• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Research-status Report

細胞レベルで見る巨大ウイルス感染現象の多様性

Research Project

Project/Area Number 22K15175
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

疋田 弘之  京都大学, 化学研究所, 助教 (40913926)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords巨大ウイルス / ウイルス間相互作用 / トランスクリプトーム解析 / ロングリードシークエンス
Outline of Annual Research Achievements

2003年に報告された巨大ウイルスは細菌に匹敵する大きさのゲノムと粒子を持ち、ウイルスは微小な存在であるという考え方が支配的だった生物学に大きな衝撃を与えた。以降、多数の巨大ウイルスが様々な環境から単離され、ウイルス粒子の構造やゲノム構成が実に多様であることが明らかになった。一方、巨大ウイルスが感染細胞内で示す挙動に関する理解は大きく遅れている。そこで、本研究では様々な巨大ウイルスを用いて、細胞レベルでの感染現象を解析し、その多様性を明らかにするとともに、ウイルス間相互作用にまで踏み込むことを目指している。本年度は昨年度構築した新規ウイルスの単離、およびそれらのゲノムレベルでの多様性解析を効率的に行うためのパイプラインとその有用性に関する論文を完成させ、発表した。また、昨年度に引き続き、ウイルスの感染進行、および相互作用に関してモニターする系を用いて新規データを得たほか、経時トランスクリプトームデータの解析を進め、各ウイルスが持つ感染戦略の特徴に関する知見を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画よりも予算の関係で規模は縮小しているものの、予定していたウイルスの感染戦略の特徴、およびウイルス間相互作用に関して、新規の知見を得ており、これらの知見を軸に研究を進めることができると見込まれるため。

Strategy for Future Research Activity

こrまでに得たウイルスの感染戦略の多様性、およびウイルス間相互作用に関する知見を軸に、得られた仮説を補強する実験結果を集めることで、研究の完成を目指す。また、予想外の知見を得られる可能性があるため、新規ウイルスの単離に関しても引き続き行う。

Causes of Carryover

得られたデータに基づいて、年度末に実験スケジュールを変更したため。

  • Research Products

    (5 results)

All 2023

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] A rapid genome‐wide analysis of isolated giant viruses using <scp>MinION</scp> sequencing2023

    • Author(s)
      Hikida Hiroyuki、Okazaki Yusuke、Zhang Ruixuan、Nguyen Thi Tuyen、Ogata Hiroyuki
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 25 Pages: 2621~2635

    • DOI

      10.1111/1462-2920.16476

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Diversity of virocells formed by different giant viruses2023

    • Author(s)
      Hikida H., Mori T., Ogata H.
    • Organizer
      5th Ringberg Symposia on Giant Virus Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 種分化の観点からみたミミウイルス間相互作用の解析2023

    • Author(s)
      疋田弘之, 緒方博之
    • Organizer
      微生物生態学会第36回大会
  • [Presentation] Transcriptomic comparison of giant viruses to explore mechanisms underlying viral gigantism.2023

    • Author(s)
      Hikida H.
    • Organizer
      Confect Symposium 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mixed infection of different mimivirus lineages highlights mechanisms that drive viral speciation2023

    • Author(s)
      Hikida H., Ogata H.
    • Organizer
      Aquatic Virus Workshop 11
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi