大腸菌・サルモネラにおけるRNA制御回路の階層性に関する研究

2023 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 22KF0052
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 宮腰 昌利 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (60755809)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): LEJARS MAXENCE 筑波大学, 医学医療系, 外国人特別研究員
• Project Period (FY): 2023-03-08 – 2024-03-31
• Keywords: アミノ酸代謝 / GcvB

Outline of Annual Research Achievements

アミノ酸の輸送や生合成に関与する50以上の遺伝子（大腸菌ゲノムの1%以上）を制御するsmall RNA GcvBは、大腸菌などの腸内細菌科細菌に限らずグラム陰性細菌に広く保存されている。GcvBの細胞内存在量は最大でも140分子程度であるため、1つの細胞内で全ての標的遺伝子が制御されるかは確率的であり、標的遺伝子にはヒエラルキーが存在すると考えられる。本研究はGcvBがどのように標的mRNAを選択するかを明らかにし、転写後レベルの制御ネットワークに階層性を与えるメカニズムを解明することを目的とする。
代表的なGcvB標的遺伝子のGFP翻訳融合体を作成した。また、リボソーム休止因子遺伝子rmf、hpf、raiAのレポーターを作成し、各種培養条件の増殖曲線、発現量の変動を解析した。ゲルシフトアッセイによりin vitroではGcvBはrmf mRNAと塩基対形成することが明らかになった。しかしながら、現在のところGcvB過剰発現株および破壊株におけるrmfレポーターの発現量に再現性のある有意な変化は見出されなかった。