Elucidation of anhydrobiosis in Triops longicaudatus.

2023 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 22KF0392
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: 黄川田 隆洋 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, グループ長 (60414900)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): BELOTT CLINTON 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 外国人特別研究員
• Project Period (FY): 2023-03-08 – 2024-03-31
• Keywords: 乾燥耐性

Outline of Annual Research Achievements

この研究目的は、アメリカカブトエビの高品質なゲノム配列データを取得し、この種の乾燥耐性に寄与すると思われる遺伝子を同定することであった。その結果、私たちはアメリカカブトエビについてこれまでで最も完全なゲノムを取得し、バイオインフォマティクスを用いて、ブラインシュリンプの乾燥耐性と照らし合わせながら、この種の乾燥耐性の進化について洞察を得ることができた。さらに、アメリカカブトエビの乾燥耐性に重要な役割を果たす可能性のある新規候補タンパク質も同定した。同定された候補タンパク質がアメリカカブトエビの乾燥耐性に関与していることを確認するためには、細胞モデルを用いたさらなる研究が必要であるが、今回の共同研究は大きな成功を収めた。アセンブルされたゲノムは、染色体を代表するほぼ6つの完全なコンティグと、ミトコンドリアゲノムを代表する1つの独立した円形コンティグで構成された。これは現在発表されているカブトエビ（近縁種）の核型データとよく一致しており、カブトエビは6本の染色体を有していた。このアセンブリのBUSCOスコアは97.63%（Complete）および99.21%（Complete+Partial）であり、このアセンブリはカブトエビゲノムのアセンブリとしてはこれまでで最も完全であることが示唆された。アメリカカブトエビのゲノムは、新規遺伝子を同定するための信頼性の高いアノテーションがなされ、今後アメリカカブトエビの乾眠を研究するためのいくつかのエキサイティングな道が開かれることが期待される。