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2011 Fiscal Year Annual Research Report

効率的除去を目指した新奇硫化カルボニル分解酵素の高機能化

Research Project

Project/Area Number 23310051
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

片山 葉子  東京農工大学, 大学院・農学研究院, 教授 (90165415)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 尾高 雅文  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (20224248)
野口 恵一  東京農工大学, 学術支援総合研究センター, 准教授 (00251588)
Keywords硫化カルボニル / 致死性有毒ガス / 酵素分解処理 / 分子育種 / 結晶構造解析
Research Abstract

硫化カルボニル(COS)を分解する新奇酵素COSaseの、触媒反応機構の解明およびその効率化を目的に、Thiobacillus thioparus THI115株から調製したCOSaseの分子育種、および新規COS分解微生物の探索を行ない、以下の成果を得た。【COSaseの分子育種】基質認識や触媒反応に関わるアミノ酸残基を特定するために、COSase単独ならびに基質類似化合物複合体のX線結晶構造解析を行ない、その立体構造情報を既知のCAの立体構造と比較することで、1)基質の結合および2)触媒サイクルに関与すると予想されるアミノ酸残基、3)基質認識に関与すると思われる基質系路を推定した。1)と3)の変異体を作成し触媒活性への影響を調べたところ、His-tagを用いると酵素活性は見られなかった。この結晶構造解析の結果、tagが基質系路入口近くに存在する可能性が示され、基質認識での重要性が支持された。His-tagにかわりGST-tagの融合タンパク質を得た。今後、tag除去酵素による活性評価を行なう。
【新規COS分解微生物の探索】森林土壌を中心に細菌および真菌を分離し、その中から高いCOS分解活性を有するものを選抜した。その結果、これまで調査のほとんど行なわれていなかった真菌においても、30 ppm COSを2時間以内で分解することが可能な、複数の菌株を見出すことができた。ITS領域にもとづく近縁種検索の結果、これらの分解真菌は特定の分類群への著しい偏りはなく、細菌の場合と同様にCOS分解活性は真菌の中に広く分布していることが予想された。これらの菌株の中にはCOSaseが分離されたT. thioparus THI115株のように、ppmvからpptvレベルのきわめて広範囲の濃度に対して分解活性を示すものが含まれていた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度は節電の影響で、COSaseの良質な結晶調製の条件検討などに十分な時間を割けなかったが、本年度は時間配分を工夫する事で迅速化を図る計画である。その他については、突然変異体の作成が進んでおり、その活性評価についても見通しが得られている事、分解菌の分離についても順調に作業が進んでいる事から、上記の達成度とした。

Strategy for Future Research Activity

結晶構造解析結果をもとにした変異体の作成を継続し、COSaseの活性向上と安定化に関わる情報を得る事に努める。また、分解微生物については高濃度COSの発生が見られる火山ガス噴出孔周辺の土壌やバイオフィルムなどについても採取源を拡大することで、より高い分解活性を保持した微生物の取得を試みる。

  • Research Products

    (17 results)

All 2012 2011

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Vertical distribution of carbonyl sulfide at Mt.Fuji, Japan2012

    • Author(s)
      Hiromi Kato
    • Journal Title

      Water, Air, and Soil Pollution

      Volume: 223 Pages: 159-167

    • DOI

      DOI 10.1007/s11270-011-0847-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetic assessment of culture collection strains of Thiobacillus thioparus, and definitive 16S rRNA gene sequences for T.thioparus, T.denitrificans, and Halothiobacillus neapolitanus2012

    • Author(s)
      Rich Boden
    • Journal Title

      Archives of Microbiology

      Volume: 194 Pages: 187-195

    • DOI

      DOI 10.1007/s00203-011-0747-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mycobacteria isolated from Angkor monument sandstones grow chemolithoautotrophically by oxidizing elemental sulfur2011

    • Author(s)
      Kusumi A, Li X, Katayama Y
    • Journal Title

      Front Microbiol

      Volume: 2 Pages: 104

    • DOI

      10.3389/fmicb.2011.00104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystalline structure of polyethylene containing vinylene units in the main chain2011

    • Author(s)
      Naofumi Naga
    • Journal Title

      Polymer

      Volume: 52 Pages: 4857-4866

    • DOI

      DOI 10.1016/j.polymer.2011.08.058

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rhodium-catalyzed olefin isomerization/enantioselective intramolecular Alder-Enereaction cascade2011

    • Author(s)
      Ryuichi Okamoto
    • Journal Title

      Org.Lett.

      Volume: 13 Pages: 4894-4897

    • DOI

      DOI 10.1021/ol201986e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Properties and crystal structure of methylenetetrahydrofolate reductase from Thermus thermophilus HB82011

    • Author(s)
      Sayaka Igari
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 6 Pages: e23716

    • DOI

      DOI 10.1371/journal.pone.0023716

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Linking conformational flexibility and kinetics : catalytic 1,4-type friedel-crafts reactions of phenols utilizing 1,3-diamine-tethered guanidine/bisthiourea organocatalysts2011

    • Author(s)
      Yoshihiro Sohtome
    • Journal Title

      Chem.Asian J.

      Volume: 6 Pages: 2463-2470

    • DOI

      DOI 10.1002/asia.201100363

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Osteoclast-forming suppressing compounds, gargalols A, B, and C, from the edible mushroom grifola gargal2011

    • Author(s)
      Jing Wu
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 6576-6581

    • DOI

      DOI 10.1016/j.tet.201 1.05.091

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rhodium-catalyzed highly enantioselective cyclizations of γ-alkynylaldehydes with acyl phosphonates : ligand and substituent-controUed C-P or C-H bond cleavage2011

    • Author(s)
      Kengo Masuda
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: 133 Pages: 6918-6921

    • DOI

      DOI 10.1021/ja201337x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rhodium-catalyzed asymmetric formal olefination or cycloaddition : 1,3-dicarbonyl compounds reacting with 1,6-diynes or 1,6-enynes2011

    • Author(s)
      Takeshi Suda
    • Journal Title

      Angew.Chem.Int.Ed.

      Volume: 50 Pages: 4475-4479

    • DOI

      DOI 10.1002/anie.201007727

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Bacterial community analyses of biofilms on the deteriorated sandstone of Bayon temple of Angkor monuments in Cambodia2011

    • Author(s)
      Asako Kusumi, Xian-Shu Li, Yu Osuga, Ji-Dong Gu, Yoko Katayama
    • Organizer
      15^<th> International Biodeterioration and Biodegradation Symposium
    • Place of Presentation
      Univ.of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Austria
    • Year and Date
      20110919-20110924
  • [Presentation] Gene cloning of enzyme thiocyanate hydrolase of strain THI2012011

    • Author(s)
      Adeeba Hussain, Y.Katayama, Y.Matsushita
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan. Sapporo Convention Center
    • Year and Date
      20110906-20110910
  • [Presentation] Thiobacillus thioparus THI115の硫化カルボニル(COS)加水分解酵素のCOS分解特性およびカルボニックアンヒドラーゼ(CA)との比較2011

    • Author(s)
      小川貴弘、野口恵一、尾高雅文、養王田正文、片山葉子
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生講堂
    • Year and Date
      20110620-20110621
  • [Presentation] 富士山頂で採取した自由対流圏を長距離輸送されたバイオエアロゾルに含まれる微生物の特徴2011

    • Author(s)
      忠地駿、久住朝子、富田新、大須賀雄、小林拓、片山葉子
    • Organizer
      第27回日本微生物生態学会大会
    • Place of Presentation
      京都大学農学部総合館
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Presentation] アンコール遺跡における剥離劣化石材と着色劣化石材の細菌群集構造の比較2011

    • Author(s)
      久住朝子、李賢淑、大須賀雄、大岩祐児、富田新、片山葉子
    • Organizer
      第27回日本微生物生態学会大会
    • Place of Presentation
      京都大学農学部総合館
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Presentation] Siphonobacter sp.THI313株の辛味ダイコン由来チオシアネート配糖体の分解とそれに伴うCOSの生成2011

    • Author(s)
      坂本友希子、関田真奈、高田保孝、片山葉子、芥川一成、千葉一裕
    • Organizer
      第27回日本微生物生態学会大会
    • Place of Presentation
      京都大学農学部総合館
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Book] 環境毒性学2011

    • Author(s)
      片山葉子(分担)
    • Total Pages
      252
    • Publisher
      朝倉書店

URL: 

Published: 2013-06-26  

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