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2023 Fiscal Year Annual Research Report

アミロイド形成を理解する相分離仮説の実証と共溶質の開発

Research Project

Project/Area Number 22K19284
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

白木 賢太郎  筑波大学, 数理物質系, 教授 (90334797)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 菅井 祥加  東京工業大学, 国際先駆研究機構, 特任助教 (10905566)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Keywordsタンパク質 / 凝集 / 相分離
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、アミロイド線維による固い凝集体の形成の途中に液滴を形成するという仮説を実証することを目的としている。タンパク質分子間の相互作用を可視化し、同時に制御するために、申請者がこれまで開発してきた凝集抑制剤を用いた。
まず、Sup35を対象に、このタンパク質が液滴や凝集体などの集合状態を形成する条件を明らかにし、それぞれの形成に共溶質が 影響をおよぼすかを調べた。この条件を活用し、マイクロメーターサイズの大きさがアミロイドの形成におよぼす影響を定量化し論文に報告した。オボアルブミンとリゾチームのモデルタンパク質の組み合わせを用いることで、両者のタンパク質のどのような濃度比によって、液-液相分離による液滴とアモルファスな凝集体が生じるのかを定量した。タンパク質の凝集の状態は、ガラス表面の化学修飾のパターンによっても異なることがわかり、あわせて論文として報告した。研究を進めていくなかで、タンパク質の液滴と凝集体は相図を描くことによって正しく評価できることがわかり、オボアルブミンとリゾチームの系のほか、低分子であるATPとポリリン酸においても同様の研究を進め、ATP濃度が低濃度側と高濃度側で液滴の物性やサイズが異なることを明らかにし、論文にまとめた。
タンパク質の液-液相分離による液滴の形成と、そこから凝集体やアミロイドが形成することを実証する系の構築に成功した。このタンパク質の状態変化には表面の状態がかかわること、さらに、液滴の形成そのものが低分子およびタンパク質濃度の比によって影響を受けることを、相図を用いて定量化する系の構築に成功した。これらの結果を複数の原著論文として報告した。

  • Research Products

    (5 results)

All 2024 2023

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Interfacial and intrinsic molecular effects on the phase separation/transition of heteroprotein condensates2024

    • Author(s)
      Nobeyama Tomohiro、Yoshida Toya、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      International Journal of Biological Macromolecules

      Volume: 254 Pages: 128095~128095

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2023.128095

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of Fibril Nucleation in Micrometer-Sized Protein Condensates and Suppression of Sup35NM Fibril Nucleation by Liquid-Liquid Phase Separation2023

    • Author(s)
      Fukuyama Mao、Nishinami Suguru、Maruyama Yoko、Ozawa Taiki、Tomita Shunsuke、Ohhashi Yumiko、Kasuya Motohiro、Gen Masao、Chatani Eri、Shiraki Kentaro、Hibara Akihide
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: 95 Pages: 9855~9862

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.3c00766

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phase-Diagram Observation of Liquid-Liquid Phase Separation in the Poly-l-Lys/ATP System and a Proposal for Diagram-Based Application Strategy2023

    • Author(s)
      Nobeyama Tomohiro、Furuki Tomohiro、Shiraki Kentaro
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 39 Pages: 17043~17049

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.3c01640

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Control of protein aggregation by small additives2023

    • Author(s)
      Kentaro Shiraki
    • Organizer
      International Powder and Nanotechnology Forum 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 相分離生物学の基礎としてのタンパク質の凝集や相分離2023

    • Author(s)
      白木賢太郎
    • Organizer
      関東高分子若手研究会2023
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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