2023 Fiscal Year Annual Research Report
集団ゲノミクスで解き明かす、東アジアのトキソプラズマの移動の歴史
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22K20614
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
猪原 史成 大阪大学, 微生物病研究所, 助教 (00800773)
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2022-08-31 – 2024-03-31
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| Keywords | トキソプラズマ / ゲノミクス / 集団ゲノミクス / 病原体の進化学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
世界的な原虫の病原体であるトキソプラズマ（Toxoplasma gondii）の遺伝的多様性を解明することは、この寄生虫の拡散と進化の歴史を理解する上で不可欠である。これまでの研究は主に欧州、アフリカ、アメリカの株に焦点を当て、アジアのトキソプラズマに関する知見は限られていた。そこで本研究では、日本のトキソプラズマの収集および分離を行い、さまざまな集団ゲノミクスの手法を用いて「世界のトキソプラズマ集団」と「極東アジアのトキソプラズマ集団」の比較ゲノム解析を実施した。我々は、日本で分離された8株および中国で分離された2株のほぼ完全なゲノム情報に加えて、ターゲット濃縮シークエンスを用いて7株の部分的なゲノム情報を取得した。解析の結果、我が国で主要なトキソプラズマは、欧米で一般的なハプログループ2（HG2）とは異なり、中国で寡占的なHG13と混血した亜種であることが明らかとなった。さらに、日本株のゲノムから2つの新しい祖先系統が同定された。1つは、北米に固有のHG12と共通して見られたものであり、もう一つは、沖縄県で分離されたトキソプラズマと中南米株で共通した祖先系統を有していた。また、沖縄で分離された強毒株が、本土の土着系統と沖縄でみられる弱毒系統のハイブリッドによって誕生したことが強く示唆された。この研究により、極東アジアと北米、ラテンアメリカのトキソプラズマ間で共有された祖先が存在したことが示唆され、この病原体の伝搬の歴史について新しい知見を提供した。
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[Journal Article] Far-East Asian Toxoplasma isolates share ancestry with North and South/Central American recombinant lineages.2024
Author(s)
Fumiaki Ihara, H. Kyan, Y. Takashima, F. Ono, Kei Hayashi, T. Matsuo, M. Igarashi, Y. Nishikawa, Kenji Hikosaka, H. Sakamoto, S. Nakamura, D. Motooka, K. Yamauchi, M. Ichikawa-Seki, S. Fukumoto, M. Sasaki, H. Ikadai, K. Kusakisako, Y. Ohari, A. Yoshida, M. Sasai, M.E. Grigg, and M. Yamamoto
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Journal Title
Nature Communications
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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