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2012 Fiscal Year Annual Research Report

代謝物マススペクトルからの構造推定

Research Project

Project/Area Number 23310143
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

有田 正規  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (10356389)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsマススペクトル / フラグメンテーション / データベース
Research Abstract

マススペクトル重ね合わせアルゴリズムに基づいて、GC-MSの半実験-半理論的スペクトルライブラリ(計測結果に基づくスペクトルを理論的に補正したライブラリ)を構築した。このライブラリと世界標準となっているNISTライブラリを比較し、両者の間に見られる違いを検証している。作成した重ねあわせアルゴリズムが、有効なスペクトル情報を抽出できているか、スペクトルの検索実験を通して検証中である。
MassBank、PRIMe、KNApSAcK等、代表的なメタボロームデータベースにおける代謝物のIDをInChIコードやCAS番号といったIDを手がかりに物質毎にスペクトルをとりまとめた。これらのデータを用いて、統合マススペクトルデータのwikiサイトを構築中である。
LC-ESI-MSの重ねあわせアルゴリズムに先立ち、クロマトピーク評価手法を設計した。特にMultiple reaction monitoring (MRM) 法におけるクロマト情報の統計的評価として溶出時間とピークの高さに加え、ピーク形状およびトランジションにおける高さ比などを考慮した指標を作成し、MRM法において効率よく代謝物を同定できることを示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

予定ではESI-MSnデータにおける重ね合わせアルゴリズムを開発する予定であったが、実現できなかった。

Strategy for Future Research Activity

ESI用の重ね合わせアルゴリズムを開発する。またこれまでに蓄積した成果を論文として発表していく。

  • Research Products

    (1 results)

All 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] MRMPROBS: Data Assessment and Metabolite Identification Tool for Large-scale MRM-based Widely Targeted Metabolomics2013

    • Author(s)
      Tsugawa H, Arita M, Kanazawa M, Ogiwara A, Bamba T, Fukusaki E
    • Journal Title

      Analytical Chemistry

      Volume: accepted Pages: in print

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2014-07-24  

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