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2013 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト内在性レトロウイルス発現制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 23310138
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

眞貝 洋一  独立行政法人理化学研究所, 眞貝細胞記憶研究室, 主任研究員 (20211972)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsヒストンリジンメチル化酵素 / SETDB1/ESET / ヒトES細胞
Research Abstract

ヒトのERV (HERV)は、ゲノムの~8%を占めるものの、塩基配列解析の結果からは転移能を持つコピーは存在しないと推察されている。しかし、転写活性のあるコピーはまだいくつも存在し、組織特異的にあるいはがん細胞特異的にHERVsの転写あるいはコードされているタンパク質が検出されており、ヒトの生命機能や病態(特にがん化との関連)におけるHERVsの重要性が示唆されている。本研究では、HERVのエピジェネティックな転写抑制機構の実体を明らかにし、その生物学的重要性を検討する。その第一段階として、SETDB1を条件的に欠損できるヒトES/iPS細胞の樹立を試みてきた。今年度は以下の実験を行った。
これまで、SIGMA社より購入したSETDB1のノックアウトに使うジンクフィンガーヌクレアーゼ (Zinc Finger Nucleases, ZFNs )を用いて、SETDB1のターゲティングを試みてきたが、陽性細胞の検出に至らなかった。そこで、新たな遺伝子破壊の方法として、CRISPR/Cas9とガイドRNAを用いた遺伝子改変技術を導入した。予備実験として、K562細胞を用いて、ノックアウト細胞の樹立が可能であるか検討したところ、目的とする遺伝子領域に有意に変異が誘導されていることが確認された。次に、条件的にSETDB1遺伝子を欠損できるように、loxP配列で挟まれたSETDB1発現ベクターを作成し、それをトランスポゾンベースのベクターに組み込んだ。以上、条件的SETDB1欠損細胞作製の為のプラスミドの調整を完了した。
今後は、これらのプラスミドをヒトiPS細胞に適用することで、目的とする細胞の樹立を開始する。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2013 Other

All Presentation (3 results) Book (2 results)

  • [Presentation] Pericentric heterochromatin generated by HP1 interaction-defective Suv39h12013

    • Author(s)
      Yoichi Shinkai
    • Organizer
      Gordon Research Conference "epigenetics"
    • Place of Presentation
      Bryant University, Smithfield, RI, USA
    • Year and Date
      20130804-09
  • [Presentation] ヒストンリジンメチル化による生命機能制御

    • Author(s)
      眞貝 洋一
    • Organizer
      第56回日本腎臓学会学術総会
    • Place of Presentation
      東京国際フォーラム、 東京
  • [Presentation] マウスLTR因子のエピジェネティック制御と近傍遺伝子への影響

    • Author(s)
      眞貝 洋一
    • Organizer
      国立遺伝学研究所研究集会「転移因子と宿主の相互作用による生命機能」
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所、三島
  • [Book] エピジェネティクス2013

    • Author(s)
      眞貝 洋一
    • Total Pages
      282 (35-47)
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] エピジェネティクスキーワード辞典2013

    • Author(s)
      眞貝 洋一
    • Total Pages
      315 (40-42)
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2015-05-28  

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