2013 Fiscal Year Annual Research Report
ポリコム群抑制クロマチン形成におけるCpG配列認識の意義の解明
Project/Area Number |
23249015
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Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
Principal Investigator |
古関 明彦 独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, グループディレクター (40225446)
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Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2016-03-31
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Keywords | CpGアイランド / CXXCモチーフ / SRAドメイン / Cxxc5 / Np95/UHRF1 |
Research Abstract |
CpGアイランド(CGI)は、哺乳類では,転写開始点付近に集中的に局在している。ES細胞を用いたゲノムワイド解析から、1kb以上の長いCGIはDNAメチル化を受けづらく、エピジェネティック制御因子のひとつであるポリコム群による制御を受け易い一方、短いCGI(特に0.5kb以下)は軽度のDNAメチル化を受け、メチル化依存的な制御を受ける。これらの観察は,CGIがエピジェネティック制御のためのプラットフォームとなっていること、そして、その長さやDNAメチル化状態がエピジェネティック制御の選択性を決定する因子となっている可能性を示している。本研究では,CGIがどのように認識されてポリコム群による抑制クロマチンを樹立するのか、CpG配列のメチル化状態を読み取りうる構造であるCXXCモチーフとSRAドメインに焦点を絞った解析を開始した。CXXCモチーフタンパクをコードするCxxc1遺伝子について、ノックアウトマウス、コンディショナルノックアウトES細胞、タンパク複合体の解析を行った。Cxxc1ノックアウトマウスでは、胎生初期に致死となる。それに呼応して、コンディショナルノックアウトES細胞においても、Cxxc1をノックアウトすると細胞増殖が障害された。Cxxc1は発現している遺伝子のプロモーター付近に強く結合する他、発現の有無にかかわらず、エンハンサーとして記載されている領域に結合があることが見出された。また、Cxxc1を強制的に、遺伝子砂漠領域に結合させるとその領域で転写が誘導されることが示された。Cxxc1は、エンハンサー機能と密接にリンクすることが示されてきている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
いずれのプロジェクトについても、当初の予定に従って粛々と進んでいる。
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Strategy for Future Research Activity |
Cxxc1が、ポリコム群によって抑制されている遺伝子群の活性化に寄与するのかを明らかにする。
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[Journal Article] Role of SOX17 in hematopoietic development from human embryonic stem cells.2013
Author(s)
Nakajima-Takagi Y, Osawa M, Oshima M, Takagi H, Miyagi S, Endoh M, Endo TA, Takayama N, Eto K, Toyoda T, Koseki H, Nakauchi H, Iwama A.
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Journal Title
Blood.
Volume: 121
Pages: 447-58
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] KDM2B links the Polycomb Repressive Complex 1 (PRC1) to recognition of CpG islands.2013
Author(s)
Farcas AM, Blackledge NP, Sudbery I, Long HK, McGouran JF, Rose NR, Lee S, Sims D, Cerase A, Sheahan TW, Koseki H, Brockdorff N, Ponting CP, Kessler BM, Klose RJ.
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Journal Title
elife.
Volume: 1
Pages: ―
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Dependence receptor UNC5D mediates nerve growth factor depletion-induced neuroblastoma regression.2013
Author(s)
Zhu Y, Li Y, Haraguchi S, Yu M, Ohira M, Ozaki T, Nakagawa A, Ushijima T, Isogai E, Koseki H, Nakamura Y, Kong C, Mehlen P, Arakawa H, Nakagawara A.
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Journal Title
J Clin Invest.
Volume: 123
Pages: 2935-47
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] CCN3 protein participates in bone regeneration as an inhibitory factor.2013
Author(s)
Matsushita Y, Sakamoto K, Tamamura Y, Shibata Y, Minamizato T, Kihara T, Ito M, Katsube K, Hiraoka S, Koseki H, Harada K, Yamaguchi A.
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Journal Title
J Biol Chem.
Volume: 288
Pages: 19973-85
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] WIP1, a homeostatic regulator of the DNA damage response, is targeted by HIPK2 for phosphorylation and degradation.2013
Author(s)
Choi DW, Na W, Kabir MH, Yi E, Kwon S, Yeom J, Ahn JW, Choi HH, Lee Y, Seo KW, Shin MK, Park SH, Yoo HY, Isono K, Koseki H, Kim ST, Lee C, Kwon YK, Choi CY.
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Journal Title
Mol Cell.
Volume: 51
Pages: 374-85
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] An epigenetic switch is crucial for spermatogonia to exit the undifferentiated state toward a Kit-positive identity.2013
Author(s)
Shirakawa T, Yaman-Deveci R, Tomizawa S, Kamizato Y, Nakajima K, Sone H, Sato Y, Sharif J, Yamashita A, Takada-Horisawa Y, Yoshida S, Ura K, Muto M, Koseki H, Suda T, Ohbo K.
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Journal Title
Development.
Volume: 140
Pages: 3565-76
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Uhrf1-dependent H3K23 ubiquitylation couples maintenance DNA methylation and replication.2013
Author(s)
Nishiyama A, Yamaguchi L, Sharif J, Johmura Y, Kawamura T, Nakanishi K, Shimamura S, Arita K, Kodama T, Ishikawa F, Koseki H, Nakanishi M.
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Journal Title
Nature.
Volume: 502
Pages: 249-253
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] A novel de novo point mutation of the OCT-binding site in the IGF2/H19-imprinting control region in a Beckwith-Wiedemann syndrome patient.2013
Author(s)
Higashimoto K, Jozaki K, Kosho T, Matsubara K, Fuke T, Yamada D, Yatsuki H, Maeda T, Ohtsuka Y, Nishioka K, Joh K, Koseki H, Ogata T, Soejima H.
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Journal Title
Clin Genet.
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed
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