Dynamic β-Maxentによる生物多様性予測とそのアプリケーション実装

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 22K11938
• Research Institution: Seikei University
• Principal Investigator: 小森 理 成蹊大学, 理工学部, 准教授 (60586379)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 江口 真透 統計数理研究所, 医療健康データ科学研究センター, 特任教授 (10168776) ; 久保田 康裕 琉球大学, 理学部, 教授 (50295234)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2027-03-31
• Keywords: 生物多様性解析 / Maxent

Outline of Annual Research Achievements

時系列データを考慮したDynamic Maxentの開発のための基盤アルゴリズムの開発を行った．具体的にはMaxentで問題となる計算時間の短縮と，バックグラウンドデータの環境変数に対するノイズにロバストな推定手法を，Poisson point processの強度関数の幾何平均に基づくdivergenceから導出し，統計解析ソフトRで実装した．また生物多様性解析の網羅的なサーベイを行うとともに，最近の動向をJJSDの国際雑誌の特集号でまとめた．また今後の生物多様性解析の展望論文の執筆も行った．またDynamic Maxentの開発においては，University of Central FloridaのHuang教授と直接議論し，Gaussian processを使う基本的なアイディアを得た．

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Dynamic Maxentの基盤アルゴリズムの改良と，Maxentに関する論文の執筆を行うことができ，またHuang教授との議論で，大まかなアルゴリズムの指針が定まったため．

Strategy for Future Research Activity

Dynamic Maxentの時系列的な枠組みを構築したい．具体的にはGaussian Processで使われる時空間的なカーネルを用い，時系列の情報を考慮したアルゴリズムの開発を行う．実際には上記のHuang教授との議論を継続し，推定アルゴリズムの骨格を構築したい．またそのアルゴリズムを統計解析ソフトRを使い実装をしたい．

Causes of Carryover

生物多様性ビックデータの整備と解析用に，当初大型計算機の購入を予定していたが，初年度はアルゴリズムの開発を中心に研究を進めたため．繰越金はデータの整備・解析のために使用予定．