2013 Fiscal Year Annual Research Report
統合ゲノム解析による大腸癌におけるヒストンメチル基転移酵素の機能解析
| Project/Area Number |
23310137
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
古川 洋一 東京大学, 医科学研究所, 教授 (20272560)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山口 貴世志 東京大学, 医科学研究所, 助教 (50466843)
池上 恒雄 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (80396712)
山口 類 東京大学, 医科学研究所, 講師 (90380675)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
|
| Keywords | 疾患関連遺伝子 |
|---|
| Research Abstract |
我々は以前の研究で、ヒストンメチル基転移酵素であるSMYD3が、ヒトの大腸がんや肝細胞がん、乳がんで高頻度に発現上昇していることを報告した。さらに、SMYD3が特定の配列をもつDNA領域に結合し、転写を調節していることを示した。
本研究では、4種類のSMYD3特異的siRNAとcontrol siRNAで処理した大腸がん細胞株を用いた網羅的遺伝子発現解析と、SMYD3特異的抗体を用いたChIP on chip解析を行い、SMYD3が直接制御する下流遺伝子群の同定を試みた。その結果、SMYD3によって有意に発現増加する1543個の遺伝子と、4つのsiRNAのうち3つで共通して発現制御される608個の遺伝子を同定した。これらのデータを用いたgene set enrichment analysisにより、それらの遺伝子を調節する可能性のある126個の転写因子群を見出した。ChIP on chip解析では、SMYD3と結合が示唆される4070か所の候補調節領域を発見し、遺伝子発現解析のデータと合わせた解析により、SMYD3が直接制御する110個の下流候補遺伝子群を同定した。さらにgene ontologyを用いた統合的解析を行い、SMYD3の発現が細胞周期調節に深く関わっていることを見出した。これらの結果は、SMYD3ががん細胞の増殖に重要な役割を演ずることを示すとともに、その機能抑制が有望ながん治療戦略になることを示唆している。
|
| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
-
[Journal Article] Overexpression of cohesion establishment factor DSCC1 through E2F in colorectal cancer.2014
Author(s)
Yamaguchi K, Rui Yamaguchi R, Takahashi N, Ikenoue T, Fujii T, Shinozaki M, Tsurita G, Hata K, Niida A, Imoto S, Miyano S, Nakamura Y, Furukawa Y
-
Journal Title
PLoS ONE
Volume: 9
Pages: e85750
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Wnt3a stimulates maturation of impaired neutrophils developed from severe congenital neutropenia patient-derived pluripotent stem cells.2013
Author(s)
Hiramoto T, Ebihara Y, Mizoguchi Y, Nakamura K, Yamaguchi K, Ueno K, Michizuki S, Yamamoto S, Nagasaki M, Furukawa Y, Tani K, Nakauchi H, Kobayashi M, Tsuji K.
-
Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Volume: 110
Pages: 3023-3028
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Quantitative PCR detection of CEP110-FGFR1 fusion gene in a patient with 8p11 syndrome.2013
Author(s)
Yamamoto S, Ebihara Y, Mochizuki S, Kawakita T, Kato S, Ooi J, Takahashi S, Tojo A, Yusa N, Furukawa Y, Oyaizu N, Watanabe J, Sato K, Kimura F, Tsuji K.
-
Journal Title
Leukemia and Lymphoma
Volume: 54
Pages: 2068-2069
DOI
-
-
-
-
