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2011 Fiscal Year Annual Research Report

哺乳類特異的ゲノム機能の解析

Research Project

Project/Area Number 23221010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

石野 史敏  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (60159754)

Keywords哺乳類特異的遺伝子群 / レトロトランスポゾン / 獲得遺伝子 / 哺乳類の個体発生 / 哺乳類の進化 / ドメスティケーション(イグザプテーション) / ゲノム進化 / 比較ゲノム科学
Research Abstract

哺乳類特異的ゲノム機能の解析として推進した研究の今年度の成果は、有袋類特異的に存在するsirh遺伝子の発見である。これまでPeg10が有袋類と真獣類の両方に存在する以外、Peg11およびsirh3-11は真獣類に特異的に存在することを明らかにしてきたが、今回、有袋類のゲノム解析から、真獣類には存在せず有袋類にのみに存在するsirh12遺伝子を同定した。sirh遺伝子ファミリーは真獣類と有袋類において異なる組み合せで存在しており、この哺乳類の2グループの分岐進化にsirhファミリー遺伝子群が深く関与したことが示唆された。
sirh遺伝子のKOマウス作製を進めた。sirh4については単独のKOマウスの作製は終了した。このマウスには明確な表現型が見られていない。ほぼ同じタンパク質をコードするsirh5およびsirh6遺伝子が残っているためであると考えており、これらをさらに欠失したsirh4-6トリプルノックアウトマウスの作成に取りかかっている。sirh9KOマウスについては、ES細胞のスクリーングを行なっているが、相同組換え体が分離できないことから、異なるコンストラクトによるKOマウス作製を試みる事にした。Peg10 KOマウスの初期胚致死を回復できるレンチウィルスベクターの開発を行なった。これはレンチウィルスにPeg10 ORF1のみまたはPeg10 ORF1-2融合タンパク質のどちらかをコードするDNA断片を組み込んだもので、胞胚期に感染させることにより胎盤でのPeg10の発現を行なわせるものである。これまでのところORF1のみでは致死性の回復はみられていないため、ORF2部分が必須であると考えて実験を進めている。Peg11 PatKOマウスおよびMatKOマウスの示す、新生児致死の原因を解明するために新生児の呼吸、血液、肺や筋肉等の形態を解析したが、これまで明確な異常はみられていない。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

哺乳類特異的遺伝子群としてsirhファミリー遺伝子だけでなく、PNMAファミリー遺伝子に関しても真獣類と有袋類における解析を進め、この2群のファミリーが哺乳類の分岐に大きく関わる遺伝子群である事を示唆する結果を得た。ノックアウトマウスによる機能解析は、sirh4-6のトリプルノックアウトを作るのに時間がかかるのは当初より計算済みである。

Strategy for Future Research Activity

sirh9KOに関してはESのスクリーニング系から再度やり直す必要がある。これに関しては新しいコンストラクトを準備した。Peg11PatKOおよびMatKOの新生児致死の原因解明のため、新生児における異常を解析しているが、これまで報告して来たように胎盤での機能不全は明らかである。そのため新生児致死における胎盤機能の関与という面から再度見直す必要があるかもしれない。

  • Research Products

    (28 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (20 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Identification of SIRH12, a retrotransposon-derived gene specific to marsupial mammals2011

    • Author(s)
      Ono R, et al.
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 18 Pages: 211-219

    • DOI

      doi:10.1093/dnares/dsr012 PMID:21636603

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Intracytoplasmic sperm injection induces transcriptome pertur bation without any transgenerational effect2011

    • Author(s)
      Kohda T, et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 410 Pages: 282-288

    • DOI

      PMID:21658372

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterisation of marsupial PHLDA2 reveals eutherian specific acquisition of imprinting2011

    • Author(s)
      Suzuki S, et al.
    • Journal Title

      BMC Evol Biol

      Volume: 118 Pages: 244

    • DOI

      PMID:21658372

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNAi-mediated knockdown of Xist can rescue the impaired postimplantation development of cloned mouse embryos2011

    • Author(s)
      Matoba, et al.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U.S.A.

      Volume: 108 Pages: 20621-20626

    • DOI

      PMID:22065773

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The evolution of mammalian genomic imprinting was accomp anied by the acquisition of novel CpG islands2011

    • Author(s)
      Suzuki S, et al.
    • Journal Title

      Genome Biol Evol

      Volume: 3 Pages: 1276-1283

    • DOI

      PMID:22016334

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene expression profile normalization in cloned mice by trich ostatin A treatment2011

    • Author(s)
      Kohda T, et al.
    • Journal Title

      Cell Reprogram

      Volume: 14 Pages: 45-55

    • DOI

      PMID:22257163

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Contribution of Retrotransposons to Evolution of Genomic Imprinting and Placentation in Mammals2012

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino, 他
    • Organizer
      The 8^<th> Okazaki Bioloby Conference "Speciation and Adaptation II-Environment and Epigenetics-"
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center (Okazaki, Aichi)(招待講演)
    • Year and Date
      20120318-20120323
  • [Presentation] Epigenetic Regulation of Somatic Cell Cloning and Embryo Manipulation2012

    • Author(s)
      Takashi Kohda, 他
    • Organizer
      The 8^<th> Okazaki Bioloby Conference "Speciation and Adaptation II-Environment and Epigenetics-"
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center (Okazaki, Aichi)
    • Year and Date
      20120318-20120323
  • [Presentation] Role of domesticated genes fromretrotransposons in mammalian evolution2011

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino, 他
    • Organizer
      The 34th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Symposium "Mobile elements and its biological functions"
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama, Yokohama(招待講演)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] レトロトランスポゾン由来の遺伝子Sirh7 KOマウスの胎盤の解析2011

    • Author(s)
      成瀬美衣, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Sushi-ishiレトロトランスポゾン由来の遺伝子Sirh3の機能解析2011

    • Author(s)
      入江将仁, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] マイクロアレイ解析のためのcDNA増幅法の改良2011

    • Author(s)
      及川真実, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Identification of PNMA-MS1, a retrotransopson-derived gene specific to marsupial mammals2011

    • Author(s)
      Sawa Iwasaki, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 成体体細胞におけるインプリント領域のDNAメチル化解析2011

    • Author(s)
      山口佑季, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 胎児への低栄養暴露が与える遺伝子発現への影響2011

    • Author(s)
      小野由美子, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Transcriptome perturbation by intracytospermatic sperm injection in the mouse2011

    • Author(s)
      Takashi Kohda, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Identification of SIHR12, a retrotransposon-derived gene specific to marsupial mammals2011

    • Author(s)
      Ryuichi Ono, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 新規インプリンティング遺伝子スクリーニング方法の開発2011

    • Author(s)
      高橋沙央里, 他
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Eutheria-specific UTF1 gene is critical for the placental growth2011

    • Author(s)
      Masazumi Nishimoto
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Retrotransposon-derived genes in mammalian development and evolution2011

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      From Early Universe to Evolution of Life, Germany-Japan Round Table
    • Place of Presentation
      Heidelberg University, Germany(招待講演)
    • Year and Date
      20111201-20111203
  • [Presentation] Evolution of viviparity and genomic imprinting in mammals by retrot ransposons2011

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino, Tomoko Kaneko-Ishino
    • Organizer
      15^<th> Evolutionary Biology Meeting in Marseilles
    • Place of Presentation
      Marseilles, France(招待講演)
    • Year and Date
      20110927-20110930
  • [Presentation] Genomic impirinting status of retrotransposon-derived PNMA family genes2011

    • Author(s)
      Sawa Iwasaki, 他
    • Organizer
      ICC on Genomic Imprinting and Beyond 2011
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      20110921-20110923
  • [Presentation] レトロトランスポゾン由来の哺乳類特異的遺伝子群2011

    • Author(s)
      石野史敏, 他
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会シンポジウム「転移因子の新たな機能と制御」
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] Role of retrotransposons in mammalian evolution-Domesticated genes for mammalian-specific functions-2011

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino, 他
    • Organizer
      US-Japan Conference : Inflammation, Diabetes and Cancer
    • Place of Presentation
      Beckman Research Institute of City of Hope, California, USA
    • Year and Date
      2011-08-04
  • [Presentation] 哺乳類の個体発生におけるエピジェネティクスーゲノムインプリンティングと体細胞クローンについて2011

    • Author(s)
      石野史敏
    • Organizer
      第25回環境ホルモン学会-エピジェネティクスから探る発生から疾患までの制御-
    • Place of Presentation
      東京大学山上会議所(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-16
  • [Presentation] Evolution of genomic imprinting in mammals2011

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino, 他
    • Organizer
      Symposium "On the critical issues in EvoDevo", 44th JSDB Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Okinawa Convention Center (Okinawa)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-05-21
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/epgn/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] クローン動物の作出方法2011

    • Inventor(s)
      小倉、石野、幸田, 他
    • Industrial Property Rights Holder
      理研、岩手大、東京医科歯科大
    • Industrial Property Number
      PCT国際出願PCT/JP2011/070062
    • Filing Date
      2011-09-02
    • Overseas

URL: 

Published: 2013-06-26  

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