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2022 Fiscal Year Research-status Report

Active matter physics on pattern formation and its function of cytoskeleton and cells

Research Project

Project/Area Number 22K14017
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

多羅間 充輔  九州大学, 理学研究院, 助教 (90756834)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Keywordsアクティブマター / 細胞骨格 / 細胞運動 / 自己組織化 / 協同現象 / フォースフリー
Outline of Annual Research Achievements

アクティブマターはその運動能ゆえにさまざまなパターンを形成し、その自己組織化構造は高次機能の発現プラットフォームとなる。アクティブマターの具体例は、多くの場合精確な制御が可能となる非平衡条件下に置かれたコロイド粒子や液滴などを用いて実現した物理的、化学的、または工学的な人工系の他に、制御の点では劣るものの神秘的であり多くの研究者を魅了してやまない数多の生命現象に見出される。自己組織化構造の機能発現は生命現象において重要な役割を担う。ミクロな生体分子である細胞骨格は細胞スケールの高次構造を自己組織化し、力学機能を発現する。 また、細胞は、自身を構成するこれらの細胞骨格構造の力学機能を制御することで、マクロな運動を実現する。さらに、細胞間で運動や細胞骨格構造が協調し、より大きなスケールの生体組織の発生が正確に行われるなど、複雑な生命機能が発現する。 本研究では、特に次のふたつのアプローチにより、アクティブマター物理学の視点から、生命現象の背後に潜む普遍原理と、細胞骨格ー細胞ー生体組織のスケールを縦断する生体ダイナミクスの階層構造を探求する。本年度は各の項目について、それぞれこれまでの研究成果を論文にまとめ、学術雑誌に発表することができた。項目1:細胞骨格が自己組織化する高次構造の形成原理とその力学機能発現メカニズムを解明する。項目2:細胞が互いと相互作用しながら集団で運動するときに形成する動的構造の発現原理を、細胞の力学モデルを発展させて明らかにする。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、次の2つの研究について研究成果をまとめ、論文として学術雑誌に発表することができた。一つは、ミオシンモーターに起動されたアクチン細胞骨格の細胞膜付近への集積とその力生成に関する研究についてである。もう一つの研究では、基盤上の細胞の運動を、フォースフリー(力の総和がゼロ)の条件を満たす細胞の力学モデルと細胞内部の生化学反応が自己組織化する濃度分布の伝搬波とを結合することにより実現し、細胞が運動するときに基盤に与える牽引力の分布について実験結果を再現することに成功した。
これらの他に、以下の研究を進めることができた。①細胞骨格の自己組織化:実験で観測されたアクチン細胞骨格が形成するナノメートルスケールの構造について理論モデルを用いてその自己組織化原理と構造転移について研究を進めた。②細胞集団の協同運動:細胞集団が集団で運動するときに形成する構造について理論モデルにより構造を再現し、その自己組織化メカニズムについての解析を行った。

Strategy for Future Research Activity

今後は以下の方針で研究を進める計画である。
研究項目1:細胞骨格が自己組織化する構造の形成過程についてさらに研究を進め、動的高次構造がどのように実現するのかをメソスケールモデルを用いて解析する。
研究項目2:細胞集団が協調して運動するときの、各々の細胞の運動サイクルに着目して、内部構造と集団運動とがどのように連携して動的秩序構造が自己組織化するのかを解析する。

Causes of Carryover

今年度は研究代表者の異動などがあったため、当初計画していた計算機の購入の手続きができなかった。次年度早々に計算機の購入を進め、研究をより一層に推進する計画をしている。

  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Pattern formation and the mechanics of a motor-driven filamentous system confined by rigid membranes2022

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama、Shibata Tatsuo
    • Journal Title

      Physical Review Research

      Volume: 4 Pages: 043071

    • DOI

      10.1103/PhysRevResearch.4.043071

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mechanochemical subcellular-element model of crawling cells2022

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama, Kenji Mori, Ryoishi Yamamoto
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 10 Pages: 1046053

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.1046053

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Dynamic network structure formation of mesoderm cells in early chick embryo2023

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      アクティブマター研究会2023
  • [Presentation] Phase separation and self-organized structures of actin cytoskeleton2022

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      25th Anniversary Symposium of German-Japanese Joint Research Project on Nonequilibrium Statistical Physics Perspectives for Future Collaboration
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 並行平板間の自己推進変形粒子の集団運動2022

    • Author(s)
      多羅間充輔
    • Organizer
      日本物理学会2022年秋季大会
  • [Presentation] Microphase separation and transition dynamics of self-organized structures of actin cytoskeleton during tubulogenesis2022

    • Author(s)
      Mitsusuke Tarama
    • Organizer
      第60回 日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Coarse-grained molecular dynamics approach to phase separation of actin cytoskeleton2022

    • Author(s)
      多羅間充輔
    • Organizer
      第3回生体分子シミュレーション・モデリング研究会
  • [Presentation] 細胞膜と相互作用するアクチン骨格の枯渇相と集積相2022

    • Author(s)
      多羅間充輔
    • Organizer
      第11回分子モーター討論会
    • Invited
  • [Presentation] アクチン細胞骨格のミクロ相分離と構造転移2022

    • Author(s)
      多羅間充輔
    • Organizer
      第10回ソフトマター研究会

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Published: 2023-12-25  

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