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2014 Fiscal Year Annual Research Report

生体高分子の高次構造と機能制御のための高分子材料設計

Research Project

Project/Area Number 23240074
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

丸山 厚  東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (40190566)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2015-03-31
Keywordsカチオン性共重合体 / 核酸酵素 / コアセルベート / DNA解析
Outline of Annual Research Achievements

配列特異的なRNA切断活性をもつDNAzymeは、その特徴から様々な生物工学的応用が期待されており、特定の配列の核酸存在下でのみDNAzyme活性を発現するmulticomponent deoxyribozyme (MNAzyme)を用いたウイルス核酸の検出法も提案されている。しかし、DNAzymeは一般にターンオーバー効率が低く、その改善が必要と考えられる。ターンオーバー効率を高めるためには、切断された核酸断片のDNAzymeからの解離とDNAzymeへの基質核酸の結合を促す必要がある。我々は、カチオン性グラフト共重合体であるPoly(L-lysine)-graft-dextran (PLL-g-Dex)が、DNAと静電的相互作用し、核酸間の静電反発を軽減し、核酸のハイブリダイゼーションを促進することを報告してきた。そこで、PLL-g-Dexの添加により、DNAzymeのターンオーバー速度が向上し、それに伴う反応速度の向上が見込まれるのではないかと考え検討した。その結果、共重合体は、マルチターンオーバー条件下で顕著に反応を促進することがわかった。一方、核酸間のハイブリッド形成を高める上では、核酸の濃度を高める工夫も有効であると考えられる。我々はカチオン性基を有するpoly(allylamine)-co-(allylurea) (PAU)が生理的条件下で、液滴状のコアセルベートを形成することを報告してきた。PAUを加えることで、核酸とPAUの静電相互作用により核酸をコアセルベートに濃縮し、DNAzyme反応の速度向上が可能になると考えた。実際、PAUコアセルベートによる核酸の濃縮が可能で有り、核酸検出の感度を向上できうることがわかった。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] MNAzyme-catalysed nucleic acid detection enhanced by a cationic copolymer2015

    • Author(s)
      J. Gao, N. Shimada, A. Maruyama
    • Journal Title

      Biomater. Sci.

      Volume: 3 Pages: 716-720

    • DOI

      10.1039/C4BM00449C

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Triple helix conformation-specific blinking of Cy3 in DNA2015

    • Author(s)
      K. Kawai, A. Maruyama
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 51 Pages: 4861-4864

    • DOI

      10.1039/C5CC00607D

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Enhancement of deoxyribozyme activity by cationic copolymers2015

    • Author(s)
      J. Gao, N. Shimada, A. Maruyama
    • Journal Title

      Biomater. Sci

      Volume: 3 Pages: 308-316

    • DOI

      10.1039/C4BM00256C

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Blinking Triggered by The change in the solvent accessibility of a fluorescent molecule2014

    • Author(s)
      K. Kawai, T. Koshino, A. Maruyama, T. Majima
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 50 Pages: 8743-8746

    • DOI

      10.1039/c4cc00377b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 合成高分子による生体高分子(核酸、ペプチド、脂質)の構造・機能操作2014

    • Author(s)
      丸山厚
    • Organizer
      高知大学教育研究部セミナー
    • Place of Presentation
      高知大学教育研究部
    • Year and Date
      2014-09-12
    • Invited
  • [Presentation] 高分子ナノ会合体で生体高分子の構造と機能を制御する2014

    • Author(s)
      丸山厚
    • Organizer
      平成26年未踏科学サマー道場
    • Place of Presentation
      湘南国際村センター、三浦
    • Year and Date
      2014-08-30
    • Invited
  • [Presentation] Polymer materials to control assembly and functions of biopolymers: DNA, peptide and lipid,2014

    • Author(s)
      A. Maruyama
    • Organizer
      The 2nd International Symposium on Polymer Ecomaterials PEM 2014
    • Place of Presentation
      Kunming, China
    • Year and Date
      2014-08-22 – 2014-08-26
    • Invited
  • [Presentation] Soluble inter-polyelectrolyte complexes to engineer assemblies and functions of biopolymers2014

    • Author(s)
      A. Maruyama
    • Organizer
      FRONTIERS OF POLYMER COLLOIDS: FROM SYNTHESIS TO MACRO-SCALE AND NANO-SCALE APPLICATIONS
    • Place of Presentation
      Plague, Czech Republic
    • Year and Date
      2014-07-20 – 2014-07-24
  • [Presentation] Enhancement of DNAzyme Activity with Cationic Comb-type Copolymer for Nucleic Acid Detection2014

    • Author(s)
      A. Maruyama
    • Organizer
      The 5th INTERNATIONAL CONFERENCE on the DEVELOPMENT of BIOMEDICAL ENGINEERING in VIETNAM
    • Place of Presentation
      Ho Chi Ming City, Vietnam
    • Year and Date
      2014-06-16 – 2014-06-18
    • Invited
  • [Book] Encyclopedia of Polymeric Nanomaterials2015

    • Author(s)
      J. Gao, A. Maruyama
    • Total Pages
      未定
    • Publisher
      Springer

URL: 

Published: 2016-06-01  

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