2023 Fiscal Year Research-status Report
Biobank studies on the associations between metabolomics and prognoses in patients with diabetes, dyslipidemia, or heart failure
Project/Area Number |
22K17362
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Research Institution | University of Tsukuba |
Principal Investigator |
岩上 将夫 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (30830228)
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Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2025-03-31
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Keywords | メタボローム / 教師無し機械学習 / クラスタリング |
Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、糖尿病・高脂血症・心不全患者におけるメタボローム(各メタボライトおよび複数のメタボライトのパターン)と予後の関連を日英のバイオバンク(BioBank JapanおよびUK Biobank)を用いて検討することを目標としている。 本年度の活動としては、利用申請をしていたUK Biobankから許可がおり、利用費の支払い後、研究に必要な部分の大規模データを当教室のコンピューターにダウンロードし、データのクリーニングを開始した。 約12万人のメタボローム情報に対して、次元圧縮及びクラスタリングの処理を行い、対象者を複数のグループに分類し、死亡を中心とした種々のアウトカムを比較する生存回帰分析の段階に移っている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
BioBank Japanのデータについては、現在も死亡情報の提供待ちとなっており、解析がストップしている。UK Biobankのデータについては、期待していたよりも申請および利用料の支払いに時間がかかり、データが手元に届いたのが遅れた。
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Strategy for Future Research Activity |
2年目に引き続き、研究を進めていく。具体的には、BioBank Japanの方については、アウトカムとしての死亡情報の提供が行われ次第、残りの解析を進め、論文執筆に移っていく。UK Biobankの方については、残りの解析を完了し、論文執筆に移る。
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Causes of Carryover |
UK BioBankの利用料を一度にまとめて支払う必要が生じたたため、最終年度の分を前倒して使わせていただいた。
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