• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2024 Fiscal Year Annual Research Report

ネコモルビリウイルスの持続感染に不完全ウイルスRNAが果たす役割の解明

Research Project

Project/Area Number 22K14999
Research InstitutionOsaka Medical and Pharmaceutical University

Principal Investigator

坂口 翔一  大阪医科薬科大学, 医学部, 助教 (20815279)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywordsネコモルビリウイルス / 不完全ゲノム / RNA依存性RNAポリメラーゼ
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ネコモルビリウイルス(FeMV)の慢性感染を制御する要因として、不完全ウイルスRNA(DVG)の生成機構とウイルス増殖抑制機構を解明することを目的とした。
前年度までに、FLDS法によるdsRNA選択的シークエンスにより、DVG出現座位を解析していた。今年度は通常のRNA-seqも実施して両データを統合し、DVGレパートリーを網羅的に解析した。その結果、各DVGの産生割合を高精度に定量でき、特にH遺伝子中盤にジャンクションをもち、トレーラー配列から約500塩基に接続するcopy-back型DVGが総DVGの約10%を占めることを確認した。他にも、L遺伝子途中にジャンクションをもち、トレーラー配列に接続するDVGが3種みられた。またM遺伝子またはP遺伝子内にジャンクションをもつDVGもみられた。最も割合の高かったDVGを、OE-PCR法によってクローニングし、T7プロモーターを付加した。さらに、網羅的に収集したRNA依存性RNAポリメラーゼ(RdRp)配列のクラスタリングとモチーフ解析結果を、再クラスタリングすることで、RdRpの主要モチーフ以外の保存領域を推測できることがわかった。
今後、in vitro転写を実施し、生成された人工合成DVGについて、FeMV持続感染CRFK細胞またはVero細胞に共導入し、TCID50法により測定するウイルス力価の変動や、インターフェロンの発現変化を調べる予定である。さらに、パラミクソウイルスRdRpに共通する保存領域について、人為的変異を加えた解析を行うことにより、DVG産生とポリメラーゼの関係を調べることができる。
本成果はFeMVのみならずモルビリウイルス持続感染機構の普遍的理解やDVGベースの抗ウイルス戦略、パラミクソウイルス治療標的の創出につながると考えている。

  • Research Products

    (5 results)

All 2024

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] NeoRdRp2 with improved seed data, annotations, and scoring2024

    • Author(s)
      Sakaguchi Shoichi、Nakano Takashi、Nakagawa So
    • Journal Title

      Frontiers in Virology

      Volume: 4 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fviro.2024.1378695

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Exploring the hidden world of RNA viruses with a transformer-based tool2024

    • Author(s)
      Nakagawa So、Sakaguchi Shoichi
    • Journal Title

      Patterns

      Volume: 5 Pages: 101095~101095

    • DOI

      10.1016/j.patter.2024.101095

    • Open Access
  • [Presentation] 包括的RNAウイルス検出のためのHMMデータセット「NeoRdRp2」を用いたメタトランスクリプトームデータ解析2024

    • Author(s)
      坂口翔一、中川草、中野隆史
    • Organizer
      第167回 日本獣医学会学術集会
  • [Presentation] RNA Virome analyses of metatranscriptome data using NeoRdRp2024

    • Author(s)
      Shoichi Sakaguchi
    • Organizer
      International Virus Bioinformatics Meeting 2024
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of diversified RNA viruses from various environments using NeoRdRp2024

    • Author(s)
      Shoichi Sakaguchi, So Nakagawa, Takashi Nakano
    • Organizer
      第26回日本進化学会神奈川大会

URL: 

Published: 2025-12-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi