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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Development of cell assay technique based on machine learning

Research Project

Project/Area Number 21J22170
Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

李 泓翰  大阪大学, 基礎工学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2021-04-28 – 2024-03-31
Keywords細胞工学 / 機械学習 / 計測 / GAN
Outline of Annual Research Achievements

本年度は「機械学習に基づく細胞アッセイ技術の開発」という研究テーマに廻って,それを実現できるシステムが成功に構築しました。つまり,従来法である「シワ基盤・牽引力顕微鏡・機械学習」この三つの手法を組み合わせ,顕微鏡画像のみから細胞の応力分布を計測できるようになりました。
これまでの結果を整理して「Wrinkle force microscopy: a machine learning based approach to predict cell mechanics from images」という名の論文を完成しNature姉妹誌一つであるCommunications biologyに投稿しました、現時点ではこの論文が無事にacceptされました。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度で解決した問題点が三つである:1.従来の研究でのやむを得ないコストを削減できるようにしました。2.細胞力学情報の獲得が効率化にさせました。3.実験では複数の薬剤の影響を同時に測定することが実現しました。

Strategy for Future Research Activity

本研究の主なアイデア、引いては単純に顕微鏡画像のみで細胞の力学情報を定量化させることは既に本年度で実現しました、今後はこれについてその応用性を着眼しそれを広くにさせます。

  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Niels Bohr Institute(デンマーク)

    • Country Name
      DENMARK
    • Counterpart Institution
      Niels Bohr Institute
  • [Journal Article] Wrinkle force microscopy: a machine learning based approach to predict cell mechanics from images2022

    • Author(s)
      Li Honghan、Matsunaga Daiki、Matsui Tsubasa S.、Aosaki Hiroki、Kinoshita Genki、Inoue Koki、Doostmohammadi Amin、Deguchi Shinji
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03288-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Wrinkle force microscopy: A new cellular assay method based on machine learning2021

    • Author(s)
      Honghan Li, Daiki Matsunaga, Shinji Deguchi
    • Organizer
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 機械学習に基づく細胞力学計測方法の構築2021

    • Author(s)
      李泓翰, 松永大樹, 出口真次
    • Organizer
      メカノバイオ討論会2021
  • [Presentation] 深層学習を用いた細胞力学計測基盤の構築2021

    • Author(s)
      松永 大樹, 李 泓翰, 松井 翼, 出口 真次
    • Organizer
      第33回バイオエンジニアリング講演会

URL: 

Published: 2022-12-28   Modified: 2023-08-01  

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