages: -
  • DOI: 10.3389/fmicb.2023.1229234
• [Journal Article] Online search interest in long-term symptoms of coronavirus disease 2019 during the COVID-19 pandemic in Japan: Infodemiology study using the most visited search engine in Japan (2023)
  • Author(s): Ishizuka K, Miyagami T, Tsuchida T, Saita M, Ohira Y, Naito T.
  • Journal Title: PLoS One Volume: 18 Pages: e0294261
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0294261
• [Journal Article] A Predictive Rule for COVID-19 Pneumonia Among COVID-19 Patients: A Classification and Regression Tree (CART) Analysis Model (2023)
  • Author(s): Fukui S, Inui A, Komatsu T, Ogura K, Ozaki Y, Sugita M, Saita M, Kobayashi D, Naito T.
  • Journal Title: Cureus Volume: 15 Pages: -
  • DOI: 10.7759/cureus.45199