2013 Fiscal Year Annual Research Report
機能性RNA統合解析による日米欧の胃・大腸発癌の分子疫学的解明と臨床応用・癌予防
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23300366
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Research Institution | St. Marianna University School of Medicine |
Principal Investigator |
山本 博幸 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 准教授 (40332910)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
能正 勝彦 札幌医科大学, 医学部, 講師 (10597339)
前畑 忠輝 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 助教 (90534199)
渡邊 嘉行 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 講師 (90329243)
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Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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Keywords | 機能性RNA / 消化器癌 / 日米欧比較 / 分子疫学 / SNP |
Research Abstract |
GoldenGate Assay等を用いて明らかにした日米欧の胃癌、大腸癌におけるDNAメチル化プロファイルつまりDNA methylome(fingerprint)の詳細データからさらに個々の遺伝子メチル化を解析し、その重要性を明らかにした。 microRNA(miRNA)microarrayを用いて解析し明らかにした胃癌および大腸癌の癌組織、隣接非癌組織におけるmiRNA発現プロファイルの詳細から、候補遺伝子を絞り詳細に解析を進め、個々の重要なmiRNA発現変化を明らかにした。例えば、胃癌では、多発胃癌の背景胃粘膜におけるmiR-34b/cの高メチル化を明らかにし、さらに胃癌異時性再発のマーカーとしての有用性を明らかにした。大腸癌では、miR-31がBRAF遺伝子変異群で野生型の群と比較して発現亢進しているmiRNAとして同定された。miR-31は大腸癌の不良な予後とも相関が認められたことから分子診断・標的治療の新規バイオマーカーとして期待される。 胃癌および大腸癌の癌組織および癌細胞株において、癌関連遺伝子の3’-UTR、5’-UTRその他non-coding DNA領域の変異解析を網羅的に行い、複数の遺伝子変異を明らかにした。変異を認めた遺伝子に関して、変異とmiRNAおよびその他の機序による発現調節異常やmRNA安定性との関連などを機能解析により明らかにした。 miRNA関連SNP、CNVに関して、pri-miR、pre-miR、miRNAプロセシングに関わる各遺伝子、さらに標的と なる癌関連遺伝子のmiRNA結合配列等のSNPの関連を網羅的に明らかにした。これらSNP、CNVと上記で明らかにしたmiRNA発現変化や癌関連遺伝子の発現変化等との関連を明らかにした。
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Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Association of microRNA-31 with BRAF mutation, colorectal cancer survival and serrated pathway2014
Author(s)
Nosho K, Igarashi H, Nojima M, Ito M, Maruyama R, Yoshii S, Naito T, Sukawa Y, Mikami M, Sumioka W, Yamamoto E, Kurokawa S, Adachi Y, Takahashi H, Okuda H, Kusumi T, Hosokawa M, Fujita M, Hasegawa T, Okita K, Hirata K, Suzuki H, Yamamoto H, Shinomura Y
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Journal Title
Carcinogenesis
Volume: 35
Pages: 776-783
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] An updated review of gastric cancer in the next-generation sequencing era: Insights from bench to bedside and vice versa2014
Author(s)
Yamamoto H, Watanabe Y, Maehata T, Morita R, Yoshida Y, Oikawa R, Ishigooka S, Ozawa SI, Matsuo Y, Hosoya K, Yamashita M, Taniguchi H, Nosho K, Suzuki H, Yasuda H, Shinomura Y, Itoh F
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Journal Title
World J Gastroenterol
Volume: 20
Pages: 3927-3937
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aberrant methylation of microRNA-34b/c is a predictive marker of metachronous gastric cancer risk2014
Author(s)
Suzuki R, Yamamoto E, Nojima M, Maruyama R, Yamano HO, Yoshikawa K, Kimura T, Harada T, Ashida M, Niinuma T, Sato A, Nosho K, Yamamoto H, Kai M, Sugai T, Imai K, Suzuki H, Shinomura Y
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Journal Title
J Gastroenterol
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
Peer Reviewed
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[Journal Article] Association between genomic alterations and metastatic behavior of colorectal cancer identified by array-based comparative genomic hybridization2013
Author(s)
Sawada T1, Yamamoto E, Suzuki H, Nojima M, Maruyama R, Shioi Y, Akasaka R, Kamimae S, Harada T, Ashida M, Kai M, Adachi Y, Yamamoto H, Imai K, Toyota M, Itoh F, Sugai T
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Journal Title
Genes Chromosomes Cancer
Volume: 52
Pages: 140-149
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Brush border myosin Ia inactivation in gastric but not endometrial tumors2013
Author(s)
Mazzolini R1, Rodrigues P, Bazzocco S, Dopeso H, Ferreira AM, Mateo-Lozano S, Andretta E, Woerner SM, Alazzouzi H, Landolfi S, Hernandez-Losa J, Macaya I, Suzuki H, Ramon y Cajal S, Mooseker MS, Mariadason JM, Gebert J, Hofstra RM, Reventos J, Yamamoto H, Schwartz S Jr, Arango D
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Journal Title
Int J Cancer
Volume: 132
Pages: 1790-1799
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Associations among the HER2 signal-related factors thought to be predictive factors for the effectiveness of trastuzumab therapy in gastric cancer2013
Author(s)
Yamamoto H, Sukawa Y, Nakazawa M, Sumioka W, Watanabe Y, Maehata T, Morita R, Yoshida Y, Ishigooka S, Ozawa S, Matsuo Y, Hosoya K, Yamashita M, Taniguchi H, Nosho K, Suzuki H, Yasuda H, Imai K, Shinomura Y, Itoh F
Organizer
The 4th JCA-AACR Special Joint Conference
Place of Presentation
Tokyo Bay Maihama Hotel Club & Resorts, Urayasu, Japan
Year and Date
20131216-20131218
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[Presentation] Analysis of the genome-wide DNA methylation level in colorectal adenoma for detecting the precursor lesion of line extreme hypomethylated colorectal cancer2013
Author(s)
Nosho K, Igarashi H, Ito M, Naito T, Mitsuhashi K, Sukawa Y, Nakazawa M, Sumioka W, Yoshii S, Fujita M, Yamamoto E, Adachi Y, Baba Y, Nojima M, Maruyama R, Suzuki H, Yamamoto H, Imai K, Shinomura Y
Organizer
Digestive Disease Week 2013
Place of Presentation
Orange County Convention Center, Orlando, USA
Year and Date
20130518-20130521
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[Presentation] Characteristics of and associations among the HER2 signal-related factors thought to be predictive factors for the effectiveness of trastuzumab therapy in gastric cancer2013
Author(s)
Ito M, Sukawa Y, Nosho K, Igarashi H, Naito T, Kunimoto H, Mitsuhashi K, Nakazawa M, Sumioka W, Adachi Y, Mikami M, Kawayama M, Suzuki H, Yamamoto H, Shinomura Y
Organizer
Digestive Disease Week 2013
Place of Presentation
Orange County Convention Center, Orlando, USA
Year and Date
20130518-20130521
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[Presentation] Analysis of the insulin-like growth factor 2 (IGF2) differentially methylated region (DMR) 0 hypomethylation in carcinogenesis of colorectal serrated lesions2013
Author(s)
Nosho K, Yoshii S, Baba Y, Igarashi H, Ito M, Naito T, Sukawa Y, Mikami M, Takahashi T, Nakazawa M, Sumioka W, Takahashi H, Hosokawa M, Suzuki H, Adachi Y, Yamamoto H, Imai K, Ogino S, Shinomura Y
Organizer
Digestive Disease Week 2013
Place of Presentation
Orange County Convention Center, Orlando, USA
Year and Date
20130518-20130521
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[Presentation] Association between EBV infection and HER2 expression in gastric cancer2013
Author(s)
Mitsuhashi K, Sukawa Y, Nakazawa M, Naito T, Ito M, Igarashi H, Kunimoto H, Nosho K, Adachi Y, Yamamoto H, Takada K, Shinomura Y
Organizer
Digestive Disease Week 2013
Place of Presentation
Orange County Convention Center, Orlando, USA
Year and Date
20130518-20130521
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[Presentation] Analysis of the molecular features of elderly colorectal cancer patients using a large Japanese cohort study and the lmportance of sessile serrated adenoma/polyp (SSA/P) as a precursor lesion2013
Author(s)
Igarashi H, Nosho K, Ito M, Naito T, Mitsuhashi K, Sukawa Y, Mikami M, Yamamoto E, Nakazawa M, Sumioka W, Okuda H, Takahashi H, Kusumi T, Hosokawa M, Nojima M, Okita K, Suzuki H, Yamamoto H, Shinomura Y
Organizer
Digestive Disease Week 2013
Place of Presentation
Orange County Convention Center, Orlando, USA
Year and Date
20130518-20130521
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