2022 Fiscal Year Research-status Report

Elucidation of the mechanism of disease progression of cervical atypical epithelium and search for new markers by single cell analysis

Research Project

Project/Area Number	22K09547
Research Institution	Osaka University
Principal Investigator	木村敏啓大阪大学, 大学院医学系研究科, 講師 (90584524)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	上田豊大阪大学, 大学院医学系研究科, 講師 (10346215) 平松宏祐大阪大学, 医学部附属病院, 助教 (10650591) 中川慧大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (30650593) 角田守大阪大学, 医学部附属病院, 助教 (30923031) 小林栄仁大阪大学, 大学院医学系研究科, 講師 (50614773) 三好愛大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (50880712)
Project Period (FY)	2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords	gynecology / cervical intraneoplasia / single-cell analysis / HPV
Outline of Annual Research Achievements	子宮頸癌は正常子宮頸部上皮にヒトパピローマウイルス（HPV）が感染し、その持続感染により子宮頸部異型上皮（CIN）を経て子宮頸癌へと進行することはこれまでの研究により明らかにされている。その癌化、病性進行の過程における細胞レベルでの変化は明らかではない。本研究では次世代シークエンサーを用いて子宮頸部組織のシングルセルmRNA シークエンス解析を実施し、癌化および病勢進行に関する細胞内でのメカニズムの解明を行うことを目的に研究を進めている。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason 本年度はサンプルからシングルセルｍRNAシークエンスのライブラリ作成の技術的な安定のため生検組織の分離精製を複数回行い、手技を確立した。そのうえで3症例についてサンプルを採取しシングルセルｍRNAシークエンスを行った。子宮頸部異型上皮とHPVとの関連について現在データ解析を複数の統計解析手技にて行っている。HPV感染の子宮頸部異型上皮の患者が予想より少なく今のところ3例であるがさらに数症例の追加を考えている。これらは現在の解析と同時進行で進めていく。
Strategy for Future Research Activity	シングルセルmRNAシークエンスの手法については確立できており、サンプル処理の条件は問題ないと考えている。現在複数の解析手法を用いて検討しているが、さらに追加の解析手段を用いていく予定である。重ねてサンプル採取も進めており、さらに数症例の積み重ねを検討している。本年度は対象となる患者が予想より少なかったが、必要な総数はそれほど多くないため、本院の外来の範囲での採取を継続の方針である。
Causes of Carryover	引き続き解析を行う予定であるため、少額の残高は使い切らず繰り越しとした。