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2023 Fiscal Year Annual Research Report

有孔虫の脱窒メカニズムを理解するための壁孔、液胞のバイオメトリクス

Research Project

Project/Area Number 22KF0424
Allocation TypeMulti-year Fund
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

野牧 秀隆  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 上席研究員 (90435834)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) RICHIRT JULIEN  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2023-03-08 – 2024-03-31
Keywords貧酸素適応 / 液胞 / バイオメトリクス / X線CT
Outline of Annual Research Achievements

相模湾深海底から採取した堆積物を深度ごとにサンプリングし、有孔虫Bolivina spissaを酸素濃度および硝酸塩濃度の異なる環境(堆積物深度)ごとに分取した。また、Bolivina spissaを異なる酸素濃度、硝酸塩濃度に暴露した飼育実験を行い、液胞のサイズなどにどのような変化が見られるかも検討した。有孔虫試料はグルタールアルデヒドを用いて固定し、樹脂包埋、金属染色後にマイクロフォーカスX線CTを用いた内部微細構造解析を行った。得られたデータを3次元画像構築・解析ソフトを用いて解析し、環境間・種間で硝酸塩を貯める液胞の大きさ(表面積、体積)や数に違いがみられるかを検討した。
生息深度や飼育実験環境における酸素濃度、硝酸塩濃度の違いと、液胞の表面積、体積、個数には明確な関連が見られなかった一方で、房室ごとの液胞サイズには、初室側、最終室側、中間部で一貫したパターンが見られた。TEM観察により液胞の周辺を観察すると、液胞の周囲に配置される細胞小器官の様子に違いが見られた。さらに、Cryo-SEM-EDSを用いて硝酸塩に由来する窒素が液胞にどのように含まれているかを解析したところ、特定の液胞に集中している様子が見られた。このことは、実体顕微鏡、透過型電子顕微鏡像では同じに見える液胞が、それぞれ異なる役割を持つことを示す。実際に、Cryo-SEM-EDSによる元素分析では、貧酸素代謝に関連する特定の元素を濃集させた、TEM像では液胞に見える細胞小器官が見つかった。一連の研究により、大型単細胞生物有孔虫の貧酸素環境での適応においては、硝酸塩を用いた脱窒だけではなく多様な貧酸素代謝の組み合わせが行われていることが明らかになった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] ハンブルグ大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ハンブルグ大学
  • [Journal Article] Rapid Freezing and Cryo-SEM?EDS Imaging of Foraminifera (Unicellular Eukaryotes) Using a Conductive Viscous Cryogenic Glue2024

    • Author(s)
      Okada Satoshi、Richirt Julien、Tame Akihiro、Nomaki Hidetaka
    • Journal Title

      Microscopy and Microanalysis

      Volume: ozae026 Pages: -

    • DOI

      10.1093/mam/ozae026

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Composite calcite and opal test in Foraminifera (Rhizaria)2024

    • Author(s)
      Richirt Julien、Okada Satoshi、Ishitani Yoshiyuki、Uematsu Katsuyuki、Tame Akihiro、Oda Kaya、Isobe Noriyuki、Ishimura Toyoho、Tsuchiya Masashi、Nomaki Hidetaka
    • Journal Title

      EGUsphere

      Volume: 10.5194/egusphere-2024-60 Pages: -

    • DOI

      10.5194/egusphere-2024-60

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Vacuoles size and abundance in Foraminifera: new insight about their metabolic adaptation to low oxygen environments2023

    • Author(s)
      Richirt J, Matsuzaki T, Ishitani Y, Tame A, Oda K, Nomaki H
    • Organizer
      FORAMS2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Correlative analyses of cellular structures and elemental distribution of soluble compounds: Cryo-SEM imaging coupled to EDS elemental mapping in the denitrifying species Bolivina spissa2023

    • Author(s)
      Richirt J, Okada S, Glock N, Ishitani Y, Nomaki H
    • Organizer
      FORAMS2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Molecular insights into ecology and evolution of the deep-sea foraminifer Chilostomella ovoidea and its endobiotic plastid2023

    • Author(s)
      Salonen I, Husnik F, Naumova M, Ishitani Y, Richirt J, Nomaki H
    • Organizer
      FORAMS2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ubiquitous occurrence of phosphate storage in foraminifera: Another adaptation to anaerobic environments?2023

    • Author(s)
      Glock N, Nomaki H, Woehle C, Algar C, Kienast M, Menon AG, Mutzberg A, Rakshit S, Richirt J, Schmiedl G, Steiner Z, Zhang Z
    • Organizer
      FORAMS2023
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2024-12-25  

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