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2023 Fiscal Year Research-status Report

in vitro再構成と光遺伝学の融合による細胞運動の普遍原理の解明

Research Project

Project/Area Number 22KJ1768
Allocation TypeMulti-year Fund
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

山本 啓  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2023-03-08 – 2025-03-31
Keywordsアクチン細胞骨格 / 光遺伝学 / 脂質膜 / in vitro再構成
Outline of Annual Research Achievements

動物細胞における分裂や遊走、膜の突出といった様々な変形現象は、アクチン細胞骨格動態の時間的・空間的な制御によって可能となる。本研究では、アクチン重合を光依存的に操作する申請者独自の技術と精製タンパク質を用いた再構成系を組み合わせることで、アクチンの時空間的な動態と極性形成や運動との因果関係を構成的に理解することを目指している。昨年度までに、必要となる光遺伝学タンパク質、および主要なアクチン細胞骨格タンパク質の精製が完了した。さらに、青色光依存的に結合することが知られているiLID-SspBシステムをin vitro再構成系に用いるための条件検討も完了した。そこで今年度は、上記の精製タンパク質および光遺伝学技術を組み合わせ、脂質平面膜上および油中水滴中において光依存的なアクチン重合を可能とする条件を探索した。さらに、アクチン脱重合因子の添加による可逆的な重合・脱重合の制御や、任意の形状でのアクチン重合など、光を用いることによる本技術の拡張性が確認されている。
今後は、光依存的に重合したアクチンの密度や伸長速度、使用している光遺伝学タンパク質の会合状態などに関して更なる特徴づけが必要である。また、当初予定していた油中水滴中における光依存的なアクチン重合については未だ成功しておらず、細胞運動を引き起こすには至っていない。脂質平面膜を用いた実験において、アクチン重合活性化因子の集積量に応じてアクチン重合の可否が決まることが示唆されていることから、油中水滴やリポソームといった閉鎖系においては光依存的な活性化因子の集積量が不十分な可能性がある。今後、使用する脂質の組成やタンパク質の局在化の方法についてさらなる改善が必要である。また、脂質平面膜を用いた実験系についても、混合するビーズのサイズや形状について検討を進める予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度までに、必要となる光遺伝学タンパク質、および主要なアクチン細胞骨格タンパク質の精製が完了した。さらに、青色光依存的に結合することが知られているiLID-SspBシステムをin vitro再構成系に用いるための条件検討も完了した。そこで今年度は、上記の精製タンパク質および光遺伝学技術を組み合わせ、脂質平面膜上および油中水滴中において光依存的なアクチン重合を可能とする条件を探索した。特に、使用するアクチン重合活性化因子のドメインや、効率的にアクチン重合の活性化因子を脂質平面膜上に集積させるためのリンカーの長さ、光照射方法、脂質平面膜の展開方法等について検討した結果、脂質平面膜上で網目状アクチンを光依存的に重合させることに成功した。さらに、アクチン脱重合因子の添加による可逆的な重合・脱重合の制御や、Digital Micromirror Deviceを用いた任意の形状でのアクチン重合など、光を用いることによる本技術の拡張性が確認されている。また、タンパク質1分子からオルガネラスケールの様々なサイズの蛍光ビーズを再構成アクチンと混合することで、アクチンの網目構造の生理的意義を問うといった新たな展開も見られ、様々な細胞内構造体のサイズが果たす役割について普遍的に示唆を与えることが期待される。加えて、再構成されたアクチンの網目構造の実態を理解するため、膨張顕微鏡法による超解像化にも取り組み、脂質平面膜上でのアクチンの枝分かれ構造をフィラメント1本レベルで可視化することにも成功した。

Strategy for Future Research Activity

今後は、光依存的に重合したアクチンの密度や伸長速度、使用している光遺伝学タンパク質の会合状態などに関して更なる特徴づけが必要である。また、当初予定していた油中水滴中における光依存的なアクチン重合については未だ成功しておらず、細胞運動を引き起こすには至っていない。脂質平面膜を用いた実験において、アクチン重合活性化因子の集積量に応じてアクチン重合の可否が決まることが示唆されていることから、油中水滴やリポソームといった閉鎖系においては光依存的な活性化因子の集積量が不十分な可能性がある。今後、使用する脂質の組成やタンパク質の局在化の方法についてさらなる改善が必要である。また、脂質平面膜を用いた実験系についても、混合するビーズのサイズや形状について検討を進める予定である。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023 Other

All Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] An optogenetic tool to control spatial and temporal dynamics of the actin cytoskeleton2024

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Yosuke Yamazaki, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      RIKEN BDR symposium 2024 Time Across Scales
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Understanding of cell surface mechanics using optogenetics and in vitro reconstitution system2023

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      Academia Sinica IMB Seminar
    • Invited
  • [Presentation] Development of an optogenetic tool to control actin polymerization2023

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Yosuke Yamazaki, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      学術変革(A)「生体秩序力学」第3回領域会議
  • [Presentation] Using optogenetics to understand cell surface mechanics2023

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Yosuke Yamazaki, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      STATPHYS28 Satellite Meeting: Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] アクチン細胞骨格の光操作による細胞表層メカニクスの理解2023

    • Author(s)
      山本 啓、青木 一洋、宮﨑 牧人
    • Organizer
      日本動物学会 第94回山形大会
    • Invited
  • [Presentation] Optogenetic control of actin cytoskeletal dynamics2023

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Yosuke Yamazaki, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      第61回 日本生物物理学会
    • Invited
  • [Presentation] Development and application of optogenetic tools to control mechanics of the actin cytoskeleton2023

    • Author(s)
      Kei Yamamoto, Kazuhiro Aoki, Makito Miyazaki
    • Organizer
      Cell Bio 2023
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] https://researchmap.jp/kei_yamamoto

URL: 

Published: 2024-12-25  

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