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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Quality and evolutionary control of RNA virus genome via nonsense mediated mRNA decay

Research Project

Project/Area Number 22K20759
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

小森園 亮  京都大学, 医生物学研究所, 特定助教 (10964637)

Project Period (FY) 2022-08-31 – 2024-03-31
KeywordsRNAウイルス / ウイルス進化 / RNA分解
Outline of Annual Research Achievements

急性感染性および持続感染性ウイルスにおけるNMD機構の影響を解析するため、RNAウイルスの1種であるコクサッキーウイルスB3(CVB3)を複数の細胞株に接種し、細胞生存性を評価した結果、ヒトアストロサイト由来CCF-STTG1, KINGS-1, Becker細胞株およびヒト膵臓がん由来PANC-1細胞株で細胞傷害性なしに持続的に子孫ウイルス粒子を産生することが明らかとなった。以上より、1種のRNAウイルスで急性感染および持続感染両方の感染スタイルにおけるNMD機構の影響、かつ経時的な配列解析が可能となった。
次に、NMD機構の因子であるUPF1/2/3B, SMG1/5/6/7遺伝子ノックダウン細胞をHEK293Tおよびヒトオリゴデンドロサイト由来HOG細胞株を用いて樹立した。これらNMDノックダウン細胞を用いてCVB3、ボルナ病ウイルス(BoDV-1)を接種し感染性をqRT-PCR、IFAおよびtitration assayにより評価した結果、shUPF1およびshUPF2細胞においてCVB3では有意に上清中のウイルスRNA量が上昇し、BoDV-1では細胞内ウイルスゲノムRNA量が上昇した。同様に、NMD阻害剤であるNMDI-14をHEK293T, HOG, Huh7細胞に投与後CVB3およびBoDV-1を接種した結果、細胞内ウイルスRNA量が有意に上昇した。またCCF-STTG1およびPANC-1細胞にCVB3を接種後NMDI-14を投与した結果、同様にウイルスRNA量が上昇した。以上の結果より、NMD機構は急性感染性および持続感染性問わずRNAウイルスの複製を制御していることが示唆された。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Contact-number-driven virus evolution: A multi-level modeling framework for the evolution of acute or persistent RNA virus infection2023

    • Author(s)
      Sunagawa Junya、Komorizono Ryo、Park Hyeongki、Hart William S.、Thompson Robin N.、Makino Akiko、Tomonaga Keizo、Iwami Shingo、Yamaguchi Ryo
    • Journal Title

      PLOS Computational Biology

      Volume: 19 Pages: -

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1011173

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Reverse genetics of parrot bornavirus 4 reveals a unique splicing of the glycoprotein gene that affects viral propagation2023

    • Author(s)
      Komorizono Ryo、Fujino Kan、Kessler Susanne、Runge Solveig、Kanda Takehiro、Horie Masayuki、Makino Akiko、Rubbenstroth Dennis、Tomonaga Keizo
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 97 Pages: -

    • DOI

      10.1128/jvi.00509-23

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation may select for earlier and higher peak viral load but shorter duration in SARS-CoV-2 evolution2023

    • Author(s)
      Sunagawa Junya、Park Hyeongki、Kim Kwang Su、Komorizono Ryo、Choi Sooyoun、Ramirez Torres Lucia、Woo Joohyeon、Jeong Yong Dam、Hart William S.、Thompson Robin N.、Aihara Kazuyuki、Iwami Shingo、Yamaguchi Ryo
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41467-023-43043-2

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Excel-REGENS: The ex vivo gene cell therapy using REVec-based genetically engineered stem cells.2023

    • Author(s)
      Ryo Komorizono, Shima Yoshizumi, Keizo Tomonaga
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
  • [Presentation] ボルナウイルスベクターを用いた遺伝子細胞治療薬の開発2023

    • Author(s)
      Ryo Komorizono
    • Organizer
      第29回日本遺伝子細胞治療学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] RNA Virus Based Episomal Vector for Highly Efficient Genetic Engineering of Human Mesenchymal Stromal Cells2023

    • Author(s)
      Ryo Komorizono, Shima Yoshizumi, Miya Kawanaka, Keizo Tomonaga
    • Organizer
      American Society of Gene & Cell Therapy The 26th Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 自己複製型RNAウイルスベクター「REVec」の応用2023

    • Author(s)
      小森園亮
    • Organizer
      BioJapan2023
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ボルナウイルスベクターを利用した細胞の遺伝子改変と当該細胞を用いた細胞治療薬2024

    • Inventor(s)
      小森園亮、朝長啓造
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2024- 45885

URL: 

Published: 2024-12-25  

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