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2022 Fiscal Year Annual Research Report

深層学習を用いた体性感覚皮質の神経可塑性の検証

Research Project

Project/Area Number 22J22097
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

山城 皓太郎  東京大学, 薬学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2022-04-22 – 2025-03-31
Keywords一次体性感覚皮質 / 深層学習
Outline of Annual Research Achievements

当研究の目的は、神経活動からの体性感覚の解読、および環境変化を経験することによる体性感覚の可塑的変化の検証である。これに取り組むにあたり、末梢から送られてきた情報を処理する、一次体性感覚皮質(s1)の神経活動を記録し、深層学習を用いて異なる体性感覚に対する神経活動を解読する。さらに、神経活動を学習した深層ニューラルネットワークを用いて、経験による体性感覚の神経可塑性を検証する。2022年度においては、ラットのS1から広範囲に電気生理学的記録を取得すること、また取得したデータを深層学習を用いて解析することに成功した。
まず、ラットのS1からの記録については、3Dプリンターで作成したボディとニクロム線を組み合わせ、独自に剣山状の電極を作成した。この電極を用いることで、ラットS1から神経活動の記録した。また、ラットの脚の動きを側面から常に撮影するために、カメラの前にラットを固定して床が動くトレッドミル記録計を立ち上げた。
これらの実験系を用いて、ラットのS1の神経活動と、その時のラットの脚の動きを対応させたデータを記録した。このデータを、ラットの前脚が床に触れる前後200ミリ秒の神経活動を深層学習モデルに学習させたところ、その時ラットの前脚が触れている床の材質を80%の精度で予測することができた。この結果は、申請書の2年度目に記載していた通りの内容であり、計画通りに計画が進んでいることを示している。
ラットの神経活動を学習した深層学習モデルの学習過程の可視化を行ったところ、ラットの前脚が床につく直前のタイミングに注目して分類を行っていることが分かった。この結果は、従来の周波数解析といった線形解析手法では得られない結果であり、深層学習を解析に導入したことで得られたものである。今後は、深層学習モデルが重要と判断したタイミングに着目し、どのような特徴がそのタイミングに表れているかを解明する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

申請研究では、一年度目にラット一次体性感覚皮質(S1)からの記録、二年度目にラットS1の神経活動の深層学習を用いた解析、三年度目に学習した深層学習モデルを用いた、視覚遮断といった環境変化が体性感覚に与える影響の検討を計画していた。
現在の研究状況では、一年度目に作成する予定であった多チャネルの1024チャネル電極を作成することはできなかったが、32チャネルの電極を作成した。深層学習モデルの学習には多くのデータがあることが理想だが、32チャネルでも十分な情報の神経活動が記録できると判断したため、以降は当初の予定とは異なる32チャネルで記録を進めている。ここまでが一年度目の目標であったが、今年度中に深層学習モデルによるラットS1の神経活動の解析まで達成している。これは、当初の予定よりも早く研究が進んでいることを示しており、順調に研究が進展していると判断できる。

Strategy for Future Research Activity

今年度までに、ラット一次体性感覚皮質(S1)からの記録、また深層学習を用いた解析まで行っている。現段階では、目標としている個体数のデータは未取得であるため、まずは目標の例数を達成することを試みる。
次に、目標例数から神経活動を記録できたとし、深層学習モデルを用いた体性感覚の可塑的変化について検証を行う。神経活動を学習した深層学習モデルを用いて神経活動から特徴を抽出し、体性感覚の表象を可視化する。これにより、体性感覚刺激を受容したときの神経活動を、2-3次元空間(低次元空間)の点として表現できる。環境変化の経験前、経験中、経験後において、神経活動を表す点のクラスターを定量することで、S1の神経可塑性を検証する。具体的な環境要因として、視覚情報の有無が体性感覚に与える影響を調べる。ラットが明るい環境では区別できない粒度の紙やすりを複数種類用意する。これらの紙やすりを設置したフィールド内を、明所①(視覚遮断経験前)→暗所(経験中)→明所②(経験後)の順にラットに歩かせ、その間の神経活動を記録する。次に、深層学習モデルを用いて、明所①、暗所、明所②、の3条件の神経活動を低次元空間にプロットする。環境変化を経験する前後のクラスターを解析することで、S1の神経可塑性を検証する。視覚遮断の経験中に変化したパラメーターが、再び明所に戻して視覚が回復したときに維持されていれば、可塑性が生じたと考えられる。

  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results)

  • [Journal Article] Theta oscillations represent collective dynamics of multineuronal membrane potentials of murine hippocampal pyramidal cells2023

    • Author(s)
      Noguchi Asako、Yamashiro Kotaro、Matsumoto Nobuyoshi、Ikegaya Yuji
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 398

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04719-z

  • [Journal Article] Glucose Intake Improves Executive Attention2022

    • Author(s)
      Liu Jiayan、Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The University of Tokyo, Tokyo 113-0033, Japan、Yamashiro Kotaro、Ikegaya Yuji
    • Journal Title

      International Journal of Learning and Teaching

      Volume: 8 Pages: 136~139

    • DOI

      10.18178/ijlt.8.2.136-139

  • [Journal Article] In Utero Electroporation for Manipulation of Specific Neuronal Populations2022

    • Author(s)
      Yamashiro Kotaro、Ikegaya Yuji、Matsumoto Nobuyoshi
    • Journal Title

      Membranes

      Volume: 12 Pages: 513~513

    • DOI

      10.3390/membranes12050513

  • [Presentation] 機械学習を用いてNissl染色画像から齧歯類海馬CA2野を画定する手法の開発2023

    • Author(s)
      竹内悠貴、山城皓太郎、野口朝子、劉佳妍、三井真一、池谷裕二、松本信圭
    • Organizer
      第147回日本薬理学会関東部会
  • [Presentation] Visual deprivation hinders somatosensory processing during rhythmic movement2022

    • Author(s)
      Kotaro Yamashiro, Nobuyoshi Matsumoto, Yuji Ikegaya
    • Organizer
      Society for Neuroscience 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] eep learning-based decoding of surface textures from rat somatosensory cortical activity2022

    • Author(s)
      Kotaro Yamashiro, Nobuyoshi Matsumoto, Yuji Ikegaya
    • Organizer
      From Neuroscience to Artificial Intelligence
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Nissl染色画像を用いた機械学習による齧歯類海馬CA2野の領域画定2022

    • Author(s)
      竹内悠貴、 山城皓太郎、野口朝子、劉佳妍、三井真一、池谷裕二、松本信圭
    • Organizer
      東京大学心の多様性と適応の連携研究機構 公開シンポジウム「情報・こころ・行動」
  • [Presentation] グルコース摂取によるヒトの実効的注意力への寄与2022

    • Author(s)
      劉佳妍、山城皓太郎、池谷裕二
    • Organizer
      第45回日本神経科学大会
  • [Presentation] 深層学習を用いたラット一次体性感覚野における物質表面の表象の解析2022

    • Author(s)
      山城皓太郎(D1)、松本信圭、池谷裕二
    • Organizer
      第45回日本神経科学大会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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