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2023 Fiscal Year Research-status Report

生体膜で創るロタキサン型タンパク質超分子構造と機能発現

Research Project

Project/Area Number 22K19060
Research InstitutionNagoya Institute of Technology

Principal Investigator

出羽 毅久  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70335082)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 近藤 政晴  名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教 (20571219)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2025-03-31
Keywords光合成 / 超分子構造
Outline of Annual Research Achievements

ロタキサン構造をもつ膜タンパク質複合体を作成するために、紅色光合成細菌の光収穫系複合体2(LH2)をリング部位とし、そのリング内部に挿入する軸タンパ ク質を各種設計した。膜貫通部分は膜貫通型αヘリックス構造とし、ストッパーとなる親水性部位はマルトース結合タンパク(MBP)および蛍光タンパク質 (mCherry)とした。前年度の問題点として、発現した軸タンパク質の膜への挿入効率が低いことが明らかとなり、本年度は次の4つについて検討した。
(1) 軸のαヘリックスの変更:ペリプラズム側にN末端となるようにし、膜への挿入方向とタンパク質発現方向が同じにあるようにした。その結果、これまで逆方向であった軸部に比べ、光合成膜中への挿入量が増加した。
(2) 遺伝子配列の変更:これまでLH2βー軸ーLH2αの遺伝子(pucB-Axis-pucA)の順で遺伝子を作成していたが、軸の発現量を増やすために、Axis-pucB-pucAの配列に変更した。その結果、発現量に優位な変化は見られなかった。
(3) N末端配列の重要性の確認:軸タンパク質のN末端領域にpucBの配列を一部組み込んだものと、その配列が無いものについて検討した。その結果、pucBの配列を一部組み込んもののみ発現が確認できた事から、軸タンパク質のN末端領域にはLH2βのN末端アミノ酸数個が光合成細菌内での発現に重要である事がわかった。
(4) タンパク質間相互作用の導入:膜に挿入れた軸分子をLH2タンパク質が認識し相互作用する仕掛けを導入し、超分子構造形成を促す設計を行なった。ここではSpy-tag/SpyCatcherシステムを用い、軸タンパク質部分にSpyCatcher, LH2β部位にSpy-tagを導入した遺伝子の作成を行なっいる。(現在進行中)

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

目的の超分子複合体の安定性が低く、単離精製時に分解してしまう事がわかった。このため、より安定な構造となる設計を導入し、遺伝子作成および光合成細菌内での発現を試みている。

Strategy for Future Research Activity

より安定な複合体をより収率よく光合成膜中で形成させるために、現在進めているSpy-tag/SpyCatcherシステムで研究を推進する。これまでに超分子複合体形成による吸収波長シフトや、単離生成のノウハウが蓄積できているので、より大量に安定な超分子複合体を単離精製する。単離精製できれば、クライオ電子顕微鏡での構造解析に着手し、超分子構造の明確な証拠を得る。

Causes of Carryover

今年度はコストがかかる単離精製実験よりも遺伝子作成と光合成細菌の変異体作成でより経費がかからない実験が多かったため。

  • Research Products

    (23 results)

All 2024 2023

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Delivery of external proteins into the cytoplasm using protein capsules modified with IgG on the surface, created from the amphiphilic two helix-bundle protein OLE-ZIP2024

    • Author(s)
      Kousuke Takahashi, Taiki Nishiyama, Naoki Umezawa, Yasumichi Inoue, Isamu Akiba, Takehisa Dewa, Atsushi Ikeda, Toshihisa Mizuno
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 60 Pages: 968 _ 971

    • DOI

      10.1039/D3CC05347D

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional Coupling of Biohybrid Photosynthetic Antennae and Reaction Center Complexes: Quantitative Comparison with Native Antennae2023

    • Author(s)
      Takehisa Dewa, Komei Kimoto, Genki Kasagi, Hiromi Harada, Ayumi Sumino, and Masaharu Kondo
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 127 Pages: 10315-10325

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c04922

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Atomic force microscopic analysis of the light-harvesting complex 2 from purple photosynthetic bacterium Thermochromatium tepidum2023

    • Author(s)
      Masayuki Morimoto, Haruna Hirao, Masaharu Kondo, Takehisa Dewa, Yukihiro Kimura, Zheng-Yu Wang-Otomo, Hitoshi Asakawa, Yoshitaka Saga
    • Journal Title

      Photosynth. Res.

      Volume: 157 Pages: 13-20

    • DOI

      10.1007/s11120-023-01010-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cryogenic single-molecule fluorescence detection of mid-infrared response of an intrinsic pigment in light-harvesting complex2023

    • Author(s)
      Kohei Otomo, Takehisa Dewa, Michio Matsushita, and Satoru Fujiyoshi
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B.

      Volume: 127 Pages: 4959-4965

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c00284

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Functional Coupling of Biohybrid Photosynthetic Antennae and Reaction Center Complexes: Quantitative Comparison with Native Antennae2023

    • Author(s)
      Takehisa Dewa
    • Organizer
      16th International Symposium on Nanomedicine (ISNM2023)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 光合成膜タンパク質集合体により駆動する光エネルギー変換人工オルガネラ2023

    • Author(s)
      出羽毅久
    • Organizer
      2023年度 超越分子システム 高野山会議
  • [Presentation] B800またはB850近傍に人工色素を導入したバイオハイブリッドLH2の示すエネルギー移動ダイナミクス2023

    • Author(s)
      石川 宙・邨井 孝行・松中 由有・山本 哲也・平川 正斗・米田 勇祐・近藤 政晴・出羽 毅久・小島 理沙・長澤 裕
    • Organizer
      第23回 日本光生物学協会年会
  • [Presentation] バイオハイブリッド光収穫系複合体による波長領域の拡張・超高速エネルギー移動・光電変換2023

    • Author(s)
      出羽毅久・平川正斗・森川凌雅・鬼頭征也・石川宙・山本哲也・米田勇祐・近藤政晴・長澤裕
    • Organizer
      第72回高分子討論会
  • [Presentation] 蛍光色素を結合した光収穫系複合体LH2変異体での超高速エネルギー移動2023

    • Author(s)
      平川正斗、森下凌雅、鬼頭征也、石川宙、山本哲也、米田勇佑、近藤政晴、長澤裕、出羽毅久
    • Organizer
      第72回高分子討論会
  • [Presentation] 光重合性脂質 (Diyne-PC) により形成される光収穫相から光収穫系複合体(LH2)へのエネルギー移動2023

    • Author(s)
      長谷川 馨、近藤 政晴、森垣 憲一、出羽 毅久
    • Organizer
      第72回高分子討論会
  • [Presentation] 半導体光触媒の水分解反応と共役する光収穫系1-反応中心複合体(LH1-RC)の光触媒反応2023

    • Author(s)
      各務 朱音、小久保 燎、近藤 政晴、鈴木 肇、阿部 竜、出羽 毅久
    • Organizer
      第72回高分子討論会
  • [Presentation] 光合成膜中で発現させた非天然型タンパク質による超分子複合体形成2023

    • Author(s)
      秦潤奈、鈴木康史、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • Organizer
      第72回高分子討論会
  • [Presentation] Energy transfer dynamics of biohybrid LH2: Introduction of artificial dye in the vicinity of B8002023

    • Author(s)
      Sora Ishikawa・Takayuki Murai・Yu Matsunaka・Tetsuya Yamamoto・Masato Hirakawa・Yusuke Yoneda・Masaharu Kondo・Takehisa Dewa・Risa Kojima・Yutaka Nagasawa
    • Organizer
      2023年光化学討論会
  • [Presentation] 脂質に結合した蛍光色素を利用した光捕集系膜タンパク質LHCIIの機能拡張2023

    • Author(s)
      近藤政晴・桑原隼人・Ashley Hancock・Peter Adams・出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 半導体光触媒と光収穫系1-反応中心複合体(LH1-RC)の電子移動反応2023

    • Author(s)
      各務朱音・小久保燎・近藤政晴・鈴木 肇・阿部 竜・出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 紅色光合成細菌の膜中での人工膜タンパク質発現2023

    • Author(s)
      藤田悠作、秦 潤奈、鈴木康史、平野佳穂、近藤政晴、出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 光合成膜中で発現させた非天然型タンパク質による超分子複合体形成2023

    • Author(s)
      秦潤奈、鈴木康史、和田拓也、近藤政晴、出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] B820/B850混在LH2の作製を目的としたRhodobacter sphaeroides 2.4.1変異体の調製2023

    • Author(s)
      浅野賢吾・三浦彩音・近藤政晴・出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 重合性脂質Diyne-PCからなるリポソームの光重合と光収穫相としての分光学的特性2023

    • Author(s)
      長谷川 馨・近藤政晴・森垣憲一・出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 蛍光色素を結合した光収穫系複合体LH2変異体による超高速エネルギー移動制御2023

    • Author(s)
      平川正斗・鬼頭征也・石川 宙・山本哲也・米田勇佑・近藤政晴・長澤 裕・出羽毅久
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 近赤外蛍光タンパク質と光捕集タンパク質の融合による光合成機能拡張2023

    • Author(s)
      松本空大、出羽毅久、近藤政晴
    • Organizer
      第30回光合成セミナー2023:反応中心と色素系の多様性
  • [Presentation] 蛍光色素により光収穫能を増強したバイオハイブリッドLH2とその後2023

    • Author(s)
      出羽毅久
    • Organizer
      JSTさきがけ「光エネルギーと物質変換」第18回領域会議
  • [Book] カロテノイドの科学 ―基礎、研究の新展開、生理活性―2024

    • Author(s)
      高市真一(監修)、出羽毅久・近藤政晴(第6章)
    • Total Pages
      275
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1798-4

URL: 

Published: 2024-12-25  

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