2023 Fiscal Year Research-status Report
同所的な近縁種の有無がシロチョウの性フェロモン進化に与える影響
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22KJ0714
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
岡村 悠 東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(PD)
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| Project Period (FY) |
2023-03-08 – 2025-03-31
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| Keywords | シロチョウ / フェロモン / QTL / ゲノム編集 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
二年目となる本年度は以下を実施した。
（１）トランスクリプトーム解析から候補遺伝子の同定（２）ゲノム編集による候補遺伝子の機能活性測定（３）異種発現系による候補遺伝子の機能活性測定（４）QTL解析のための交配実験
（１）については、二種のシロチョウの雌雄のサンプルから得たトランスクリプトームの解析を行い、オス特異的に発現が見られる候補遺伝子を探索した。そのうえ、近年利用可能となった近縁種シロチョウのゲノム配列から、これらの候補遺伝子を抜き出し種間比較するパイプラインを構築した。いくつかの候補遺伝子は、注目するフェロモンを合成する種に特異的に重複を起こしていることが明らかとなった。これらの候補遺伝子について、いくつかをピックアップしゲノム編集を用いてノックアウトを行ったところ、１つの遺伝子について注目するフェロモンの合成に関与することが明らかとなった。加えて、候補遺伝子のいくつかを大腸菌において発現させ、機能解析を行ったところ、こちらにおいても２つの遺伝子について注目するフェロモンの合成に関わる遺伝子を発見することができた。現在、これらの結果をまとめ、これらを補完するデータを収集しており、これらがまとまり次第、論文として投稿する予定である。（４）のQTL解析のための交配実験は昨年度に引き続き行った。2023年度は複数の個体群のペアを用いて交配実験行なったが、やはりF2の卵の孵化率が非常に低く、F2の成虫を十分得ることができなかった。トランスクリプトームから候補遺伝子を絞る方法が比較的機能している状況から、今後はQTLではなくゲノム編集や異種発現系によって候補遺伝子の機能解析を進めることでフェロモン合成に関わる遺伝子群を明らかにしていく予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度はトランスクリプトーム解析を主体として、フェロモン合成に関わる遺伝子の探索を行った。その結果、シロチョウのフェロモン合成に関わる遺伝子候補を複数見出すことができた。異種発現系による機能活性測定と、ゲノム編集により、これらの候補のうち、複数の遺伝子においてフェロモン合成に関わる活性を持つことが明らかとなった。加えて、ゲノム解析によってこれらの遺伝子は種特異的な重複パターンを持っていることがわかってきている。これらの新知見が得られたため、研究計画は順調に進んでいると考えており、追加の情報やデータを得た後に論文として発表することを予定している。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初はQTL解析を主体として二種の近縁なシロチョウ間に見られるフェロモン組成の違いを生み出す遺伝的な領域を絞り込むことを予定していたが、F2の孵化率が非常に低かったことで困難であった。そのため、トランスクリプトーム解析を主体として手法に切り替え、いくつかの遺伝子について、フェロモン合成に関わる機能を発見することができた。今後はフェロモン合成系において他に重要となる遺伝子を探索することに加え、これまで見つかっている遺伝子については集団遺伝学的な手法を用いて進化解析を行う予定である。これらのデータを纏めて論文として発表する。
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| Causes of Carryover |
当初は日本全土へのサンプリングをプロジェクトの前半で予定していたが、QTL解析がうまくいかなかったことにより、サンプリングは最終年度に行うように予定を変更したため。
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