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2012 Fiscal Year Annual Research Report

哺乳類特異的ゲノム機能の解析

Research Project

Project/Area Number 23221010
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

石野 史敏  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (60159754)

Project Period (FY) 2011-05-31 – 2016-03-31
Keywords哺乳類特異的ゲノム機能 / 哺乳類特異的遺伝子 / レトロトランスポゾン / 個体発生 / 系統発生 / ゲノムインプリンティング / 能動的脱メチル化 / リプログラミング
Research Abstract

本研究課題の「哺乳類特異的ゲノム機能」では、1)哺乳類特異的遺伝子の機能2)哺乳類特異的エピジェネティック機構であるゲノムインプリンティングを取り上げ、具体的な研究内容としては、レトロトランスポゾンに由来する哺乳類特異的遺伝子であるPeg10, Peg11/Rtl1, Sirh4-6、Sirh9 の生物学的機能の解明、ゲノムインプリンティングの記憶のリプログラミングにおける脱メチル化の解析を推進している。解析は順調に進んでおり、Peg11/Rtl1については、これまで報告した胎盤の血管内皮細胞の維持機能だけでなく、胎児側の血管系の保持にも重要であり、これが胎児期中期致死、新生児期致死などの原因であることを示唆する結果を得ている。ヒトPEG11/RTL1は染色体14番の父親性2倍体、母親性2倍体症候群の原因遺伝子であり、今回の結果は、PEG11/RTL1をターゲットとした治療戦略につながると考えている。Sirh9 については新しいコンストラクトが完成し、KOマウス作製が進んでいる。哺乳類の発生機構には、DNAメチル化と脱メチル化によるエピジェネティック制御が重要である。しかし、脱メチル化が能動的なものか、受動的に起きるものかという議論に決着はついていない。われわれの解析からは、受精直後の雄性前核の脱メチル化は、メチルシトシンがヒドロキシメチルシトシンへ変換された後は、DNA複製に従った受動的メチル化が起きている可能性が高いことが明らかになった。一方で、始原生殖細胞におけるゲノムインプリンティング記憶の消去過程では、DNA複製によるものとよらない両者の脱メチル化反応が進んでいることが明らかに出来た。これはin vivo, in vitroを問わず、能動的脱メチル化を実証した初めてのものである。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

レトロトランスポゾン由来の遺伝子の解析からは新しい知見が得られており、期間中にこれらの機能に関する新しい概念が提出できると考えている。能動的脱メチル化を初めて検出できたことは大きな成果であり、期間中にその詳細な機構まで迫りたい。

Strategy for Future Research Activity

機能をもたらしたかを明らかにして行く。Sirh4-6、Sirh9に関してはノックアウトマウスの解析を主とした解析から、どのような生命現象に関わっているかを明らかにしたい。能動的脱メチル化が存在することを実証できたのは大きな成果であるが、この系のin vitro化にはいまだ成功していない。これは非常に難しい問題であるため、この試みを続けるとともに、実験上は非常に大変なセッティングとなるがin vivoの系でどこまで詳細な解析データを出すことを並行して進める。

  • Research Products

    (29 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (23 results) (of which Invited: 10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] RNAi-mediated Knockdown of Xist Does Not Rescue the Impaired Development of Female Cloned Mouse Embryos.2013

    • Author(s)
      Oikawa M.
    • Journal Title

      J Reprod Dev

      Volume: in press Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Successful serial recloning in the mouse over multiple generations.2013

    • Author(s)
      Wakayama S.
    • Journal Title

      Cell Stem Cell

      Volume: 12 Pages: 293-297

    • DOI

      10.1016/j.stem.2013.01.005.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The role of genes domesticated from LTR retrotransposons and retroviruses in mammals.2012

    • Author(s)
      Kaneko-Ishino T.
    • Journal Title

      Frontiers Microbiol

      Volume: 3 Pages: Article262

    • DOI

      10.3389/fmicb.2012.00262

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Embryo manipulation via assisted reproductive technology and epigenetic asymmetry in mammalian early development.2012

    • Author(s)
      Kohda T.
    • Journal Title

      Phillos Trans R Soc Lond B Biol Sci

      Volume: 368 Pages: 20120353

    • DOI

      10.1098/rstb.2012.0353.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolution of viviparity and genomic imprinting in mammals by retrotransposons.2012

    • Author(s)
      Kaneko-Ishino T.
    • Journal Title

      In Evolutionary Biology: Mechanisms and Trends (ed. Pontarotti, P.)

      Volume: in press Pages: pp.265-282

  • [Presentation] Evolution of mammalian viviparity and placentation by exaptation of LTR retrotransposons.2013

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      CDB Symposium 2013 -The Making of a Vertebrate-
    • Place of Presentation
      RIKEN CDB, Kobe
    • Year and Date
      20130304-20130306
    • Invited
  • [Presentation] 顕微授精によって最初に誘導される遺伝子発現調節の変化2012

    • Author(s)
      幸田尚
    • Organizer
      ワークショップ「有性生殖におけるゲノム・遺伝子相関」第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 哺乳類特異的レトロトランスポゾン獲得による胎生進化2012

    • Author(s)
      小野竜一
    • Organizer
      ワークショップ「分化・再生からゲノム進化まで ― その多様なメカニズム」第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 哺乳類で新しく獲得された遺伝子Sirh7 と哺乳類の胎盤進化2012

    • Author(s)
      成瀬美衣
    • Organizer
      ワークショップ「発生と進化に関わるトランスポゾン由来のDNA」第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] マウス着床前胚において雌のみで発現するsmall RNAの探索2012

    • Author(s)
      相馬未来
    • Organizer
      ワークショップ「脊椎動物の初期発生研究における新たな展開」第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 真獣類および有袋類特異的なレトロトランスポゾン由来の遺伝子群PNAMファミリーとインプリンティングの解析2012

    • Author(s)
      岩崎佐和
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] Sushi-ishiレトロトランスポゾン由来の遺伝子Sirh3の機能解析2012

    • Author(s)
      入江将仁
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] なぜトランスポゾン由来の真獣類特異的遺伝子群Sirh4, Sirh5, Sirh6は複数コピーで存在するのか?2012

    • Author(s)
      石井雅之
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 低栄養が胎仔期に与える遺伝子発現への影響2012

    • Author(s)
      小野由美子
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] Ex vivo、in vitro培養法による始原生殖細胞のDMR脱メチル化の解析2012

    • Author(s)
      山口佑季
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 真獣類特異的遺伝子Peg11の胎盤における役割と成長への影響2012

    • Author(s)
      北澤萌恵
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 核移植技術によるXist遺伝子のインプリント確立の解析2012

    • Author(s)
      及川真実
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] 真獣類特異的遺伝子UTF1は胎盤の増殖を促進する2012

    • Author(s)
      西本正純
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] マウスにおける雌性単為発生胚由来1倍体ES細胞の樹立と特性解析2012

    • Author(s)
      高橋沙央里
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場、福岡
    • Year and Date
      20121211-20121214
  • [Presentation] Evolution of Genomic Imprinting, Viviparity and Placentation in Mammals Suggest Critical Contribution of LTR-Retrotransposons and/or Exogenous DNAs.2012

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      Quantitative Evolutionary and Comparative Genomics 2012
    • Place of Presentation
      Okinawa Inst Sci Tech, Okinawa
    • Year and Date
      20120806-20120810
    • Invited
  • [Presentation] Functions of mammalian-specific SIRH family genes- LTR retrotransposon-derived genes in mammalian reproducion system-2012

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      Fujihara Seminar 2012, A New Horizon of Retroposon Research
    • Place of Presentation
      Shiran-Kaikan, Kyoto
    • Year and Date
      20120731-20120803
    • Invited
  • [Presentation] Role of mammalian-specific retrotransposon-derived genes in mammalian reproductive system.2012

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      The 2nd SKLRB Symposia in Reproductive Biology
    • Place of Presentation
      Beijing Friendship Hotel, Beijing, China
    • Year and Date
      20120506-20120510
    • Invited
  • [Presentation] ゲノムインプリンティングから見えてくるもの ―哺乳類の個体発生と進化―2012

    • Author(s)
      石野史敏
    • Organizer
      日本分子生物学会第12回春季シンポジウム トランスレ―ショナル分子生物学 ~新世代への知の継承~
    • Place of Presentation
      石和温泉、山梨
    • Year and Date
      20120425-20120425
    • Invited
  • [Presentation] Contribution of LTR retrotransposons to evolution of mammals: a novel view from comparative genomics.

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      The 11th Surugadai Symposium, Medical Research Institiute, TMDU
    • Place of Presentation
      Tokyo Med and Dent Univ, Tokyo
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム情報から哺乳類の進化を読み解く

    • Author(s)
      石野史敏
    • Organizer
      第11回知の拠点セミナー「ゲノム情報の読み取りから難治疾患に挑む」
    • Place of Presentation
      京都大学東京オフィス、品川インターシティ
    • Invited
  • [Presentation] LTRレトロトランスポゾン由来の新規獲得遺伝子とその哺乳類特異的機能について

    • Author(s)
      石野史敏
    • Organizer
      第2回 Tokyo Vertebrate Morphology Meeting
    • Place of Presentation
      東京慈恵医大、東京
    • Invited
  • [Presentation] Roles of LTR retrotransposon- derived genes in mammalian evolution and diversification.

    • Author(s)
      Fumitoshi Ishino
    • Organizer
      2013 International Symposium on Frontier Agriscience and Technology –Insight into Biological Mechanisms, Resources and Availability-
    • Place of Presentation
      Shinshu Univ., Ina, Nagano
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳類特異的形質の獲得 ―進化の中立説と自然選択説―

    • Author(s)
      石野史敏
    • Organizer
      岡田清孝先生退職記念シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスホール、岡崎
    • Invited
  • [Remarks] 石野研ホームページ

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/epgn/index.html

URL: 

Published: 2014-07-24  

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