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2013 Fiscal Year Annual Research Report

超好熱生物の遺伝情報はどのように守られ、伝達されるのか?

Research Project

Project/Area Number 23310152
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

石野 良純  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (30346837)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 跡見 晴幸  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (90243047)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsアーキア / DNA複製 / DNA修復
Research Abstract

DNA複製開始やフォークの進行にとって重要なGINS複合体をThermococcus kodakaraensis由来のものと、Thermoplasma acidophilum由来のものについて比較解析した。これらのGINSは Mcmヘリカーゼと相互作用をすることが分かったが、さらに RecJ様の配列を有するタンパク質が安定に複合体を形成することも発見した。また、T. acidohilumは Cdc6を二つ有しており、そのうち Cdc6-2がMCMヘリカーゼを促進すること、そしてその促進効果はGINSとの間で相乗的であることと、 DNA上で MCM-GINS-Cdc6-2複合体が、少なくとも一時的に構築されることを合わせて論文原稿を作成した。さらに、超好熱性アーキアのゲノムDNAの安定性を維持するための新規ヌクレアーゼを発見し、PfuExoI, EndoQ というように命名しが、特許出願する(EndoQ は国際出願)とともに、基礎的性質解析と遺伝子工学的試薬としての応用開発研究へ進めた。この酵素の性質をさらに詳細に調べて論文原稿にまとめた。PfuExoI遺伝子の破壊株は比較的容易に単離できたが、endoQは困難を極めた結果、部分破壊株単離に成功したので、その影響を調べる実験を進めている。また、PfuExoI, EndoQ両酵素とも結晶構造解析に成功し、立体構造情報をえることができた。今後のさらなる発展が期待される。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (28 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (22 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Mutations of Asp540 and the domain-connecting residues synergistically enhance Pyrococcus furiosus DNA ligase activity.2014

    • Author(s)
      Tanabe, M., Ishino, S., Ishino, Y., and Nishida, H.
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 588 Pages: 230-235

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.10.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biochemical characterization of endonuclease V from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus.2014

    • Author(s)
      Kiyonari S, Egashira Y, Ishino S, Ishino Y.
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 153 Pages: in press

    • DOI

      10.1093/jb/mvu010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A guanine nucleotide exchange factor for Rab5 proteins is essential for intracellular transport of the proglutelin from the Golgi apparatus to the protein storage vacuole in rice endosperm.2013

    • Author(s)
      Fukuda, M., Wen, L., Satoh-Cruz, M., Kawagoe, Y., Nagamura, Y., Thomas, W., Okita, H., Washida, H., Sugino, A., Ishino, S., Ishino, Y., Ogawa, M., Sunada, M., Ueda, T., and Kumamaru, T.
    • Journal Title

      PlantPhysiol

      Volume: 162 Pages: 663-674

    • DOI

      10.1104/pp.113.217869

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 好熱性アーキアThermoplasma acidophilumにおける複製ヘリカーゼの分岐進化した活性化メカニズム2013

    • Author(s)
      尾木野弘実、石野園子、真柳浩太、大山拓次、白井剛、森川耿右、Haugland Gyri Teien、Birkeland Nils-Kare、神田大輔、石野良純
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] ファンコニ貧血原因タンパク質のFANCMに存在する長鎖天然変性領域の機能解析~MDC1-BRCTドメインの調製法の検討~2013

    • Author(s)
      山上 健、石野園子、石野良純
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来3′→5′エキソヌクレアーゼの生化学的解析2013

    • Author(s)
      石野園子、當利和夫、濱砂孝文、山上健、宮園健一、田之倉 優、石野良純
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] 複製フォークの停止修復に関わるHefタンパク質に見られる天然変性領域の機能解析2013

    • Author(s)
      石野 園子、山上 健、冨田 宏矢、金井 保、跡見 晴幸、石野 良純
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20131203-20131206
  • [Presentation] 超好熱性アーキア由来エキソヌクレアーゼの解析2013

    • Author(s)
      石野園子、當利和夫、濵砂孝文、山上健、宮園健一、田之倉優、冨田宏矢、金井保、跡見晴幸、石野良純
    • Organizer
      第14回極限環境生物学会
    • Place of Presentation
      明治大学、東京
    • Year and Date
      20131026-20131027
  • [Presentation] 超好熱性アーキアから発見された新規のヌクレアーゼについて2013

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      第2回 食品薬品生物構造学研究会
    • Place of Presentation
      御殿場高原時之栖、御殿場
    • Year and Date
      20131003-20131004
    • Invited
  • [Presentation] Structural and functional analyses of the archaeal Hef protein involved in stalled replication fork repair.2013

    • Author(s)
      Yoshizumi Ishino
    • Organizer
      Thermophiles 2013
    • Place of Presentation
      Regensburg, Germany
    • Year and Date
      20130908-20130913
    • Invited
  • [Presentation] Activation mechanism of the replicative helicase in the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum.2013

    • Author(s)
      Hiromi Ogino, Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Takuji Oyama, Tsuyoshi Shirai, Kosuke Morikawa, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, and Yoshizumi Ishino
    • Organizer
      Thermophiles 2013
    • Place of Presentation
      Regensburg, Germany
    • Year and Date
      20130908-20130913
  • [Presentation] Analysis of the single-strand-specific 3′-5′ exonuclease found in Thermococci.2013

    • Author(s)
      Sonoko Ishino, Kazuo Tori, Takafumi Hamasuna, Takeshi Yamagami, Ken-Ichi Miyazono, Masaru Tanokura, and Yoshizumi Ishino
    • Organizer
      Thermophiles 2013
    • Place of Presentation
      Regensburg, Germany
    • Year and Date
      20130908-20130913
  • [Presentation] 高速・高効率PCRを目指したDNAポリメラーゼの創製2013

    • Author(s)
      恒川冴恵、石野園子、山上健、石野良純
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      県立広島大学、広島
    • Year and Date
      20130905-20130906
  • [Presentation] Pyrococcus furiosus由来Exo Iのホモ三量体形成と活性の関係2013

    • Author(s)
      濵砂孝文、石野園子、山上健、宮園健一、田之倉優、石野良純
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      県立広島大学、広島
    • Year and Date
      20130905-20130906
  • [Presentation] アーキアの損傷塩基修復酵素Endonulease Qの活性に関わるアミノ酸残基の同定2013

    • Author(s)
      牧田成人、白石都、石野園子、山上健、石野良純
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部合同大会
    • Place of Presentation
      県立広島大学、広島
    • Year and Date
      20130905-20130906
  • [Presentation] Identification and Characterization of a Repair Protein, Endonuclease Q found in Archaea2013

    • Author(s)
      Yoshizumi Ishino
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Archaea: Ecology, Metabolism & Molecular Biology 2013
    • Place of Presentation
      Barga, Italy
    • Year and Date
      20130728-20130802
    • Invited
  • [Presentation] アーキアに見出された損傷塩基修復酵素 Endonuclease Qの特性2013

    • Author(s)
      白石都、石野園子、牧田成人、江頭由里子、清成信一、山上健、石野良純
    • Organizer
      日本Archaea研究会第26回講演会
    • Place of Presentation
      東京工業大学、東京
    • Year and Date
      20130719-20130720
  • [Presentation] 好酸性好熱性アーキアMetallosphaera sedula TA-2株の脂質構造解析2013

    • Author(s)
      高島夏希、小寺義男、新津隆士、中村和生、須貝昭彦、伊藤佑子
    • Organizer
      日本Archaea研究会第26回講演会
    • Place of Presentation
      東京工業大学、東京
    • Year and Date
      20130719-20130720
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyrococcus furiosusから同定された新規な修復エンドヌクレアーゼ2013

    • Author(s)
      白石 都、石野園子、牧田成人、江頭由里子、清成信一、山上 健、石野良純
    • Organizer
      第13回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館、鳥取
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyrococcus furiosusより見出された一本鎖特異的3′-5′エキソヌクレアーゼ2013

    • Author(s)
      石野園子 當利和夫 濵砂孝文 清成信一 田原沙樹 山上健 宮園 健一 田之倉 優 石野良純
    • Organizer
      第13回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館、鳥取
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Presentation] 未培養アーキアCaldiarchaeum subterraneumのDNAポリメラーゼの特性2013

    • Author(s)
      石野園子、Jacqueline Buttiker、山上健、輿貴文、布浦拓郎、高木善弘、高見英人、高井研、岩井成憲、石野良純
    • Organizer
      第13回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      とりぎん文化会館、鳥取
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Presentation] 赤潮発生予測技術開発を目指した海洋微生物のメタゲノム解析2013

    • Author(s)
      南雲吉代、金田敏枝、石野園子、山上 健、森 一樹、 田代康介、久原 哲、島崎洋平、 大嶋雄治、 石野良純
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州 国際会議場、北九州
    • Year and Date
      20130530-20130601
  • [Presentation] 環境モニタリングを目的とした海洋微生物メタゲノム解析のためのDNA抽出法の確立2013

    • Author(s)
      金田敏枝、南雲吉代、坂見知子、桑田晃、石野良純
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州 国際会議場、北九州
    • Year and Date
      20130530-20130601
  • [Presentation] アーキアの損傷塩基除去修復に関わる新規酵素の発見2013

    • Author(s)
      白石 都、石野園子、牧田成人、江頭由里子、清成信一、山上 健、石野良純
    • Organizer
      平成25年度日本生化学会九州支部例会(佐賀大会)
    • Place of Presentation
      佐賀大学、佐賀
    • Year and Date
      20130518-20130519
  • [Presentation] 超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来新規3′-5′エキソヌクレアーゼの解析2013

    • Author(s)
      石野園子、當利和夫、濵砂孝文、清成信一、田原沙樹、山上健、宮園健一、田之倉優、石野良純
    • Organizer
      平成25年度日本生化学会九州支部例会(佐賀大会)
    • Place of Presentation
      佐賀大学、佐賀
    • Year and Date
      20130518-20130519
  • [Book] 生物工学よもやま話2013

    • Author(s)
      石野良純
    • Total Pages
      340
    • Publisher
      学進出版
  • [Remarks] 九州大学 蛋白質化学工学分野ホームページ

    • URL

      http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/pce-web/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] Novel DNA cleavage enzyme2013

    • Inventor(s)
      Ishino Y. Ishino S. Shiraishi M.
    • Industrial Property Rights Holder
      九州大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      61/821866
    • Filing Date
      2013-05-10
    • Overseas

URL: 

Published: 2015-05-28  

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