2023 Fiscal Year Annual Research Report
Alteration of epigenome in seletecd genomic regions against gastrointestinal cancer
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22K19553
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
金田 篤志 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (10313024)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Keywords | がん / エピゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ゲノム情報を制御し細胞の性質を運命づけるゲノム修飾情報であるエピゲノムは、その異常により消化器癌など多くの悪性腫瘍の発生と進展に寄与している。それゆえ、癌ドライバーとして機能し、治療標的となり得るドライバーエピゲノム異常を同定し、それら重要なエピゲノムを標的とした機能性分子を開発して新たな治療基盤を創生することが、特に薬剤抵抗性の難治癌症例に対して求められている。エピゲノムに対する従来の機能性分子単剤では作用領域がゲノム全体に及ぶ弊害があるため、本研究では、DNA配列を認識する小分子ピロール-イミダゾールポリアミド(PIP)を機能性分子に融合させ、作用領域を局所化させる技術開発を行った。ヒストン脱メチル化酵素阻害剤やヒストンアセチル化酵素阻害剤の構造を改変・簡略化し、PIPと縮合してそれぞれ腫瘍細胞へ投与し増殖抑制作用を確認するとともに、PIPが認識する配列を含む領域において有意にエピゲノム改変が起きることを確認した。癌で治療標的となり得る重要なエピゲノム異常領域を同定する研究では、EBウイルス感染によるエピゲノム異常が発癌に寄与する胃癌や上咽頭癌などのEBV関連腫瘍について解析した。EBV感染によりEBVゲノムがヘテロクロマチンに結合しエンハンサーの活性化マークを上昇させ癌原遺伝子を発現上昇させる「エンハンサー侵襲」が胃癌だけでなく上咽頭癌でも重要であることを報告した。またHi-ChIP法を用いて、癌で特異的に異常形成されるエンハンサー・プロモーター間の近接関係を網羅的に解析した。それら異常活性化エンハンサーに有意に認める転写因子結合モチーフ配列を同定し、候補群の中からTCF7が重要な転写因子であり、下流標的として癌遺伝子MYBの異常活性化が癌細胞増殖に重要であること、CRISPRiによるエンハンサーの特異的な不活化の効果も確認し新たなPIPの標的候補と考えられた。
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[Journal Article] Aberrant Upregulation of RUNX3 Activates Developmental Genes to Drive Metastasis in Gastric Cancer2024
Author(s)
Suda K, Okabe A, Matsuo J, Chuang LSH, Li Y, Jangphattananont N, Mon NN, Myint K, Yamamura A, So JBY, Voon D, Yang H, Guan Y, Kaneda A, Ito Y
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Journal Title
Cancer Research Communications
Volume: 4
Pages: 279～292
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Chromatin activation with H3K36me2 and compartment shift in metastatic castration-resistant prostate cancer2024
Author(s)
Kanaoka S, Okabe A, Kanesaka M, Rahmutulla B, Fukuyo M, Seki M, Hoshii T, Sato H, Imamura Y, Sakamoto S, Ichikawa T, Kaneda A
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Journal Title
Cancer Letters
Volume: 588
Pages: 216815～216815
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Enhancer infestation drives tumorigenic activation of inactive B compartment in Epstein-Barr virus-positive nasopharyngeal carcinoma2024
Author(s)
Mizokami H, Okabe A, Choudhary R, Mima M, Saeda K, Fukuyo M, Rahmutulla B, Seki M, Goh BC, Kondo S, Dochi H, Moriyama-Kita M, Misawa K, Hanazawa T, Tan P, Yoshizaki T, Fullwood MJ, Kaneda A
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Journal Title
eBioMedicine
Volume: 102
Pages: 105057～105057
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Integrated Enhancer Regulatory Network by Enhancer-Promoter Looping in Gastric Cancer.2024
Author(s)
Zhu T, Okabe A, Usui G, Fujiki R, Komiyama D, Huang KK, Seki M, Fukuyo M, Abe H, Ning M, Okada T, Minami M, Matsumoto M, Fan Q, Rahmutulla B, Hoshii T, Tan P, Morikawa T, Ushiku T, Kaneda A
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Journal Title
NAR Cancer
Volume: 6
Pages: zcae020
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Association of frequent hypermethylation with high grade histological subtype in lung adenocarcinoma2023
Author(s)
Ito Y, Usui G, Seki M, Fukuyo M, Matsusaka K, Hoshii T, Sata Y, Morimoto J, Hata A, Nakajima T, Rahmutulla B, Kaiho T, Inage T, Tanaka K, Sakairi Y, Suzuki H, Yoshino I, Kaneda A
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Journal Title
Cancer Science
Volume: 114
Pages: 3003～3013
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Integrated environmental, lifestyle, and epigenetic risk prediction of primary gastric neoplasia using the longitudinally monitored cohorts2023
Author(s)
Usui G, Matsusaka K, Huang KK, Zhu F, Shinozaki T, Fukuyo M, Rahmutulla B, Yogi N, Okada T, Minami M, Seki M, Sakai E, Fujibayashi K, Tsao SKK, Khor C, Ang TL, Abe H, Matsubara H, Fukayama M, Gunji T, Matsuhashi N, Morikawa T, Ushiku T, Yeoh KG, Tan P, Kaneda A
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Journal Title
eBioMedicine
Volume: 98
Pages: 104844～104844
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Peritumoral SPARC expression induced by exosomes from nasopharyngeal carcinoma infected Epstein‐Barr virus: A poor prognostic marker2023
Author(s)
Dochi H, Kondo S, Komura S, Moriyama-Kita M, Komori T, Nanbo A, Sakaguchi M, Fukuyo M, Hamabe-Horiike T, Tanaka M, Mizokami H, Kano M, Kitagawa Y, Kobayashi E, Hirai N, Ueno T, Nakanishi Y, Endo K, Sugimoto H, Hanayama R, Kaneda A, Yoshizaki T
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Journal Title
International Journal of Cancer
Volume: 154
Pages: 895～911
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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