PCRフリー超深度全ゲノムシークエンスを用いた環境DNAによる全生物相把握

2022 Fiscal Year Comments on the Screening Results

• Project/Area Number: 22K18429
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 64:Environmental conservation measure and related fields
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 土居 秀幸 京都大学, 情報学研究科, 教授 (80608505)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 永野 真理子 京都先端科学大学, バイオ環境学部, 嘱託講師 (80792829) ; 片野 泉 奈良女子大学, 自然科学系, 教授 (90414995)
• Project Period (FY): 2022-06-30 – 2026-03-31

Summary of the Research Project

環境DNA技術は、生物学のみならず、社会的、経済的にも関心が高まっている生物多様性把握において、中心的技術になっている。これまでの環境DNA分析では、PCR過程が入ることで増幅バイアスが生じる等の問題があったが、応募者らはPCRを使わずに配列決定を行う手法を提案している。

Scientific Significance and Expected Research Achievements

PCRによるバイアスがどの程度生じているのかは、PCRを使った分析では評価できない。たとえば、採用されたプライマーで増幅できていない生物が見落とされていたとしても、それは現在の方法ではわからない。この研究によってPCRによらない環境DNAも分析が標準的に可能になれば、革新的な進歩が期待できる。