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2012 Fiscal Year Annual Research Report

トランスジェニック技術を用いた軟体動物貝殻形成遺伝子の機能解析

Research Project

Project/Area Number 23244101
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

遠藤 一佳  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80251411)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 棚部 一成  東京大学, 総合研究博物館, 研究員 (20108640)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywords貝殻形成 / bmp遺伝子 / レチノイン酸 / 貝殻タンパク質 / 軟体動物 / アコヤガイ / ゲノム / 進化発生学
Research Abstract

今年度は、(1)巻貝における貝殻の巻きのメカニズムの研究、(2)二枚貝における貝殻タンパク質の機能解析、(3)アコヤガイゲノムにコードされている遺伝子の研究を行った。(1)に関しては、dpp遺伝子が笠型の貝殻を持つカサガイでは左右両側で発現するのに対し、右巻きのモノアラガイでは外套膜の右側の、左巻き突然変異体のモノアラガイでは左側の特定の部位でのみ発現していることを明らかにした。さらにリン酸化Smadに対する抗体を用いた解析により、dpp遺伝子産物の受容体も同様に、貝殻の左右性に対応した左右非対称(もしくは左右対称)の働き・発現をしていること、すなわちdppが貝殻の後期発生(成長)において左右非対称な成長を調節している可能性が高いことを明らかにした。また、dppの上流で発現していることが示唆されていたレチノイン酸(RA)経路に関する研究を行い、RA経路が無脊椎動物で機能していることを初めて明らかにするとともに、RA分解酵素(Cyp26)の発現が貝殻形成領域のRA濃度の低下を引き起こすことでengrailed遺伝子を発現させ、貝殻形成を制御している可能性が高いことを明らかにした。(2)に関しては、アコヤガイのゲノム配列をもとに、EF-1alpha遺伝子とGAPDH遺伝子の発現プロモータの単離を試みた。今後、これらの発現プロモータを組み込んだトランスポゾンコンストラクトを用いることで、貝殻タンパク質アスペインの遺伝子ノックダウンの実験を行う。(3)については、アコヤガイゲノムにおいて、初期発生に重要な代表的シグナル分子の4種類のスーパーファミリー(FGF, Hedgehog, Wnt, TGF-beta)と貝殻基質タンパク質をコードする遺伝子の網羅的同定作業を行い、他の動物門のデータと比較することで、これらの遺伝子の進化プロセスを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の予定通り、巻貝類において貝殻の巻きを規定している遺伝子の解析が進んでおり、また、貝殻タンパク質の機能解析を行う二枚貝類のアコヤガイに関してもゲノムのアノテーションを進めることができたため。

Strategy for Future Research Activity

巻貝類に関しては、今後dppをしみ込ませたゲルビーズを用いた遺伝子の機能解析を進め、殻口部の細胞分裂活性と形態形成との定量的関係を探る計画である。二枚貝類に関しては、貝殻基質タンパク質のin vivoでの機能を探るために、トランスポゾンによるノックダウン(RNA干渉)の実験に加え、人工酵素を用いたTALEN法により遺伝子ノックアウトの実験も試みる予定である。

  • Research Products

    (13 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Annotation of the pearl oyster genome2013

    • Author(s)
      Endo, K. and Takeuchi, T.
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Left-right asymmetric expression of dpp in the mantle of gastropods correlates to the asymmetric shell coiling2013

    • Author(s)
      Shimizu, K., Iijima, M., Setiamarga, D., Sarashina, I. Kudoh, T., Asami, T., Gittenberger, E. and Endo, K.
    • Journal Title

      BMC EvoDevo

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An in-silico genomic survey to annotate genes coding for early development-relevant signaling molecules in the pearl oyster Pinctada fucata2013

    • Author(s)
      Setiamarga, D. and 20 others
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Initiating the mollusk genomics annotation community :Toward creating the complete curated gene-set of the Japanese pearl oyster, Pinctada fucata2013

    • Author(s)
      T. Kawashima, T. Takeuchi, R. Koyanagi, S. Kinoshita, H. Endo and K. Endo
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The diversity of shell matrix proteins: genome-wide investigation of the pearl oyster Pinctada fucata2013

    • Author(s)
      H. Miyamoto and 27 others
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 未定 Pages: 未定

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バイオミネラリゼーションと新材料創製2013

    • Author(s)
      遠藤一佳
    • Journal Title

      科学と工業

      Volume: 87 Pages: 1-13

  • [Journal Article] A Comparative Study of the Shell Matrix Protein Aspein in Pterioid Bivalves2012

    • Author(s)
      Isowa, Y., Sarashina, I., Setiamarga, D. H. E., and K. Endo
    • Journal Title

      Journal of Molecular Evolution

      Volume: 75 Pages: 11-18

    • DOI

      10.1007/s00239-012-9514-3

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 巻貝の貝殻形成におけるレチノイン酸経路の役割2012

    • Author(s)
      清水啓介・Rath Bush・遠藤一佳・工藤哲大
    • Organizer
      日本動物学会第83回大会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府)
    • Year and Date
      20120913-20120915
  • [Presentation] 巻貝の貝殻の形態進化におけるDppの役割:貝殻螺旋成長の分子メカニズム2012

    • Author(s)
      清水啓介・Davin HE. Setiamarga・工藤哲大・更科功・遠藤一佳
    • Organizer
      日本進化学会第14回大会
    • Place of Presentation
      首都大学(東京都)
    • Year and Date
      20120821-20120824
  • [Presentation] Molecular mechanisms of shell coiling in gastropods2012

    • Author(s)
      Shimizu K, Sarashina I, Kagi H and Endo K.
    • Organizer
      1st Joint Congress on Evolutionary Biology
    • Place of Presentation
      Ottawa, Canada
    • Year and Date
      20120706-20120710
  • [Presentation] 巻貝の貝殻螺旋成長の分子メカニズム2012

    • Author(s)
      清水啓介・更科功・工藤哲大・遠藤一佳
    • Organizer
      日本古生物学会2012年・年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120629-20120701
  • [Presentation] 巻貝における貝殻の形態進化 ~Evo-Devo から Eco-Evo-Devo へ~

    • Author(s)
      清水啓介・遠藤一佳
    • Organizer
      日本生態学会第60回大会
    • Place of Presentation
      グランシップ静岡(静岡県)
  • [Presentation] 巻貝における貝殻形成の分子メカニズム

    • Author(s)
      清水啓介・遠藤一佳
    • Organizer
      第7回バイオミネラリゼーションワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)

URL: 

Published: 2014-07-24  

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