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2023 Fiscal Year Research-status Report

細菌タンパク質の分解誘導薬の創製

Research Project

Project/Area Number 22K15242
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

友重 秀介  東北大学, 生命科学研究科, 助教 (50822524)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Keywords標的タンパク質分解 / 細菌 / ミトコンドリア
Outline of Annual Research Achievements

薬剤耐性菌が世界中で脅威となっており、これを克服するための新機軸の抗菌薬が求められている。近年、創薬研究においてPROTACをはじめとするタンパク質分解薬が話題となっている。また、PROTACは耐性変異を獲得したタンパク質に対しても活性を示すという報告からタンパク質分解薬が薬剤耐性菌克服につながると考え、本研究では細菌タンパク質の分解を誘導する化合物の創製を目指している。
昨年度は設計・合成した化合物に標的タンパク質の分解誘導活性を確認できなかったため、本年度はその理由の考察や検証、そして新しい化合物の設計に向けたプロテアーゼリガンドの再設計を行った。文献調査および計算科学的解析から、細菌プロテアーゼのリガンドにまだまだ活性向上の余地があることを見出した。
他方、昨年度見出したミトコンドリア内で機能するタンパク質分解薬の開発について精力的に推進した。結果として、見出した化合物はミトコンドリアマトリックス内に局在させたmSAを分解でき、概念実証に成功した。さらに、ミトコンドリアの断片化にかかわるタンパク質にmSAを融合させたタンパク質をミトコンドリアマトリックス内に局在させ、ミトコンドリアを断片化させる実験系を作成した。この系に分解薬を処理するとミトコンドリアの断片化が回復することを示すことにも成功した。これらの成果は学会発表およびプレプリントとして公開した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

細菌におけるタンパク質分解薬は開発に苦労しているものの、目標達成に向けた新たな指針を発案できている。また、類似コンセプトでミトコンドリアにおけるタンパク質分解薬の開発に成功し、一定の成果として公開した。

Strategy for Future Research Activity

細菌タンパク質プロテアーゼに対するリガンドの最適化を行う。過去の文献情報から、特定のコンフォメーションで相互作用できるような構造へと展開することで活性が向上できると期待している。
ミトコンドリアにおけるタンパク質分解薬については、得られた成果を基にさらなる高度化に向けて構造展開などに取り組む。

Causes of Carryover

細菌で機能する化合物の活性が認めれらなかったことから、計算科学による理由の解析に時間を割いたためその分支払いが発生しなかった。計算結果等から、一定の分子設計指針を得たため、新しい細菌プロテアーゼリガンドの探索合成に繰越金を使用する計画である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Allosteric Hsp70 Modulator YM-1 Induces Degradation of BRD42024

    • Author(s)
      Mishima Yugo、Tomoshige Shusuke、Sato Shinichi、Ishikawa Minoru
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 72 Pages: 161~165

    • DOI

      10.1248/cpb.c23-00543

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeted Protein Degradation in the Mitochondrial Matrix and Its Application to Chemical Control of Mitochondrial Morphology2024

    • Author(s)
      Yamada Wakana、TOMOSHIGE Shusuke、Nakamura Sho、Sato Shinichi、Ishikawa Minoru
    • Journal Title

      ChemRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.26434/chemrxiv-2024-4vrs0

  • [Presentation] ユビキチンリガーゼ CHIP を用いたタンパク質分解キメラ化合物の創製2024

    • Author(s)
      小澤ときは, 友重秀介, 佐藤伸一, 大竹史明, 石川稔
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
  • [Presentation] 標的タンパク質分解誘導化合物PROTAC および周辺技術による新規創薬モダリティ ~基礎から最新の知見、そして産業における動向~2024

    • Author(s)
      友重秀介
    • Organizer
      (株)情報機構セミナー
    • Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア内タンパク質を標的とするタンパク質分解誘導薬の開発2023

    • Author(s)
      山田若菜, 佐藤伸一, 石川稔, 友重秀介
    • Organizer
      第40回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • [Presentation] Lys 選択的凝集アミロイド β 修飾反応の開発2023

    • Author(s)
      田中皓史, 佐藤伸一, 友重秀介, 石川稔
    • Organizer
      第62回日本薬学会東北支部大会
  • [Presentation] 共有結合型ユビキチンリガーゼリガンドの構造展開2023

    • Author(s)
      佐々木怜子, 岡部真琴, 佐藤伸一, 友重秀介, 田中良和, 石川稔
    • Organizer
      第62回日本薬学会東北支部大会
  • [Presentation] Hsp70モジュレーターYM-1はBRD4の分解を誘導する2023

    • Author(s)
      三島祐悟, 友重秀介, 佐藤伸一, 石川稔
    • Organizer
      第62回日本薬学会東北支部大会
  • [Presentation] チロシン残基修飾反応による糖構造導入を基盤としたアミロイドβの凝集抑制・可溶化2023

    • Author(s)
      樋口凛, 中根啓太, 池之上達哉, 佐藤伸一, 友重秀介, 石川稔
    • Organizer
      第17回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] ミトコンドリア内タンパク質を標的とする新規タンパク質分解誘導技術2023

    • Author(s)
      山田若菜, 佐藤伸一, 石川稔, 友重秀介
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第17回年会
  • [Presentation] 共有結合型ユビキチンリガーゼリガンドの創製2023

    • Author(s)
      佐々木怜子, 岡部真琴, 佐藤伸一, 友重秀介, 田中良和, 石川稔
    • Organizer
      第34回万有仙台シンポジウム

URL: 

Published: 2024-12-25  

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