2022 Fiscal Year Research-status Report
AI形態解析とリンパ節転移関連遺伝子解析の統合化による肺扁平上皮癌悪性化機構解明
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22K16581
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Research Institution | Tokyo Medical University |
Principal Investigator |
大森 智一 東京医科大学, 医学部, 助教 (70617646)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | 肺扁平上皮癌 / 人工知能解析 / 再発予測 / miRNA |
Outline of Annual Research Achievements |
肺扁平上皮癌(LUSC)においてリンパ節転移(pN)は予後因子であり術後再発に大きく寄与するところではあるが、術後再発を予測するマーカーは存在しない。我々は、自験内でLUSCのリンパ節転移に特異的なmiRNA(miRNA10a, 141, 3120)を抽出した。また、人工知能(AI)を使った癌細胞核の形態解析にて術後再発を予測できる可能性も確認している。そこで、AIによる形態解析と分子病理学的因子を組み合わせることで、より精度の高い再発予測因子を割り出すことを目的とした。本年度はAIによる形態的解析を行った。自施設内でLUSCに対して手術した患者196例を対象とし、i)術後無再発、ii)術後早期再発 の2群に分け、AI形態解析にて術後再発と無再発の特徴量を抽出した。trainingモデル解析の後、testモデルにてその確からしさを検証した。結果としては、trainingモデルで早期再発(2年以内)/無再発を100%識別し、testモデルで98.1%の確立で再発を予想できた。現在、無再発/再発群の各症例からmiRNA抽出を行っており、その結果と合わせてデータベースを作成し、アノテーション作業を行っていく予定である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
症例集積ならびにAI解析に時間を要したため。
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Strategy for Future Research Activity |
AI形態解析に関して、再発/無再発だけではなく、リンパ節転移の有無やICIの効果予測に関しても解析を行う予定である。また、miRNA抽出を完了させ、さらにカルシトニン受容体遺伝子(CALCR)についても解析を行っていく。 それらの結果からアノテーション作業を行い、LUSCの再発予測マーカーの抽出を行う予定である。
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Causes of Carryover |
今年度はAI形態解析を中心に行い、経費は大きくかからなかったため、次年度使用が生じた。次年度はRNA解析や遺伝子解析を行っていき、さらに学会発表や論文投稿に使用する計画である。
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