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2023 Fiscal Year Research-status Report

鉛・亜鉛汚染地における健全土壌の再生成に向けた植物―微生物相互作用の解明

Research Project

Project/Area Number 22KJ0001
Allocation TypeMulti-year Fund
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

龍見(岩岡) 史恵  北海道大学, 農学研究院, 特別研究員(CPD)

Project Period (FY) 2023-06-29 – 2026-03-31
Keywords土壌微生物 / 微生物間相互作用 / 植物ー微生物相互作用 / 菌根菌 / 病原菌 / メタトランスクリプトーム / 窒素
Outline of Annual Research Achievements

研究開始時期に新型コロナウイルスによる影響でザンビアへの渡航が不可能だったなど複数の事情により、鉛・亜鉛汚染に限定せず、土地利用変化や環境変動に伴うストレス下における植物―土壌微生物間の相互作用の理解、および、植物生育の健全化に寄与する土壌微生物の機能についての研究を進めている。特に、ザンビアから輸入した鉛・亜鉛汚染の影響を受けた土壌、アメリカ・ボストンにおける都市化による土壌汚染の影響下にある土壌、アメリカ・ニューハンプシャーにある温暖化に伴い土壌凍結ストレスが増加した土壌、北海道の化学肥料・農薬を用いない水田と比較した慣行農法下にある水田土壌などを対象に研究を行っている。これまでの研究で、都市化、それに伴う林縁部の増加によって、植物と共生関係にある外生菌根菌の土壌に占める割合が低下することがわかったが、当該年度の研究により、外生菌根菌の活動の中でも特に窒素吸収の活動が林縁部で低下することが、土壌メタトランスクリプトーム解析により明らかとなった。この外生菌根菌の窒素吸収の活動と、樹木の葉の窒素濃度には相関があり、外生菌根菌が樹木の健全性において果たす役割の重要性を強調している。また、これまでの研究で、土壌の菌根菌の量と逆相関して土壌で植物病原菌および動物病原菌が増加することが明らかとなっていたが、当該年度において、生態系内の様々な微生物の生息地からサンプルを採取した結果を解析した結果、生態系内の異なる生息地間の間で病原菌の量がある程度維持されることが新たにわかった。これは、環境変動などによる土壌微生物叢の変化が生態系内の他の微生物叢にも影響を与えうる可能性を示唆している。このことから、ストレス環境下において、植物共生菌を維持し病原菌を減らす形で土壌微生物叢を健全化する手法を解明することで、生態系全体に生息する病原菌の低下にも繋がるかもしれない。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究開始時期に新型コロナウイルスによる影響により渡航ができず、研究の方向性を大きく修正することになったが、その中でも、現地から輸入した土壌や、鉛・亜鉛濃度を変化させた土壌を用いて研究を進めてきた。また、鉛・亜鉛汚染に限定せず、臨機応変に様々なストレス環境下にある土壌を対象に切り替え、各ストレスがどのように土壌微生物、特に植物と共生関係を持つ微生物の生態や機能を変化させるのか、また、ストレス環境下において健全な環境由来の土壌微生物を導入することにより植物の生育や健康が改善するのか、についての研究を順調に進めている。土壌メタゲノム解析および土壌メタトランスクリプトーム解析技術を習得し、土壌微生物の機能のより多角的な理解に努めている。学会やセミナーでの講演および論文の発表も精力的に行っている。

Strategy for Future Research Activity

ザンビアから輸入した土壌の分析を進め、生育良好な個体周辺に共通する特異的な微生物要素についての分析を進める。また、室内実験により、鉛・亜鉛および有機物の添加に対する土壌微生物群集の応答に関するデータを集めており、これの解析を進める。特に、汚染下で低下する栄養塩循環に関る微生物の量や組成を特定し、植物の存在下で増加すると考えられる有機物が、これらの微生物要素を回復させるのか明らかにする予定である。加えて、重金属汚染度とも関連する都市―郊外傾度を用いた研究から、林縁部の環境において外生菌根菌が発揮する機能が変化することが土壌メタトランスクリプトーム解析により明らかとなってきた。外生菌根菌と入れ替わりで増加した病原菌の発揮する機能についても解析を行う。さらに、劣化土壌に複数タイプの森林の土壌を加えることで、土壌微生物群集の機能および植物の生育が改善されるのか観察するポット実験を開始したため、定期的に土壌を採取して経過を観察する予定である。また、それぞれ異なる生息域由来の真菌と細菌を混合し、群集の再構築過程を観察する実験を行っており、分析まで完了させた。この実験の解析についても進め、結果を統合して、外部から持ち込んだ微生物が、元々いた微生物とどのように群集を再構築するのか、さらにその新しい微生物群集は植物にとって有用な機能を持つのか、について解明する。これらの研究成果を引き続き随時論文としてまとめていく予定である。

Causes of Carryover

シーケンスを2ラン行う予定だったが、データの納期が当該年度中に間に合うかわからず、次年度に行うことにしたため。

  • Research Products

    (24 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Boston University/University of Florida/Dartmouth College(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Boston University/University of Florida/Dartmouth College
    • # of Other Institutions
      2
  • [Int'l Joint Research] Netherlands Institute of Ecology(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      Netherlands Institute of Ecology
  • [Int'l Joint Research] Karlsruhe Institute of Technology(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Karlsruhe Institute of Technology
  • [Int'l Joint Research] Chinese Academy of Sciences(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Chinese Academy of Sciences
  • [Int'l Joint Research] University of Nigeria(ナイジェリア)

    • Country Name
      NIGERIA
    • Counterpart Institution
      University of Nigeria
  • [Journal Article] Effect of chicken manure amendment on lead burden in mice: exposure to lead-spiked soil2024

    • Author(s)
      Soe Nyein Chan、Yohannes Yared Beyene、Ohigashi Takamitsu、Nakata Hokuto、Tatsumi Chikae、Uchida Yoshitaka、Mufalo Walubita、Ito Mayumi、Sato Tsutomu、Igarashi Toshifumi、Ikenaka Yoshinori、Ishizuka Mayumi、Nakayama Shouta M. M.
    • Journal Title

      Journal of Soils and Sediments

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s11368-024-03769-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stability of ammonia oxidizer communities upon nitrogen fertilizer pulse disturbances is dependent on diversity2023

    • Author(s)
      Mitsuta Akari、Ishige Nao、Tatsumi Chikae、Musavi Madegwa Yvonne、Eurya Kuramae Eiko、Uchida Yoshitaka
    • Journal Title

      Geoderma

      Volume: 439 Pages: 116685~116685

    • DOI

      10.1016/j.geoderma.2023.116685

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mycorrhizal type affects forest nitrogen availability, independent of organic matter quality2023

    • Author(s)
      Tatsumi Chikae、Taniguchi Takeshi、Hyodo Fujio、Du Sheng、Yamanaka Norikazu、Tateno Ryunosuke
    • Journal Title

      Biogeochemistry

      Volume: 165 Pages: 327~340

    • DOI

      10.1007/s10533-023-01087-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Urbanization and edge effects interact to drive mutualism breakdown and the rise of unstable pathogenic communities in forest soil2023

    • Author(s)
      Tatsumi Chikae、Atherton Kathryn F.、Garvey Sarah M.、Conrad-Rooney Emma、Morreale Luca L.、Hutyra Lucy R.、Templer Pamela H.、Bhatnagar Jennifer M.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 120 Pages: 1~9

    • DOI

      10.1073/pnas.2307519120

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Variations in soil nutrient availabilities and foliar nutrient concentrations of trees between temperate monsoon karst and non‐karst forest ecosystems on Mount Ibuki in Japan2023

    • Author(s)
      Kajino Hirofumi、Fukui Misaki、Fujimoto Yutaro、Fujii Rei、Yokobe Tomohiro、Tatsumi Chikae、Sugai Tetsuto、Okada Naoki、Nakamura Ryosuke
    • Journal Title

      Ecological Research

      Volume: 38 Pages: 842~851

    • DOI

      10.1111/1440-1703.12414

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Natural farming diversifies resource-utilisation patterns and increases network complexity in soil microbial community of paddy fields2023

    • Author(s)
      Tatsumi Chikae、Lin Jinfeng、Ishiguro Munehide、Uchida Yoshitaka
    • Journal Title

      Agriculture, Ecosystems & Environment

      Volume: 356 Pages: 108618~108618

    • DOI

      10.1016/j.agee.2023.108618

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacterial Communities and Soil Properties Influencing Dung Decomposition and Gas Emissions Among Japanese Dairy Farms2023

    • Author(s)
      Oraegbunam Chidozie J.、Kimura Akari、Yamamoto Terumasa、Madegwa Yvonne M.、Obalum Sunday E.、Tatsumi Chikae、Watanabe Toshihiro、Uchida Yoshitaka
    • Journal Title

      Journal of Soil Science and Plant Nutrition

      Volume: 23 Pages: 3343~3348

    • DOI

      10.1007/s42729-023-01250-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant material decomposition and bacterial and fungal communities in serpentine and karst soils of Japanese cool-temperate forests2023

    • Author(s)
      Nakamura Ryosuke、Tatsumi Chikae、Kajino Hirofumi、Fujimoto Yutaro、Fujii Rei、Yokobe Tomohiro、Mori Taiki、Okada Naoki
    • Journal Title

      Soil Science and Plant Nutrition

      Volume: 69 Pages: 163~171

    • DOI

      10.1080/00380768.2023.2177493

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Microbial communities associated with nitrogen transformation in canopy soils on large cedars in Yakushima, Japan2024

    • Author(s)
      K Sueyoshi, C Tatsumi, JM Bhatnagar, S Hioki, M Kida, T Ohta, H Ishii, I Saeki, W Azuma
    • Organizer
      日本生態学会大会
  • [Presentation] ヤクスギ林冠と地上土壌における菌根菌群集の比較2024

    • Author(s)
      末吉功季、 龍見史恵、Jennifer M. Bhatnagar、日置頌、木田森丸、太田民久、石井弘明、佐伯いく代、東若菜
    • Organizer
      日本森林学会大会
  • [Presentation] 植物の元素利用と菌根共生:窒 素、リンに着目して2023

    • Author(s)
      中村亮介、 龍見史恵
    • Organizer
      菌根共生からみた進化群集生態学
    • Invited
  • [Presentation] 無肥料無農薬栽培水田における土壌微生物叢について2023

    • Author(s)
      内田 義崇、 龍見 史恵、林 金鋒
    • Organizer
      日本土壌肥料学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Mycorrhizal Fungal Key Roles in Forest Soil Function and Vulnerability to Urbanization2023

    • Author(s)
      Chikae Tatsumi
    • Organizer
      Harvard Forest Seminars
    • Invited
  • [Presentation] Urban trees grow faster when planted further from industrial zones2023

    • Author(s)
      KF Atherton, I Frenette, D Heaton, C Tatsumi, I Smith, LR Hutyra, JM Bhatnagar
    • Organizer
      Annual Meeting of the Ecological Society of America
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 北海道酪農場における異なる生息地に潜む微生物叢が相互に及ぼす影響の解明2023

    • Author(s)
      山本皓正、龍見史恵、内田義崇
    • Organizer
      日本土壌肥料学会大会
  • [Presentation] Diversity of soil microbial community is linked to the stability of ammonia-oxidizing bacterial community and nitrification rates in a volcanic ash soil2023

    • Author(s)
      A Kimura, N Ishige, C Tatsumi, YM Madegwa, E Kuramae, Y Uchida
    • Organizer
      The 8th International Conference on Nitrification and Related Processes
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The Interact-o-gram: Understanding the Biology behind Association Networks2023

    • Author(s)
      KF Atherton, C Tatsumi, D Segre, JM Bhatnagar
    • Organizer
      The 31st Annual Intelligent Systems For Molecular Biology and the 22nd Annual European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Impact of urbanization and forest fragmentation on fungal community composition and activity: A focus on functions for maintaining tree-symbiosis and driving biogeochemical cycles2023

    • Author(s)
      C Tatsumi, H Wang, KH Chen, HL Liao, LR Hutyra, PH Templer, JM Bhatnagar
    • Organizer
      American Geophysical Union 2023 Fall Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] Cutting Up Forests...

    • URL

      https://www.bu.edu/articles/2023/cutting-up-forests-disrupts-essential-bond-between-trees-and-fungi/

URL: 

Published: 2024-12-25  

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